| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 85,835 | T→A | 5.5% | intergenic (+854/‑166) | nikE_1 → / → copB | Nickel import ATP‑binding protein NikE/Copper‑exporting P‑type ATPase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 85,835 | 0 | T | A | 5.5% | 785.7 / 23.2 | 234 | intergenic (+854/‑166) | nikE_1/copB | Nickel import ATP‑binding protein NikE/Copper‑exporting P‑type ATPase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (110/111); new base A (9/4); total (119/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
ATATTAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAATCGAAA > USA300TCH1516_ALE/85745‑85925 | atatTAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACAt < 2:2792778/91‑1 (MQ=255) atTAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTg > 1:1380237/1‑91 (MQ=255) ttAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGt > 2:35195/1‑91 (MQ=255) ttAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGt < 1:2772730/91‑1 (MQ=255) ttAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGt > 2:3218022/1‑91 (MQ=255) ttAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGt < 1:3732552/91‑1 (MQ=255) tAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGtt > 2:1162235/1‑91 (MQ=255) tAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGtt > 1:3765487/1‑91 (MQ=255) aaTATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGttt < 2:746962/91‑1 (MQ=255) atatatGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGtttt > 2:3655562/1‑91 (MQ=255) tatatGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTa > 2:2581011/1‑91 (MQ=255) tatatGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTa < 1:1873686/91‑1 (MQ=255) atatGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTGGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTaa > 1:2697725/1‑91 (MQ=255) aCTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATc < 1:3412937/91‑1 (MQ=255) cTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCg < 1:697820/91‑1 (MQ=255) cTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCg > 1:2151040/1‑91 (MQ=255) ttGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGa > 2:2137615/1‑91 (MQ=255) tgtgTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGAt < 2:3490838/91‑1 (MQ=255) gtTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGAc > 2:1028885/1‑91 (MQ=255) gtTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGAc > 1:3294759/1‑91 (MQ=255) gtTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGAc > 2:2885092/1‑91 (MQ=255) gtTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTCTTAAATATCGATGAc > 1:2189370/1‑91 (MQ=255) ttGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACa < 1:1374349/91‑1 (MQ=255) ggTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAg < 1:3814803/91‑1 (MQ=255) ggTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAg > 1:1023992/1‑91 (MQ=255) ggTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAg > 2:1372966/1‑91 (MQ=255) tAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATTGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGAGAAGGt > 1:3614695/1‑91 (MQ=255) tAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGt > 2:640684/1‑91 (MQ=255) aTGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAat < 1:122067/75‑1 (MQ=255) aTGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCt < 2:1210797/91‑1 (MQ=255) tGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTa > 2:1556033/1‑91 (MQ=255) aaCCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGt < 1:870118/91‑1 (MQ=255) aaCCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGt < 2:1926110/91‑1 (MQ=255) aaCCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGt < 2:3148602/91‑1 (MQ=255) aCCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTa < 2:2697098/91‑1 (MQ=255) aCCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTa < 1:3398271/91‑1 (MQ=255) aCCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTa > 1:580703/1‑91 (MQ=255) aCCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGAAAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTGTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTa < 2:3420662/91‑1 (MQ=255) cTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAgg > 1:3387978/1‑91 (MQ=255) cTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAgg < 1:1529388/91‑1 (MQ=255) cTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAgg < 2:2065496/91‑1 (MQ=255) cTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAgg < 1:2339293/91‑1 (MQ=255) ttGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACACGGTCTAACGCAggc > 2:3795945/1‑90 (MQ=255) ttGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGa < 2:1900017/91‑1 (MQ=255) ttGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGa < 1:3439701/91‑1 (MQ=255) tGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGAc > 2:3250289/1‑91 (MQ=255) ggTTAGAGTGTAATGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACg > 1:2990672/1‑91 (MQ=255) ggTTAGAGAGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACg > 1:2058334/1‑91 (MQ=255) gTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACgt > 2:495212/1‑91 (MQ=255) gTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACgt > 2:2629886/1‑91 (MQ=255) tAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACgtgt < 1:1491808/91‑1 (MQ=255) agTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGa > 1:1109848/1‑91 (MQ=255) gtgtATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGat > 1:2250359/1‑91 (MQ=255) gtgtATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTGTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGat < 2:903367/91‑1 (MQ=255) gtATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGatat < 1:3188277/91‑1 (MQ=255) gtATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGatat > 2:577900/1‑91 (MQ=255) tATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGAtata > 2:2814081/1‑91 (MQ=255) aTTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATaa > 2:126458/1‑91 (MQ=255) aTTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATaa < 1:1463715/91‑1 (MQ=255) gTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGt > 2:3877315/1‑91 (MQ=255) gTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGt < 1:904228/91‑1 (MQ=255) gTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGt < 1:638825/91‑1 (MQ=255) tCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGtt > 1:1061780/1‑91 (MQ=255) tCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGtt > 2:332052/1‑91 (MQ=255) tCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGtt < 2:1469399/91‑1 (MQ=255) tCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGtt < 2:1442210/91‑1 (MQ=255) cATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTc > 2:1151330/1‑91 (MQ=255) aTGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCg > 1:2417345/1‑91 (MQ=255) aTGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCg < 1:2599408/91‑1 (MQ=255) gtgATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGa > 1:776561/1‑91 (MQ=255) gATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAAt < 1:332052/91‑1 (MQ=255) aTAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAAtt > 2:407711/1‑91 (MQ=255) aTAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAAtt > 1:2824242/1‑91 (MQ=255) tAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATta > 2:2316663/1‑91 (MQ=255) aGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAg > 1:2320322/1‑72 (MQ=255) aGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATaaa > 1:1550357/1‑91 (MQ=255) gATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAAt > 2:1512632/1‑91 (MQ=255) gATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAAt < 2:3765487/91‑1 (MQ=255) aTTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATc < 1:3024702/91‑1 (MQ=255) ttAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATcc < 2:1112000/91‑1 (MQ=255) aGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCAt > 2:562588/1‑91 (MQ=255) aGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCAt > 2:132289/1‑91 (MQ=255) gATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATa > 2:1586025/1‑91 (MQ=255) tttAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAgg < 2:2417345/91‑1 (MQ=255) ttaattaaAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGga > 1:1889637/1‑91 (MQ=255) aattaaAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGgaga < 2:1062219/91‑1 (MQ=255) taaAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATaa < 1:3463062/91‑1 (MQ=255) taaAACAATGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATaa > 2:1492823/1‑91 (MQ=255) aaaaCAATGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATaaa > 2:1145439/1‑91 (MQ=255) aaaCATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAAt < 2:1747049/91‑1 (MQ=255) aaaCATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAAt < 2:841806/91‑1 (MQ=255) aaaCATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAAt < 2:842768/91‑1 (MQ=255) aaaCATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAAt < 2:2782894/91‑1 (MQ=255) aaaCAATGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAAt > 1:2128718/1‑91 (MQ=255) aaCATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAATc > 1:3540011/1‑91 (MQ=255) aaCATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAATc < 2:1380237/91‑1 (MQ=255) aCATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAATCg < 1:403565/91‑1 (MQ=255) aCATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAATCg < 2:1097632/91‑1 (MQ=255) ttGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAATCGaaa > 1:2516134/1‑91 (MQ=255) ttGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAATCGaaa > 2:2378849/1‑91 (MQ=255) | ATATTAATATATGACTTGTGTTGGTAATGATAACCTTGGTTAGAGTGTATTGTCATGTGATAGTTAAGATTAGATCTTTTAATTAAAACATTGTTTTAAATATCGATGACAAGGTCTAATGTAGGACGTGTAGATATAAGGTTCGGAATTATATAAATCCATAAAAGGAGATAAATCGAAA > USA300TCH1516_ALE/85745‑85925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |