| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,685,149 | T→A | 7.1% | intergenic (‑161/+59) | USA300HOU_RS08395 ← / ← rpsU | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,685,149 | 0 | T | A | 7.1% | 596.1 / 24.6 | 182 | intergenic (‑161/+59) | USA300HOU_RS08395/rpsU | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (88/81); new base A (8/5); total (96/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ATATCAATTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGCAGCTTCTG > USA300TCH1516_ALE/1685059‑1685239 | atatCAATTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACt < 1:2196352/91‑1 (MQ=255) tatCAATTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACtt > 1:2200398/1‑91 (MQ=255) tCAATTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTtgt > 2:2377465/1‑91 (MQ=255) tCAATTTGACTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTtgt < 1:3711886/91‑1 (MQ=255) tCAATTTGACTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTtgt > 1:1955380/1‑91 (MQ=255) cAATTTGATTATTTATAAACTATATAACGTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTtgtg < 1:82816/91‑1 (MQ=255) aaTTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGa > 2:184032/1‑91 (MQ=255) aaTTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGa < 2:2686234/91‑1 (MQ=255) aTTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAt > 2:2452031/1‑91 (MQ=255) aTTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAt < 1:1973016/91‑1 (MQ=255) tttGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAtg > 2:1078387/1‑91 (MQ=255) ttGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAtgt > 1:2646473/1‑91 (MQ=255) ttGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAtgt > 1:1103001/1‑91 (MQ=255) ttGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACAAGTTAGTGTCTGACACTAATATGTGAtgt < 2:1621450/91‑1 (MQ=21) ataattattTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAtgt < 1:257267/88‑1 (MQ=255) tGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAtgtt < 1:2484165/91‑1 (MQ=255) attattTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAtgtttg > 2:2201339/1‑91 (MQ=255) tatttatAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAACAAACATCACAAGTTAGTGTCTGACACTAATATGTGAtgtttttt < 2:3031866/91‑4 (MQ=17) tatttatAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAACAAACATCACAAGTTAGTGTCTGACACTAATATGTGAtgtttttt < 2:2371864/91‑4 (MQ=17) tatttatAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAtgtttgtt < 2:100752/91‑1 (MQ=255) tatttatAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGAtgtttgtt > 1:424290/1‑91 (MQ=255) ttatAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTta < 1:3520068/91‑1 (MQ=255) ataAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACAAGTTAGTGTCTGACACTAATATGTGATgtttttttgttg < 1:2887705/91‑5 (MQ=17) taAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTtatat < 2:2271397/91‑1 (MQ=255) aaaCTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTtatata > 1:1028962/1‑91 (MQ=255) aaaCTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTtatata > 2:3630612/1‑91 (MQ=255) aCTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATAtaat > 2:3689631/1‑91 (MQ=255) aCTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATAtaat > 2:3689793/1‑91 (MQ=255) cTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATAtaatt < 2:2865002/91‑1 (MQ=255) cTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATAtaatt > 1:959862/1‑91 (MQ=255) atataACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATAtaattaa < 2:1058499/91‑1 (MQ=255) tataACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATAtaattaat < 2:1758067/91‑1 (MQ=255) tataACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATAtaattaat < 1:2367910/91‑1 (MQ=255) ataACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAata > 1:3189337/1‑91 (MQ=255) aaCTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATAtt < 1:3759663/91‑1 (MQ=255) tttttttAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCgt > 1:2492539/1‑91 (MQ=255) tttttttAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCgt < 2:690710/91‑1 (MQ=255) ttttttAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCgtg > 1:1555053/1‑91 (MQ=255) tttttAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCgtgt < 2:731145/91‑1 (MQ=255) ttaattaaAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGa < 2:672020/91‑1 (MQ=255) ttaattaaAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGa > 1:1423821/1‑91 (MQ=255) taattaaAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAg > 2:2745943/1‑91 (MQ=255) attaaAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGactc < 1:1518933/91‑4 (MQ=255) attaaAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAggg < 2:153674/91‑1 (MQ=255) attaaAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAggg > 1:549567/1‑91 (MQ=255) ttaaAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGa > 1:3318758/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGt < 2:179959/91‑1 (MQ=255) ttGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACa < 2:200169/91‑1 (MQ=255) tGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACag < 1:3646827/91‑1 (MQ=255) gACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACaga > 1:3402684/1‑91 (MQ=255) gACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACaga > 1:3401826/1‑91 (MQ=255) acaacaAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACagag < 1:2412331/91‑1 (MQ=255) caacaaAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAgg > 1:351905/1‑91 (MQ=255) aacaaAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCGACAGAGGt > 2:943697/1‑91 (MQ=255) acaaAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTa > 1:2512042/1‑91 (MQ=255) acaaAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTa > 2:2852698/1‑91 (MQ=255) caaAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTat < 2:211369/91‑1 (MQ=255) aacaaaCATCACAAGTTAGTGTCTGACACTAATATGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTatta > 2:3477440/4‑91 (MQ=18) aaaaaaCATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTatta < 1:2243172/91‑1 (MQ=255) aaaCATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTattaatt > 2:112340/1‑91 (MQ=255) aaaCATCACAACTTAGTGCCACACACTAACTTGTGACGATTGTTCTATATAAGTAATATTCGTGTTGAGGGAGGCAACAGAGGTattaatt > 2:3275759/1‑91 (MQ=255) cATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAattatt < 1:243586/91‑1 (MQ=255) cATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAattatt < 1:169656/91‑1 (MQ=255) cATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAattatt < 1:3401009/91‑1 (MQ=255) cATCACAAGTTAGTGTCTGACACTAATATGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAattatt > 2:3007986/1‑91 (MQ=21) tCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTg > 1:1595153/1‑91 (MQ=255) tCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTg > 2:2854926/1‑91 (MQ=255) tCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTg > 1:2149400/1‑91 (MQ=255) tCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTg > 2:1042001/1‑91 (MQ=255) cacaTATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGa > 2:3798167/1‑91 (MQ=255) acaTATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGaa < 2:1888294/91‑1 (MQ=255) acaTATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGaa < 2:2627262/91‑1 (MQ=255) caagttAGTGTCTGACACTAATATGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAt > 2:1195865/5‑91 (MQ=37) caagttAGTGTCTGACACTAATATGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAt > 1:2538557/5‑91 (MQ=37) caTATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAt < 2:2797635/91‑1 (MQ=255) atatTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtt < 2:512812/91‑1 (MQ=255) atatTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtt < 1:772784/91‑1 (MQ=255) gttAGTGTCTGACACTAATATGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTTAACAGAGGTATTATTTATTTGAAttta > 2:2475829/2‑91 (MQ=37) ttAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttac < 1:1022267/91‑1 (MQ=255) tAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttacg < 1:3832775/91‑1 (MQ=255) tAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttacg > 1:3542647/1‑91 (MQ=255) aGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttacgt < 1:3417153/91‑1 (MQ=255) tgtCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttatgttt < 1:3782131/91‑1 (MQ=255) gtCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttacgttta > 1:2705389/1‑91 (MQ=255) tctgACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttacgtttac > 1:1204641/4‑91 (MQ=255) tCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACCGAGGTATTAATTATTTGAAtttacgtttac > 1:593275/1‑91 (MQ=255) tCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttacgtttac < 1:428333/91‑1 (MQ=255) cAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAAtttacgtttacg < 2:2938585/91‑1 (MQ=255) aGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATttacgtttacgt > 1:309008/1‑91 (MQ=255) aGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATttacgtttacgt > 1:1833643/1‑91 (MQ=255) aGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATttacgtttacgt > 2:1400111/1‑91 (MQ=255) aGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATttacgtttacgt > 1:820568/1‑91 (MQ=255) aGACACTAACTCGTGATGTTTGTGTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATttacgtttacgt < 2:2963836/91‑1 (MQ=255) acacTAGCTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGc < 1:3816698/91‑1 (MQ=255) acacTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGc > 1:1846293/1‑91 (MQ=255) cacTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGCa > 2:450022/1‑91 (MQ=255) cacTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGCa < 1:2326578/91‑1 (MQ=255) acTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGCAg > 2:144918/1‑91 (MQ=255) cTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGCAGc > 1:665580/1‑91 (MQ=255) aaCTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGCAGCtt > 1:1958137/1‑91 (MQ=255) | ATATCAATTTGATTATTTATAAACTATATAACTTTTTTTAATTAAAAATTGACAACAAAAAAACATCACATATTAGTGTCAGACACTAACTTGTGATGTTTGTTTTATATAATTAATATTCGTGTTGAGGGAGTCAACAGAGGTATTAATTATTTGAATTTACGTTTACGTGCAGCTTCTG > USA300TCH1516_ALE/1685059‑1685239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |