| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,722,313 | G→A | 7.8% | Q3* (CAA→TAA) | yrrK ← | Putative pre‑16S rRNA nuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,722,313 | 0 | G | A | 7.8% | 644.1 / 30.7 | 207 | Q3* (CAA→TAA) | yrrK | Putative pre‑16S rRNA nuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (97/93); new base A (4/12); total (102/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
TGTCTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGATTTCT > USA300TCH1516_ALE/1722223‑1722403 | tCTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTa < 2:3725571/91‑1 (MQ=255) cTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTaa > 1:2516109/1‑91 (MQ=255) cTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTaa > 1:2771865/1‑91 (MQ=255) cTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTaa > 2:2674775/1‑91 (MQ=255) cTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTaa > 1:1766334/1‑91 (MQ=255) cTAATCCATGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTaa < 2:3454968/91‑1 (MQ=255) tAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAAc < 2:1717837/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 1:2487109/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 1:3391880/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 2:1877058/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 2:3339245/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 1:1050828/91‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATaaa > 1:714599/1‑91 (MQ=255) tgtgCCGTCCAGCCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATaaaat < 1:3518774/91‑3 (MQ=255) tgtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATaaa > 2:127975/1‑89 (MQ=255) tgtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatt > 1:919663/1‑91 (MQ=255) tgtgCCGTCCAACCCA‑TATATCCCCAATTGCCATTCCCACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTTACATAAattt > 1:1001620/1‑90 (MQ=255) gtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatta > 2:2249548/1‑91 (MQ=255) gtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatta < 2:2879012/91‑1 (MQ=255) gtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatta > 1:744518/1‑91 (MQ=255) ccGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAAttattt > 2:803484/1‑91 (MQ=255) ccGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAAttattt > 1:2115879/1‑91 (MQ=255) cGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAAttattta < 1:2139141/91‑1 (MQ=255) tCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATtatttatt < 2:1011386/91‑1 (MQ=255) tCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATtatttatt > 2:1215894/1‑91 (MQ=255) ccAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTatttattt < 1:2323709/91‑1 (MQ=255) ccAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTatttattt < 1:3682491/91‑1 (MQ=255) cccATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGct > 1:2839204/1‑91 (MQ=255) ccATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGctc < 1:2596637/91‑1 (MQ=255) cATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGctct < 2:1438465/91‑1 (MQ=255) aTTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCtt > 1:2864680/1‑91 (MQ=255) ttATATCACTAATTGTAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTCACATAAATTATTTATTTTGCTCttt > 1:3627950/1‑91 (MQ=255) tataTCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCtttt < 2:3583919/91‑1 (MQ=255) tataTCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCtttt < 2:1662716/91‑1 (MQ=255) atatCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTa < 1:3142816/91‑1 (MQ=255) atatCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTa < 1:1216939/91‑1 (MQ=255) atCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTaaa > 2:2771338/1‑91 (MQ=255) tCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAAt < 2:3871072/91‑1 (MQ=255) aCTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAg > 1:3752672/1‑91 (MQ=255) cTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTCTTTTGCTCTTTTAAATAGt > 2:2204990/1‑91 (MQ=255) cTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGt < 1:1864251/91‑1 (MQ=255) cTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGt > 2:3879756/1‑91 (MQ=255) aaTTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTaa < 1:1707964/91‑1 (MQ=255) aaTTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTaa < 2:1088207/91‑1 (MQ=255) aaTTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTaa < 2:3675504/91‑1 (MQ=255) aaTTGCAAGTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTaa < 2:2937456/91‑1 (MQ=255) ttGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGa > 1:166081/1‑91 (MQ=255) ttGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGa > 1:2462978/1‑91 (MQ=255) ttGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGa > 1:2464091/1‑91 (MQ=255) gCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGaaa < 1:2229399/91‑1 (MQ=255) cAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAAc > 2:1658146/1‑91 (MQ=255) atttCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACa > 1:2082251/3‑91 (MQ=255) aaTTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACa < 1:58864/91‑1 (MQ=255) aaTTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACa < 1:1809107/91‑1 (MQ=255) aaTTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATGTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACa < 1:3500148/91‑1 (MQ=255) aTTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACaa > 1:258010/1‑91 (MQ=255) aTTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACaa < 1:1330692/91‑1 (MQ=255) ttCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAg > 2:2702912/1‑91 (MQ=255) ttCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAg < 1:321093/91‑1 (MQ=255) ccTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTCATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGct < 2:3804259/91‑1 (MQ=255) aCCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCtt > 1:1474744/1‑91 (MQ=255) ccGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTc > 1:1164308/1‑91 (MQ=255) gTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCa > 2:243362/1‑91 (MQ=255) ttCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCat < 1:1580811/91‑1 (MQ=255) ttCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCat < 2:2043596/91‑1 (MQ=255) tCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCata < 2:512087/91‑1 (MQ=255) tCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCata < 1:634343/91‑1 (MQ=255) ctactaCCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCataa > 1:1038960/1‑91 (MQ=255) ctactaCCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCataa < 2:1292906/91‑1 (MQ=255) actacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCataata > 2:698873/1‑91 (MQ=255) actacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCataata > 2:698712/1‑91 (MQ=255) ctacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCAtaataa < 1:553651/91‑1 (MQ=255) ctacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCAtaataa < 2:3223075/91‑1 (MQ=255) tacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAAc < 1:2928741/91‑1 (MQ=255) tacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAAc > 2:2373481/1‑91 (MQ=255) acCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACa > 2:1982188/1‑91 (MQ=255) ccGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAt > 2:370679/1‑91 (MQ=255) cGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAtc < 1:991443/91‑1 (MQ=255) aCATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAtctc > 1:378405/1‑91 (MQ=255) aCATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAtctc < 2:2398410/91‑1 (MQ=255) aTCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTa > 2:1752654/1‑91 (MQ=255) tCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTAt < 1:252438/91‑1 (MQ=255) cGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTAtt > 2:1048912/1‑90 (MQ=255) gAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCa < 1:502997/91‑1 (MQ=255) aGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCaa > 1:3774936/1‑91 (MQ=255) aGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCaa > 2:2314466/1‑91 (MQ=255) gTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGc < 1:3867150/65‑1 (MQ=255) gTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAat > 1:3006196/1‑91 (MQ=255) gTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAat > 1:44818/1‑91 (MQ=255) ccTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAGTAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAatat < 2:2995826/91‑1 (MQ=255) taatttATGTTACAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGa > 1:495170/4‑91 (MQ=255) aatttATGTTACAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGaa > 2:2569068/3‑91 (MQ=255) aTTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGaa < 2:1137485/91‑1 (MQ=255) tttATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAAtt < 1:2429405/91‑1 (MQ=255) tttATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAAtt > 1:719422/1‑91 (MQ=255) tttATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAAtt < 1:429654/91‑1 (MQ=255) ttATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAAttt < 2:2839204/91‑1 (MQ=255) tATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTg < 2:575518/91‑1 (MQ=255) tgttgtAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGAt > 1:2666271/1‑91 (MQ=255) gttgtAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGAtt < 2:1782220/91‑1 (MQ=255) | TGTCTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGATTTCT > USA300TCH1516_ALE/1722223‑1722403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |