| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,722,314 | T→C | 7.7% | L2L (TTA→TTG) | yrrK ← | Putative pre‑16S rRNA nuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,722,314 | 0 | T | C | 7.7% | 624.2 / 33.0 | 207 | L2L (TTA→TTG) | yrrK | Putative pre‑16S rRNA nuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (98/93); new base C (4/12); total (102/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TCTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGATTTCTT > USA300TCH1516_ALE/1722225‑1722404 | tCTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTa < 2:3725571/91‑1 (MQ=255) cTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTaa > 1:1766334/1‑91 (MQ=255) cTAATCCATGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTaa < 2:3454968/91‑1 (MQ=255) tAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAAc < 2:2097953/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 2:1877058/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 1:1050828/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 1:670396/91‑1 (MQ=255) tCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATa < 1:2487109/91‑1 (MQ=255) tgtgCCGTCCAGCCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTACAACATaaaat < 1:3518452/91‑3 (MQ=255) tgtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATaaa > 2:127975/1‑89 (MQ=255) tgtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatt > 2:2018661/1‑91 (MQ=255) tgtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatt > 1:919663/1‑91 (MQ=255) tgtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatt > 1:2841291/1‑91 (MQ=255) tgtgCCGTCCAACCCA‑TATATCCCCAATTGCCATTCCCACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTTACATAAattt > 1:1001620/1‑90 (MQ=255) gtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatta > 1:744518/1‑91 (MQ=255) gtgCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAatta < 2:2879012/91‑1 (MQ=255) ccGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAAttattt > 2:803484/1‑91 (MQ=255) ccGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAAttattt > 1:96522/1‑91 (MQ=255) ccGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAAttattt > 1:2115879/1‑91 (MQ=255) tCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATtatttatt > 2:1215894/1‑91 (MQ=255) ccAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTatttattt < 1:2323709/91‑1 (MQ=255) ccAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTatttattt > 1:3773498/1‑91 (MQ=255) ccAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTatttattt < 1:3682491/91‑1 (MQ=255) cAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTAtttt < 1:608006/91‑1 (MQ=255) ccATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGctc < 2:2576319/91‑1 (MQ=255) cATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGctct < 2:1438481/91‑1 (MQ=255) ttATATCACTAATTGTAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTCACATAAATTATTTATTTTGCTCttt > 1:3627950/1‑91 (MQ=255) tataTCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCtttt < 2:3583919/91‑1 (MQ=255) tataTCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCtttt < 2:1662247/91‑1 (MQ=255) atatCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTa < 1:1216939/91‑1 (MQ=255) atCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTaaa > 2:108763/1‑91 (MQ=255) atCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTaaa > 2:2771338/1‑91 (MQ=255) tCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAAt < 2:3871072/91‑1 (MQ=255) tCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAAt < 1:2760515/91‑1 (MQ=255) cACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTGTGCTCTTTTAAATa < 2:3293809/91‑1 (MQ=255) aCTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAg < 1:2564416/91‑1 (MQ=255) cTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGt < 1:1864251/91‑1 (MQ=255) cTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGt > 2:3879756/1‑91 (MQ=255) aaTTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTaa < 1:1707964/91‑1 (MQ=255) aaTTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTaa < 2:3675504/91‑1 (MQ=255) aaTTGCAAGTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTaa < 2:2937456/91‑1 (MQ=255) aTTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTACAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAg > 2:3190807/1‑91 (MQ=255) ttGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGa > 1:2462978/1‑91 (MQ=255) ttGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGa > 1:2464091/1‑91 (MQ=255) ttGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGa > 1:166081/1‑91 (MQ=255) ttGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGa < 2:1359024/91‑1 (MQ=255) tGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCtt > 2:250091/1‑77 (MQ=255) tGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGaa > 1:283675/1‑91 (MQ=255) gCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGaaa < 1:2229399/91‑1 (MQ=255) cAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAAc < 1:992487/91‑1 (MQ=255) atttCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACa > 1:2082251/3‑91 (MQ=255) aaTTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACa < 1:1809107/91‑1 (MQ=255) aTTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACaa > 1:258647/1‑91 (MQ=255) aTTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACaa < 1:1330692/91‑1 (MQ=255) tCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGc < 2:2244506/91‑1 (MQ=255) ccTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTCATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGct < 2:3804259/91‑1 (MQ=255) aCCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCtt > 1:1474744/1‑91 (MQ=255) ccGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTc > 1:2995826/1‑91 (MQ=255) ccGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTc > 1:1164308/1‑91 (MQ=255) ccGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTc > 1:2517914/1‑91 (MQ=255) cGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTcc > 1:3182150/1‑91 (MQ=255) cGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCGTcc > 1:3139149/1‑91 (MQ=255) gTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCa > 2:243362/1‑91 (MQ=255) ttCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCat < 1:1580811/91‑1 (MQ=255) tCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCata < 2:512087/91‑1 (MQ=255) ctactaCCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCataa > 1:1038960/1‑91 (MQ=255) ctactaCCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCataa < 2:1292906/91‑1 (MQ=255) actacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCataata > 2:698712/1‑91 (MQ=255) actacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCataata > 2:698873/1‑91 (MQ=255) ctacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCAtaataa < 1:554034/91‑1 (MQ=255) tacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAAc < 1:2928741/91‑1 (MQ=255) tacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAAc > 2:1104028/1‑91 (MQ=255) tacCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAAc > 2:2373481/1‑91 (MQ=255) acCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACa < 1:39997/91‑1 (MQ=255) acCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACa > 2:1982188/1‑91 (MQ=255) ccGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAt < 2:1686805/91‑1 (MQ=255) ccGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAt > 2:370679/1‑91 (MQ=255) cGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAtc < 2:2698298/91‑1 (MQ=255) aCATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAtctc < 2:2398410/91‑1 (MQ=255) aCATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACAtctc > 1:378156/1‑91 (MQ=255) aTCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTa > 2:1752654/1‑91 (MQ=255) cGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATc > 2:1048865/1‑91 (MQ=255) gAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCa < 1:502997/91‑1 (MQ=255) aGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCaa > 2:2314466/1‑91 (MQ=255) gTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAat > 1:44818/1‑91 (MQ=255) ccTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAGTAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAatat < 2:2995826/91‑1 (MQ=255) ataatttATGTTACAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACg > 1:3464189/5‑91 (MQ=255) aaaTTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACg > 1:54370/1‑91 (MQ=255) taatttATGTTACAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCCATATGACGa > 1:3713571/4‑91 (MQ=255) taatttATGTTACAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGa > 1:495170/4‑91 (MQ=255) tttATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAAtt < 1:2429405/91‑1 (MQ=255) tttATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAAtt > 1:719422/1‑91 (MQ=255) ttATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAAttt < 1:3810486/91‑1 (MQ=255) ttATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAAttt < 2:2839204/91‑1 (MQ=255) tATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTg < 2:575518/91‑1 (MQ=255) tATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTg > 1:2140388/1‑91 (MQ=255) tgttgtAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGAt > 1:2664101/1‑91 (MQ=255) gttgtAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGAtt < 2:1782220/91‑1 (MQ=255) gtAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGATTTCt > 1:3244188/1‑91 (MQ=255) tAACATAAATTATATATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTGCCGTAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGATTTCtt > 2:3409662/1‑91 (MQ=255) | TCTAATCCTTGTGCCGTCCAACCCATTATATCACTAATTGCAATTCCTACCGTTCTACTACCGACATCGAGTCCTAAAATTTTATGTTGTAACATAAATTATTTATTTTGCTCTTTTAAATAGTAAGAAACAAGCTCTTCCATAATAACATCTCTATCAATATGACGAATTTGATTTCTT > USA300TCH1516_ALE/1722225‑1722404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |