| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,808,251 | C→A | 6.1% | intergenic (‑151/+118) | pfkA ← / ← accA | ATP‑dependent 6‑phosphofructokinase/Acetyl‑coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,808,251 | 0 | C | A | 6.1% | 741.4 / 27.6 | 215 | intergenic (‑151/+118) | pfkA/accA | ATP‑dependent 6‑phosphofructokinase/Acetyl‑coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (94/107); new base A (6/7); total (101/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TCATTCCATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTAT > USA300TCH1516_ALE/1808161‑1808340 | tCATTCCATCAAAACTAATGTATTGTATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCcac < 1:3611088/91‑1 (MQ=255)tCATTCCATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCcac > 2:1690552/1‑91 (MQ=255) tCCATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAAtt > 1:3324422/1‑91 (MQ=255) tCCATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTATAAATATTGAATTTTATTTTTCCTTGTTTAAAAAAAGCTTAGTAGCTACAAtt > 1:980265/1‑91 (MQ=255) ccATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAAttt < 1:1557139/91‑1 (MQ=255) ccATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAAttt < 2:905088/91‑1 (MQ=255) cATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAAtttt > 1:2652510/1‑91 (MQ=255) aTCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTg < 2:1947864/91‑1 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATTTTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 2:558302/1‑91 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGTCAAAAttgtgg > 1:390931/1‑87 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCcac < 2:3089049/83‑1 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 1:212097/1‑91 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 1:2265967/1‑91 (MQ=255) cAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGac < 2:1536087/91‑1 (MQ=255) cAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGac > 2:3589684/1‑91 (MQ=255) cAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACATTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACTATTTTGac > 2:3380004/1‑91 (MQ=255) aaaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGacta > 2:1341364/1‑91 (MQ=255) aaaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGacta < 2:1659874/91‑1 (MQ=255) aaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGactac < 1:1756168/91‑1 (MQ=255) aaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGactac < 1:338229/91‑1 (MQ=255) aCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGTCAAAATTGTGgctact < 2:3107459/91‑1 (MQ=38) tAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTACCTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGTAAAAATTGTGGCTACTaa < 1:593690/91‑1 (MQ=37) aaTGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAAt > 2:1073634/1‑91 (MQ=255) aaTGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAAt > 1:1176359/1‑91 (MQ=255) gTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGTCAAAATTGTGGCTACTAATCtt < 2:2035531/91‑1 (MQ=37) tATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTa < 1:77997/91‑1 (MQ=255) tATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTa > 1:3515467/1‑91 (MQ=255) attgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAg > 2:3330985/1‑91 (MQ=255) attgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAg < 1:1834255/91‑1 (MQ=255) ttgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGt < 2:3875898/91‑1 (MQ=255) ttgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGt < 2:2554083/91‑1 (MQ=255) tgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGtt < 1:1533281/91‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTaaaa < 1:3802220/91‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTaaaa < 2:3550837/91‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTaaaa < 2:1536742/91‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTaaaa < 2:3550651/91‑1 (MQ=255) tgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAAt < 2:2589280/91‑1 (MQ=255) tGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCa > 1:3462380/1‑91 (MQ=255) gTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAg < 2:1584992/91‑1 (MQ=255) aaCGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTATGTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCATATTTTTGACTATTAATGTTAGTTAAAATTCAGTAt > 2:3500573/1‑91 (MQ=255) tttttAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTa < 2:2274591/90‑1 (MQ=255) tttatAAATATTGAATTTTATTTTAACTAAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAAATTTTACTACAAATCTTAGTAAAAATTCAGTACCTa < 2:1837089/87‑1 (MQ=255) ttttAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTaa > 1:563808/1‑91 (MQ=255) ttttAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTaa > 2:3828409/1‑91 (MQ=255) ttAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAat < 2:600477/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAatat < 1:586228/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAatat < 1:3195258/91‑1 (MQ=255) aaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATAtt > 1:2175838/1‑91 (MQ=255) aaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATAtt > 2:1016294/1‑91 (MQ=255) atatTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTa < 1:1017106/91‑1 (MQ=255) tatTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTaa > 2:3702100/1‑91 (MQ=255) tatTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTaa < 1:876683/91‑1 (MQ=255) tatTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTaa < 2:2495180/91‑1 (MQ=255) atTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTCATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTaca > 2:2744364/1‑89 (MQ=255) ttGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAat < 1:807398/91‑1 (MQ=255) ttGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAat > 1:335690/1‑91 (MQ=255) tGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAatt < 2:920813/91‑1 (MQ=255) tGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAatt < 1:1108209/91‑1 (MQ=255) gAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAatta < 1:2599547/91‑1 (MQ=255) aaTTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAattat < 2:683869/91‑1 (MQ=255) attttattttAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAattatt > 1:3426570/1‑91 (MQ=255) attttattttAAAAAAAATAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAattatt < 2:3768071/91‑1 (MQ=255) ttttattttaACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTg > 2:504045/1‑91 (MQ=255) tttattttaACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGt < 1:3169278/91‑1 (MQ=255) tttaACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTaa > 2:3565181/1‑91 (MQ=255) taACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATg < 1:1919948/91‑1 (MQ=255) aaCTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGt < 2:880566/91‑1 (MQ=255) aaCTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTAAGTTAAAATTCAGTATCTATATATTAAATTATTGTTTTAATGt > 2:3613011/1‑91 (MQ=255) cTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTAc > 1:2095965/1‑91 (MQ=255) aattaaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATc > 2:1604781/1‑60 (MQ=255) attaaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCa < 2:1714429/91‑1 (MQ=255) attaaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCa > 2:709820/1‑91 (MQ=255) ttaaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCaa > 1:1955533/1‑91 (MQ=255) taaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAAt > 2:301588/1‑91 (MQ=255) aaaaaaaGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAAtt < 1:2215072/91‑1 (MQ=255) aaaaGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTAt < 1:169234/91‑1 (MQ=255) aGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGt < 1:2542918/91‑1 (MQ=255) aGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGt > 1:1917992/1‑91 (MQ=255) gATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTa > 1:2961456/1‑91 (MQ=255) gATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTa > 2:1425146/1‑91 (MQ=255) gATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTa > 2:435439/1‑91 (MQ=255) aTTAGTAGTCAAAATTGTGGCTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTCCTTCAATTTATGGTaa > 1:306818/1‑91 (MQ=37) aTTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaa < 1:1352606/91‑1 (MQ=255) ttAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaa > 1:2933083/1‑91 (MQ=255) ttAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaa > 1:3766882/1‑91 (MQ=255) ttAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaa > 2:596144/1‑91 (MQ=255) tagtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaaa < 2:27841/91‑1 (MQ=255) tagtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaaa > 2:776696/1‑91 (MQ=255) tagtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaaa > 2:2283601/1‑91 (MQ=255) agtagtCAAAATTGTGGCTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAc > 2:1264353/1‑91 (MQ=38) agtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAc > 1:493964/1‑91 (MQ=255) gtagTCAAAATTGTGGCTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAcc > 2:1217799/1‑91 (MQ=38) gtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAcc > 2:2152845/1‑91 (MQ=255) tagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAccc > 2:364911/1‑91 (MQ=255) tagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAccc < 1:3589684/91‑1 (MQ=255) ccACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGt < 2:2265967/91‑1 (MQ=255) ccACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGt < 1:837380/91‑1 (MQ=255) ccACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGt < 1:3240498/91‑1 (MQ=255) cacaATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTa > 2:810216/1‑91 (MQ=255) acaATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTAt < 2:1176359/91‑1 (MQ=255) | TCATTCCATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTAT > USA300TCH1516_ALE/1808161‑1808340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |