| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,808,256 | T→G | 5.3% | intergenic (‑156/+113) | pfkA ← / ← accA | ATP‑dependent 6‑phosphofructokinase/Acetyl‑coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,808,256 | 0 | T | G | 5.3% | 704.4 / 20.9 | 208 | intergenic (‑156/+113) | pfkA/accA | ATP‑dependent 6‑phosphofructokinase/Acetyl‑coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (91/106); new base G (4/7); total (95/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
CCATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTATCGATT > USA300TCH1516_ALE/1808166‑1808345 | ccATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAAttt < 2:905088/91‑1 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATTTTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 2:558302/1‑91 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 2:1209748/1‑91 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 1:1454384/1‑91 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 1:2265967/1‑91 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 1:212097/1‑91 (MQ=255) tCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGa > 1:3277109/1‑91 (MQ=255) cAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGac > 2:3589684/1‑91 (MQ=255) cAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACATTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACTATTTTGac > 2:3380004/1‑91 (MQ=255) aaaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGacta < 2:1658757/91‑1 (MQ=255) aaaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGacta < 2:1500873/91‑1 (MQ=255) aaaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGacta < 1:1929463/91‑1 (MQ=255) aaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTtactac > 2:3622863/1‑91 (MQ=255) aaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGactac < 1:338229/91‑1 (MQ=255) aaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGactac < 1:1756152/91‑1 (MQ=255) aaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGactac > 1:880566/1‑91 (MQ=255) aaCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGactac < 2:3775999/91‑1 (MQ=255) aCTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGactact < 2:2063397/91‑1 (MQ=255) tAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTACCTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGTAAAAATTGTGGCTACTaa < 1:593690/91‑1 (MQ=37) aaTGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAAt > 2:1073634/1‑91 (MQ=255) aaTGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAAt > 2:3105354/1‑91 (MQ=255) tATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGTCAAAATTGTGGCTACTAATCttt < 1:1540881/91‑2 (MQ=25) tATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTa < 1:77997/91‑1 (MQ=255) attgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGTCAAAATTGTGGCTACTAATCtttt < 1:180964/91‑3 (MQ=25) attgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAg < 1:1834255/91‑1 (MQ=255) attgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAg > 2:3330985/1‑91 (MQ=255) ttgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGt < 2:3875898/91‑1 (MQ=255) ttgaattgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGt < 2:251930/91‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTaaaa < 2:1536655/91‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTaaaa < 2:3550837/91‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTaaaa < 2:3550651/91‑1 (MQ=255) ttgaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTaaaa < 1:3802220/91‑1 (MQ=255) gaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTCGTTAAAAtt > 1:3717310/1‑91 (MQ=255) gaTGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAAtt > 2:474974/1‑91 (MQ=255) tGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCa > 2:3195258/1‑91 (MQ=255) tGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCa > 1:3462794/1‑91 (MQ=255) gTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAg < 2:1584992/91‑1 (MQ=255) aaCGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTATGTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCATATTTTTGACTATTAATGTTAGTTAAAATTCAGTAt > 2:3500573/1‑91 (MQ=255) aaCGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTAt < 1:844727/91‑1 (MQ=255) aaCGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTAt > 2:1232322/1‑91 (MQ=255) tttttAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTa < 2:2274591/90‑1 (MQ=255) ttttAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTaa > 1:563808/1‑91 (MQ=255) ttttAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTaa > 2:3828409/1‑91 (MQ=255) ttAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAat < 2:600477/91‑1 (MQ=255) tAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAata < 1:1329795/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAatat < 2:2554987/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAatat < 1:586228/91‑1 (MQ=255) aaaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAatat < 2:813466/91‑1 (MQ=255) aaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATAtt > 2:1736105/1‑91 (MQ=255) aaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATAtt > 1:2175838/1‑91 (MQ=255) aaTATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATAtt > 2:1016294/1‑91 (MQ=255) atatTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTa < 1:1017106/91‑1 (MQ=255) atatTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTa < 1:1163770/91‑1 (MQ=255) atatTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATATTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTa > 2:1667883/1‑91 (MQ=255) tatTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTaa > 2:3702100/1‑91 (MQ=255) ttGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAat < 1:807398/91‑1 (MQ=255) ttGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAat > 1:335690/1‑91 (MQ=255) tGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAatt < 2:920813/91‑1 (MQ=255) gAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAatta < 1:2599547/91‑1 (MQ=255) attttattttAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAattatt < 2:129172/91‑1 (MQ=255) attttattttAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAattatt > 1:3426570/1‑91 (MQ=255) attttattttAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTAAAAATTCAGTATCTAAATATTAAattatt < 2:275176/91‑1 (MQ=255) attttattttAAAAAAAATAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAattatt < 2:3768071/91‑1 (MQ=255) ttttattttaACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTg > 2:504045/1‑91 (MQ=255) tttattttaACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGt < 1:3169404/91‑1 (MQ=255) ttttaACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTa > 2:1171388/1‑91 (MQ=255) tttaACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTaa > 2:3565181/1‑91 (MQ=255) tttaACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTaa > 2:1863403/1‑91 (MQ=255) aaCTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGt < 2:880566/91‑1 (MQ=255) cTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTAc < 1:3220753/91‑1 (MQ=255) cTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTAc > 1:2095965/1‑91 (MQ=255) aattaaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATc < 1:1604781/60‑1 (MQ=255) attaaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCa < 2:1714429/91‑1 (MQ=255) attaaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCa > 2:708476/1‑91 (MQ=255) ttaaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCaa > 1:1955534/1‑91 (MQ=255) taaAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAAt > 2:301588/1‑91 (MQ=255) aaaaaaaGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAAtt < 1:2215072/91‑1 (MQ=255) aGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGt < 1:2542918/91‑1 (MQ=255) aGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGt > 1:1917992/1‑91 (MQ=255) aGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGt < 1:2616823/91‑1 (MQ=255) aGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGt < 2:3594981/91‑1 (MQ=255) gATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTa > 1:2961456/1‑91 (MQ=255) aTTAGTAGTCAAAATTGTGGCTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTCCTTCAATTTATGGTaa > 1:306818/1‑91 (MQ=37) ttAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaa > 1:3766882/1‑91 (MQ=255) ttAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaa > 2:596144/1‑91 (MQ=255) tagtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaaa < 2:27841/91‑1 (MQ=255) tagtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaaa < 2:2628690/91‑1 (MQ=255) tagtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaaa > 2:2283601/1‑91 (MQ=255) tagtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTaaaa > 2:776696/1‑91 (MQ=255) agtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAc > 1:2659261/1‑91 (MQ=255) agtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAc > 1:493964/1‑91 (MQ=255) gtagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAcc > 2:2152845/1‑91 (MQ=255) tagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAccc < 1:3436337/91‑1 (MQ=255) tagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAccc < 1:3589684/91‑1 (MQ=255) tagCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAAccc < 1:762371/91‑1 (MQ=255) ccACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGt < 2:2265967/91‑1 (MQ=255) cacaATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTa < 2:1417463/91‑1 (MQ=255) aTTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTATCGa < 1:108967/91‑1 (MQ=255) ttttGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTATCGAt < 1:3105354/91‑1 (MQ=255) ttttGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTATCGAt > 1:1400468/1‑91 (MQ=255) | CCATCAAAACTAATGTATTGAATTGATGTAAACGTTTTAAATATTGAATTTTATTTTAACTTAATTAAAAAAAGATTAGTAGCCACAATTTTGACTACTAATCTTAGTTAAAATTCAGTATCTAAATATTAAATTATTGTTTTAATGTACTTCAATTTATGGTAAAACCCAGTATCGATT > USA300TCH1516_ALE/1808166‑1808345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |