Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 1,905,775 | G→C | 5.1% | E128Q (GAA→CAA) | sigS → | RNA polymerase sigma factor SigS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 1,905,775 | 0 | G | C | 5.1% | 895.1 / 25.0 | 249 | E128Q (GAA→CAA) | sigS | RNA polymerase sigma factor SigS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (117/119); new base C (8/5); total (125/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAATTAGT > USA300TCH1516_ALE/1905685‑1905865 | cATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTg > 1:2859615/1‑91 (MQ=255) cATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTg > 1:407436/1‑91 (MQ=255) aCCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAAt > 1:3530631/1‑91 (MQ=255) ccTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAAtt < 1:3410785/91‑1 (MQ=255) ttCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGc < 1:1168784/91‑1 (MQ=255) ttCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGc > 2:3639732/1‑91 (MQ=255) ttCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGc < 2:3853620/91‑1 (MQ=255) ttCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTCAAATTGc > 1:454033/1‑91 (MQ=255) tCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCt > 2:434471/1‑91 (MQ=255) cGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTg < 2:918307/91‑1 (MQ=255) cGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTg < 1:510606/91‑1 (MQ=255) cGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTg < 1:190406/91‑1 (MQ=255) gTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGa < 2:2457355/91‑1 (MQ=255) ttACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGaaa > 2:2328552/1‑91 (MQ=255) tACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAAt > 1:2100391/1‑91 (MQ=255) aCAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATc > 1:80333/1‑91 (MQ=255) aCAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATc < 2:533116/91‑1 (MQ=255) cAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCACACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCa > 1:3082295/1‑91 (MQ=255) cAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCa > 2:2976565/1‑91 (MQ=255) cAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCa > 1:2187928/1‑91 (MQ=255) aaGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCAt > 2:1785715/1‑91 (MQ=255) aGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATg > 1:3433041/1‑91 (MQ=255) tCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCAtt < 1:1108676/91‑1 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt > 1:3210963/1‑91 (MQ=255) ttCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTAt < 2:2159450/91‑1 (MQ=255) aaGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGc < 2:1083044/91‑1 (MQ=255) aaGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGc < 2:3575056/91‑1 (MQ=255) aGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGTAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCt > 2:1077184/1‑91 (MQ=255) aGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCt < 1:1226106/91‑1 (MQ=255) gCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCtt > 2:2543286/1‑91 (MQ=255) cTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCttt < 1:1684900/91‑1 (MQ=255) cTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCttt < 2:3587112/91‑1 (MQ=255) cTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCttt < 2:802119/91‑1 (MQ=255) tttAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACATGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCa < 2:1367507/91‑1 (MQ=255) ttAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCaa > 2:3067293/1‑91 (MQ=255) tAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAAc > 1:1823523/1‑91 (MQ=255) aaaTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACg < 1:743280/91‑1 (MQ=255) aaTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGa < 2:1756515/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGat < 2:2681800/91‑1 (MQ=255) aTCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGAGACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGat > 1:3357676/1‑91 (MQ=255) tCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGatt > 2:1843830/1‑91 (MQ=255) cAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGatta < 1:135048/91‑1 (MQ=255) aaGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaa < 2:2301894/91‑1 (MQ=255) aaGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaa > 2:71206/1‑91 (MQ=255) aaGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaa < 2:2637977/91‑1 (MQ=255) agagAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaat > 1:2677923/1‑91 (MQ=255) gagaAAGACTATGGCTCGAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaatt < 1:3328673/91‑1 (MQ=255) gagaAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaatt < 2:1980058/91‑1 (MQ=255) agaAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaatta > 1:2325732/1‑91 (MQ=255) gaAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGattaaattaa > 2:3746035/1‑91 (MQ=255) aaaGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCCACGATTAaattaat < 2:3300694/91‑1 (MQ=255) aaGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAaattaatt > 1:917676/1‑91 (MQ=255) aaGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAaattaatt < 2:1586236/91‑1 (MQ=255) aaGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAaattaatt > 2:3341595/1‑91 (MQ=255) aaGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAaattaatt < 1:3585620/91‑1 (MQ=255) aaGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAaattaatt > 2:3660513/1‑91 (MQ=255) aaGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAaattaatt > 2:3559067/1‑91 (MQ=255) aGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAattaatta < 1:2034536/91‑1 (MQ=255) gACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAAttaattaa > 1:377699/1‑91 (MQ=255) gACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAAttaattaa > 1:3145206/1‑91 (MQ=255) gACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAAttaattaa < 1:1153351/91‑1 (MQ=255) aCTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAg < 2:1551216/91‑1 (MQ=255) tATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTg < 1:2844804/48‑1 (MQ=255) tATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGAt < 2:2082697/91‑1 (MQ=255) cTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCg > 1:568235/1‑91 (MQ=255) aaaCTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTa < 1:3159172/91‑1 (MQ=255) aaaCTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTa < 1:1866693/91‑1 (MQ=255) aCTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAg < 2:1325318/91‑1 (MQ=255) ataCCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGt > 1:2400139/1‑91 (MQ=255) ataCCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGt < 1:1035238/91‑1 (MQ=255) taCCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTa > 1:2869578/1‑91 (MQ=255) taCCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTa > 1:1522000/1‑91 (MQ=255) aCCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTaa > 1:853302/1‑91 (MQ=255) ttGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATg > 1:3007456/1‑91 (MQ=255) gAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGcc < 1:2146063/91‑1 (MQ=255) gAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGcc < 1:1052866/91‑1 (MQ=255) gAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGcc < 1:989537/91‑1 (MQ=255) aGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCaa < 2:2520353/91‑1 (MQ=255) ggATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAAc > 1:348267/1‑91 (MQ=255) gATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACa < 1:935176/91‑1 (MQ=255) atatAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACAt < 1:3492061/91‑1 (MQ=255) aTACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACAt < 2:2835198/91‑1 (MQ=255) aTACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACAt > 1:2016070/1‑91 (MQ=255) aTACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACAt < 1:1182902/91‑1 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:1402624/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:2076534/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:2782047/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 2:3210404/1‑91 (MQ=255) tACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATa > 1:493175/1‑91 (MQ=255) cAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAAt > 1:2986425/1‑91 (MQ=255) cAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAAt < 2:444741/91‑1 (MQ=255) gCAATTTCAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCCCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAAtttt > 2:1272784/1‑91 (MQ=255) aaTTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTaa > 2:1933182/1‑91 (MQ=255) aTTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTATGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAAt < 1:3265774/91‑1 (MQ=255) aTTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAAt > 2:2845342/1‑91 (MQ=255) aTTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAAt < 1:3407561/91‑1 (MQ=255) aTTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAAt < 1:3842212/91‑1 (MQ=255) aTTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAAt < 2:2011118/91‑1 (MQ=255) gAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAATTAGt > 1:2237440/1‑91 (MQ=255) gAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAATTAGt < 2:1241169/91‑1 (MQ=255) | CATGACCTTCGTTTACAAGATATCTTCAAGCTTTTAAATCAAAGAGAAAGACTATGGCTCAAACTATACCTTGAAGGATACAAGCAATTTGAAATTGCTGAAATCATGTCATTATCGCTTTCAACGATTAAATTAATTAAGATGTCCGTTAAGCGTAAATGCCAACATAATTTTAATTAGT > USA300TCH1516_ALE/1905685‑1905865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |