| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,042,100 | T→A | 8.4% | K338N (AAA→AAT) | gatB_2 ← | Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,042,100 | 0 | T | A | 8.4% | 668.5 / 38.5 | 204 | K338N (AAA→AAT) | gatB_2 | Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (81/105); new base A (6/11); total (87/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
ATTTTCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTAA > USA300TCH1516_ALE/2042010‑2042189 | aTTTTCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAt > 2:426701/1‑91 (MQ=255) tttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAttt > 1:1012646/1‑91 (MQ=255) tttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAttt < 2:1111088/91‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTa > 1:246106/1‑91 (MQ=255) ttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTa < 2:3425731/91‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTa < 2:910370/91‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTa < 1:2214002/91‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTa < 2:1247902/91‑1 (MQ=255) tCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTaa > 1:3557724/1‑91 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAAc > 1:2532806/1‑91 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAAc < 1:117815/91‑1 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAAc > 1:2393432/1‑91 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAAc > 1:3423630/1‑91 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAAc < 2:257999/91‑1 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTAAc < 2:1763228/91‑1 (MQ=255) ggTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTAACAt < 1:2621238/91‑1 (MQ=255) gtgtTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATc > 1:1155462/1‑91 (MQ=255) gtTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTg < 1:788249/91‑1 (MQ=255) ttAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGc < 1:1611156/91‑1 (MQ=255) ttAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTAACATCtaa < 2:3130402/91‑3 (MQ=255) aaTTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTAGTTTACGCCAACCATTAACCAGTTAGATGTTAATTAAACATCTGCAc > 2:924711/1‑91 (MQ=255) tttAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCg < 2:2044460/91‑1 (MQ=255) tttAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCg < 2:3591256/91‑1 (MQ=255) ttAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgt < 1:28656/91‑1 (MQ=255) tAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtg > 2:761064/1‑91 (MQ=255) tAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtg < 1:106737/91‑1 (MQ=255) aGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtgt > 2:1460491/1‑91 (MQ=255) aGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtgt < 2:3310474/91‑1 (MQ=255) gTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGtt < 1:951247/91‑1 (MQ=255) gTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGtt > 1:62065/1‑91 (MQ=255) gTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGtt > 2:2338958/1‑91 (MQ=255) tATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTc < 1:3263808/91‑1 (MQ=255) tATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTc > 2:2751753/1‑91 (MQ=255) tATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTc < 2:801753/91‑1 (MQ=255) cTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAAt < 2:470388/91‑1 (MQ=255) aataatTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAAttg < 2:3652459/91‑1 (MQ=255) ataatTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAAttgt < 2:2279664/91‑1 (MQ=255) atTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGa > 1:3394184/1‑91 (MQ=255) ttCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGAt < 1:1306325/91‑1 (MQ=255) tCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGAtt > 2:863209/1‑91 (MQ=255) tACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCa > 1:3642279/1‑91 (MQ=255) tACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCa < 1:977603/91‑1 (MQ=255) tACTAGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCa < 2:1595240/91‑1 (MQ=255) cTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCaaa < 1:1936043/91‑1 (MQ=255) cTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCaaa < 2:2327571/91‑1 (MQ=255) aTTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGaaa > 1:3570290/1‑91 (MQ=255) tttttATTTATATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCTGTCAGATGTTACGTTAACATCTGCACCGTGTTCACTTGTGAATTCAAAGACAt < 2:2881305/91‑1 (MQ=255) tttttATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAAt < 2:86930/91‑1 (MQ=255) ttttATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATc < 1:1319320/91‑1 (MQ=255) tttatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCt < 1:1369636/91‑1 (MQ=255) tttatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCt > 1:1992736/1‑91 (MQ=255) ttatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTg < 2:3635532/91‑1 (MQ=255) ttatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTg < 1:2106108/91‑1 (MQ=255) ttatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTg < 1:2315079/91‑1 (MQ=255) ttatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTg < 2:1001841/91‑1 (MQ=255) tatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAAtgtca < 1:249494/91‑5 (MQ=255) tatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGa < 1:3349348/91‑1 (MQ=255) tatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGa < 1:695209/91‑1 (MQ=255) ttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACAt > 2:267112/1‑91 (MQ=255) ttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACAt > 1:3777196/1‑91 (MQ=255) aaaTATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACAttt < 2:246106/91‑1 (MQ=255) aaTATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTc > 1:694177/1‑91 (MQ=255) aaTATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGCTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTc > 2:2371641/1‑91 (MQ=255) atatTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCt > 1:1789151/1‑91 (MQ=255) tatTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCtt > 1:1706033/1‑91 (MQ=255) atTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCttt < 2:199361/91‑1 (MQ=255) atTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCttt < 2:681812/91‑1 (MQ=255) atTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCttt < 1:670817/91‑1 (MQ=255) ttCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTCCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATGTCAGATTTCtttg < 1:1075668/91‑2 (MQ=255) tCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAg > 2:497948/1‑91 (MQ=255) cGTTTACGCCGCCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGt < 2:3503894/91‑1 (MQ=255) cGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGt > 1:420777/1‑91 (MQ=255) cGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGt > 1:422040/1‑91 (MQ=255) tttACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCa > 2:978649/1‑91 (MQ=255) ttACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCaa < 2:589227/91‑1 (MQ=255) cGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGt > 1:2950368/1‑91 (MQ=255) gCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGtt < 1:3413371/91‑1 (MQ=255) cccATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATa < 1:761033/91‑1 (MQ=255) aTTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACgt < 1:530760/91‑1 (MQ=255) tAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACgtgt > 2:2630569/1‑91 (MQ=255) tAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAAATGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACgtgt > 1:3360757/1‑91 (MQ=255) aCCGGTTAGGTGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGc < 1:3484259/91‑1 (MQ=255) aCCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGc < 1:3198839/91‑1 (MQ=255) aCCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGc > 1:150494/1‑91 (MQ=255) aCCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGc < 1:837445/91‑1 (MQ=255) ccAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCa > 2:1372548/1‑91 (MQ=255) aGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATc > 2:1543373/1‑91 (MQ=255) gTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCAtac < 1:1860873/91‑3 (MQ=255) tAGTTGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAAGCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTa < 2:2545958/91‑1 (MQ=255) caGATGTTAAATTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTa > 2:249886/2‑91 (MQ=255) gATGTTAAATTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATg > 2:3822339/1‑91 (MQ=255) aTGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGc > 2:1845528/1‑91 (MQ=255) aTGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGc < 1:2751753/91‑1 (MQ=255) aTGTTAAATTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGc > 2:158908/1‑91 (MQ=255) gTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAg > 1:1342447/1‑91 (MQ=255) gTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAg < 1:2989135/91‑1 (MQ=255) gTTAAATTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAg > 1:1432564/1‑91 (MQ=255) tAATTTAGCATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGt < 2:3741253/91‑1 (MQ=255) aaTTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTa > 1:2157288/1‑91 (MQ=255) aTTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTaa < 2:3557724/91‑1 (MQ=255) | ATTTTCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTAA > USA300TCH1516_ALE/2042010‑2042189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |