| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,528,352 | A→G | 6.0% | intergenic (‑151/+35) | USA300TCH1516_02412 ← / ← zinT | hypothetical protein/Metal‑binding protein ZinT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,528,352 | 0 | A | G | 6.0% | 751.8 / 24.1 | 232 | intergenic (‑151/+35) | USA300TCH1516_02412/zinT | hypothetical protein/Metal‑binding protein ZinT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (113/105); new base G (5/9); total (118/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.05e-01 | |||||||||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
CCAAATCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAGGATAAT > USA300TCH1516_ALE/2528262‑2528442 | ccAAATCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTa > 1:1027564/1‑91 (MQ=255)ccAAATCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTa > 2:2039492/1‑91 (MQ=255) aaaTCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTAtt < 1:1068623/91‑1 (MQ=255) aaaTCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTAtt < 2:1380514/91‑1 (MQ=255) aaaTCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTAtt < 2:334646/91‑1 (MQ=255) aaaTCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTAtt < 1:2689111/91‑1 (MQ=255) aaaTCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTAtt < 2:2934960/91‑1 (MQ=255) aaaTCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTAtt < 2:3129784/91‑1 (MQ=255) aaTCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTa < 2:106756/91‑1 (MQ=255) cATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACa > 2:146236/1‑91 (MQ=255) aTTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAg < 1:3678465/91‑1 (MQ=255) ttGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGtt > 1:631511/1‑91 (MQ=255) ttGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGtt < 1:2121832/91‑1 (MQ=255) ttGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGtt > 1:1401985/1‑91 (MQ=255) ttGTTATAAACTATAGTAATATTAACCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGtt > 2:3266635/1‑91 (MQ=255) tGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTg > 1:2002647/1‑91 (MQ=255) tGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTg > 2:1450385/1‑91 (MQ=255) gTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGa > 1:3625257/1‑91 (MQ=255) gTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGa > 1:2607620/1‑91 (MQ=255) ttATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAg < 1:2017205/91‑1 (MQ=255) ttATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAg < 1:2377468/91‑1 (MQ=255) tataAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGt > 1:3676132/1‑91 (MQ=255) tataAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGt > 2:2228629/1‑91 (MQ=255) tataAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTACTCAACTGTTAATAGCTGaat < 2:1172874/91‑3 (MQ=37) aaaCTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTaga < 1:3065184/91‑1 (MQ=255) aaCTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTACTCAACTGTTAATAGCTGAATagag < 1:1132511/91‑1 (MQ=21) aCTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAgt < 2:578638/91‑1 (MQ=255) cTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAgtg < 2:2117079/91‑1 (MQ=255) tataGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAgtgt < 1:2449914/91‑1 (MQ=255) ataGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGtgtg > 2:1009116/1‑91 (MQ=255) ataGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTACTCAACTGTTAATAGCTGAATAGAGtgtg < 1:683613/91‑1 (MQ=21) taGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGc < 2:1499562/91‑1 (MQ=255) taGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTACTCAACTGTTAATAGCTGAATAGAGtgtgt < 1:1555725/91‑2 (MQ=21) aGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCa > 1:32429/1‑91 (MQ=255) aGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCa < 2:3012458/91‑1 (MQ=255) aGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTACTCAACTGTTAATAGCTGAATAGAGtgtgtt < 2:359052/91‑3 (MQ=18) gTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCaa > 2:3634561/1‑91 (MQ=255) gTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCaa > 2:3254649/1‑91 (MQ=255) tAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCaaa > 2:3003891/1‑91 (MQ=255) aaTATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAAc < 2:1678789/91‑1 (MQ=255) atatTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAAcc > 1:2072076/1‑91 (MQ=255) aTTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAAtt > 2:2604887/1‑91 (MQ=255) aTTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAAtt > 1:1044156/1‑91 (MQ=255) aTTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAAtt > 1:2929719/1‑91 (MQ=255) tCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTaa > 1:3781936/1‑91 (MQ=255) cccTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAAt > 2:665063/1‑91 (MQ=255) cccTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAAt > 1:1204793/1‑91 (MQ=255) ccTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATg > 1:2894722/1‑91 (MQ=255) ctctGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTATAGTGTGCAAACCTGTTGTATTAATgc > 2:3367932/1‑91 (MQ=255) ctGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATgcgc < 1:3340661/91‑1 (MQ=255) ctGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAACTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATgcgc > 2:1742505/1‑91 (MQ=255) ttGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGTATTAATGCGCTaa < 2:451517/91‑1 (MQ=255) aaaTTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACAt < 2:1653715/91‑1 (MQ=255) aaTTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACAtt > 1:3203207/1‑91 (MQ=255) aTTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACAttt > 2:913249/1‑91 (MQ=255) tGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATttct < 1:1822220/91‑1 (MQ=255) aTAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATttcttc > 2:1224063/1‑91 (MQ=255) tAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTtcttct > 2:1401772/1‑91 (MQ=255) aaCTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTcttctt < 2:1322938/91‑1 (MQ=255) aaCTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTcttctt < 1:2846062/91‑1 (MQ=255) aaCTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTcttctt > 2:2073025/1‑91 (MQ=255) aCTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCttt > 2:2893166/1‑91 (MQ=255) aCTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCttt > 2:1926277/1‑91 (MQ=255) cTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTg < 2:323868/91‑1 (MQ=255) gAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGAttt > 1:3428403/1‑91 (MQ=255) aaaTAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTg > 1:500189/1‑91 (MQ=255) aTAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGt > 2:2565911/1‑91 (MQ=255) aTAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGt > 1:864826/1‑91 (MQ=255) aaaaaaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACCTTTCCTCTTTGATTTGGTCt > 1:2595302/1‑91 (MQ=255) aaaaaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtt > 2:1902934/1‑91 (MQ=255) aaaaaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtt > 2:2407246/1‑91 (MQ=255) aaaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCttta < 1:3528020/91‑1 (MQ=255) aaaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCttta < 2:186159/91‑1 (MQ=255) aaaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCttta > 2:3018497/1‑91 (MQ=255) aaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttat > 1:736339/1‑91 (MQ=255) aaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttat > 2:34634/1‑91 (MQ=255) aaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttat < 1:1224063/91‑1 (MQ=255) aaCACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttat < 2:3754074/91‑1 (MQ=255) acacacTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttatt < 1:1104356/91‑1 (MQ=255) cacacTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttattt < 2:316900/91‑1 (MQ=255) cacacTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttattt < 2:2336078/91‑1 (MQ=255) cacacTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttattt < 2:1994454/91‑1 (MQ=255) cacacTCTACTCAACTGTTAATAGCTGAATAGAGTGTGTAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttattt > 1:328630/1‑91 (MQ=18) cacTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTaa > 2:1275510/1‑91 (MQ=255) acTCTACTCAACTGTTAATAGCTGAATAGAGTGTGTAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAAt > 1:1758976/1‑91 (MQ=21) ctctATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTTAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTTGTCTTTATTTAAtt < 2:3296954/91‑1 (MQ=255) ctctATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCtttattt < 1:1487440/87‑1 (MQ=255) ctATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAAtttt < 2:783751/91‑1 (MQ=255) tATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAAtt < 2:2308848/88‑1 (MQ=255) tATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTg < 1:567963/91‑1 (MQ=255) aTTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGa > 2:2437413/1‑91 (MQ=255) aTTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGa < 1:3266635/91‑1 (MQ=255) tCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAg < 1:1440832/91‑1 (MQ=255) cAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAgg < 1:1450910/91‑1 (MQ=255) gCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAGGat > 1:504601/1‑91 (MQ=255) cTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAGGata > 2:2707214/1‑91 (MQ=255) tATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAGGataa > 1:3846395/1‑91 (MQ=255) tATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAGGataa < 1:2250348/91‑1 (MQ=255) aTTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAGGataat < 1:1926277/91‑1 (MQ=255) aTTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAGGataat > 2:415538/1‑91 (MQ=255) | CCAAATCATTTGTTATAAACTATAGTAATATTAATCATTCCCTCTGTTGAAATTGATAACTACGAAATAAAAAACACACTCTATTCAGCTATTAACAGTTGAGTAGAGTGTGCAAACCTGTTGAATTAATGCGCTAACATTTCTTCTTTGATTTGGTCTTTATTTAATTTTGAAGGATAAT > USA300TCH1516_ALE/2528262‑2528442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |