Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 2,566,055 | A→T | 7.8% | intergenic (+104/+36) | nhaK_2 → / ← plaP | Sodium, potassium, lithium and rubidium/H(+) antiporter/Low‑affinity putrescine importer PlaP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 2,566,055 | 0 | A | T | 7.8% | 843.8 / 42.7 | 254 | intergenic (+104/+36) | nhaK_2/plaP | Sodium, potassium, lithium and rubidium/H(+) antiporter/Low‑affinity putrescine importer PlaP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (134/99); new base T (9/11); total (144/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.49e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
ATACCCCCGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGATAAATT > USA300TCH1516_ALE/2565965‑2566145 | aTACCCCCGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTa < 1:1073423/91‑1 (MQ=255) aCCCCCGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTaaa < 1:587546/91‑1 (MQ=255) cccccGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAAt > 2:2292992/1‑91 (MQ=255) cccccGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAAt < 1:3379879/91‑1 (MQ=255) ccccGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATa < 1:1138223/91‑1 (MQ=255) ccccGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATa < 1:832065/91‑1 (MQ=255) ccccGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTAATAAAAAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATa < 2:3803327/91‑1 (MQ=255) cccGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATaa > 1:2110365/1‑91 (MQ=255) gTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCt < 2:3642380/91‑1 (MQ=255) atatGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACCTCAAAAAACCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTtca > 2:1343996/1‑91 (MQ=255) tatGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTtcat > 1:2588005/1‑91 (MQ=255) atGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTtcatc > 1:3531963/1‑91 (MQ=255) atGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTtcatc < 2:217743/91‑1 (MQ=255) tGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTtcatca > 2:3488426/1‑91 (MQ=255) agaCAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAAt < 1:86847/91‑1 (MQ=255) cAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAGGTTATTTACTTTTCATCAATctg < 1:1464697/91‑3 (MQ=21) aaaGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGa < 2:3464164/91‑1 (MQ=255) aaGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCGGATTGATGAAAGGTTATTTACTTTTCATCAATCTGAt < 2:1732870/91‑1 (MQ=18) aGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCGGATTGATGAAAGGTTATTTACTTTTCATCAATCTGAtt < 1:2708094/91‑1 (MQ=17) gTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGAttt > 2:2936436/1‑91 (MQ=255) catgatcatcTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCGGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGa < 2:1065076/87‑1 (MQ=255) cATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGa > 2:2081779/1‑91 (MQ=255) aTTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATACCCTTTCATCAATCCGATTTGAt > 2:3131001/1‑91 (MQ=255) aTTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGAt > 1:1593245/1‑91 (MQ=255) aTTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGAt > 2:824679/1‑91 (MQ=255) ttATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGAtt > 1:2711322/1‑91 (MQ=255) tttgtctcATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATtat > 2:2596962/5‑91 (MQ=255) tttgtctcATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATtat > 1:1773353/5‑91 (MQ=255) atcatcTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATtat > 2:2755801/1‑91 (MQ=255) atcatcTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATtat > 2:2819111/1‑91 (MQ=255) tcatcTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATtata < 2:3303636/91‑1 (MQ=255) ctcATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAAt < 1:657526/91‑1 (MQ=255) cATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCt < 1:2917588/91‑1 (MQ=255) atatGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTa > 1:1537358/1‑91 (MQ=255) tatGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTAt > 2:3664915/1‑91 (MQ=255) atGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTAtt < 2:2130823/91‑1 (MQ=255) atGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTAtt < 2:3555645/91‑1 (MQ=255) atGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTAtt > 1:2695288/1‑91 (MQ=255) tACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTAttttt > 1:302789/1‑91 (MQ=255) tACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTAttttt > 2:1359902/1‑91 (MQ=255) gggTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAg > 2:3167152/1‑91 (MQ=255) gggTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAg < 1:500544/91‑1 (MQ=255) gggTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAg > 1:1644899/1‑91 (MQ=255) gTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGtt > 1:3794726/1‑91 (MQ=255) gTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGtt < 2:2637433/91‑1 (MQ=255) ttttATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTa < 1:3716826/91‑1 (MQ=255) ttttATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTa > 1:2658824/1‑91 (MQ=255) tttATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTaa > 1:2349645/1‑91 (MQ=255) ttATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTaaa > 2:1724421/1‑91 (MQ=255) ttATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTaaa > 2:3850965/1‑91 (MQ=255) tataTTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACTTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAAt < 2:1614008/91‑1 (MQ=255) tataTTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAAt > 2:1769100/1‑91 (MQ=255) atatTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATg < 1:1376793/91‑1 (MQ=255) atatTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATg < 1:1867166/91‑1 (MQ=255) tatTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATgg > 1:2040518/1‑91 (MQ=255) tatTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATgg < 2:1856376/91‑1 (MQ=255) ttCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGaa > 2:2433843/1‑91 (MQ=255) tCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAAt < 1:1917016/91‑1 (MQ=255) tCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAAt < 1:2086330/91‑1 (MQ=255) cAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAAtt > 1:2600149/1‑91 (MQ=255) aaCATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTg > 1:2618228/1‑91 (MQ=255) aCATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGt < 1:3420835/91‑1 (MQ=255) cATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTa > 1:2481538/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACa > 1:1173179/1‑91 (MQ=255) cAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAACGGAATTGTACAt > 2:3228962/1‑91 (MQ=255) atcaaaTCGGATTGATGAAAGGTTATTTACTTTTCATCAATCTGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATa > 2:3790133/4‑91 (MQ=17) aaaaaaTCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGCTTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATa > 1:2791423/1‑91 (MQ=255) aaaaTCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACg > 1:2140593/1‑91 (MQ=255) aaaTCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGt > 2:1205993/1‑91 (MQ=255) aaaTCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGt < 2:2515499/91‑1 (MQ=255) aaTCAGGTTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGtt > 2:2372744/1‑91 (MQ=255) aaTCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGtt < 1:2936436/91‑1 (MQ=255) aaTCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGtt < 2:1414548/91‑1 (MQ=255) aTCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTa < 2:1698094/91‑1 (MQ=255) tCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTaa > 1:2276642/1‑91 (MQ=255) tCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAAGTGTACATACGTTaa < 2:3292890/91‑1 (MQ=255) cAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAAc < 2:2024180/91‑1 (MQ=255) ggATTGATGAAAGGTTATTTACTTTTCATCAATCTGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACa > 2:241101/2‑91 (MQ=18) ggATTGATGAAAGGTTATTTACTTTTCATCAATCTGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACa > 1:3779579/2‑91 (MQ=18) aGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTg < 1:3010962/77‑1 (MQ=255) aGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACa < 1:417257/91‑1 (MQ=255) aGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACa < 2:605165/91‑1 (MQ=255) gATTGATGAAAGGTTATTTACTTTTCATCAATCTGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACAt > 1:757460/1‑91 (MQ=21) gATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACAt > 2:2714511/1‑91 (MQ=255) gATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATGTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACAt > 2:3060321/1‑91 (MQ=255) gATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATACAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACAt > 1:3076767/1‑91 (MQ=255) aTTGATGAAAGGTTATTTACTTTTCATCAATCTGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACAtt > 2:1281082/1‑91 (MQ=21) aTTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACAtt > 2:3741048/1‑91 (MQ=255) aTTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACAtt > 2:972544/1‑91 (MQ=255) ttGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTc < 2:2973885/91‑1 (MQ=255) ttGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTc > 1:1006692/1‑91 (MQ=255) tgatgaAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCt > 1:3214511/1‑91 (MQ=255) gatgaAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCtt < 2:1504878/91‑1 (MQ=255) aaaaGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGa < 2:1163629/91‑1 (MQ=255) aaaaGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGa < 1:988306/91‑1 (MQ=255) aaGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGAta > 2:338007/1‑91 (MQ=255) aaGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGAta < 1:1424781/91‑1 (MQ=255) tAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGAtaaat > 2:1795383/1‑91 (MQ=255) tAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGAtaaat > 1:2259049/1‑91 (MQ=255) aaaTAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGAtaaatt > 2:194086/1‑91 (MQ=255) | ATACCCCCGTACATATGAGACAAAGTCATTATCATCTCATATGTACGGGGTTTTTATATTCAACATCAAAAAATCAGATTGATGAAAAGTAAATAACCTTTCATCAATCCGATTTGATTATAGAATCTATTTTTTAAGTTTAAATGGAATTGTACATACGTTAACATTCTTTTGATAAATT > USA300TCH1516_ALE/2565965‑2566145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |