| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,611,883 | C→A | 5.7% | intergenic (‑206/+6) | USA300HOU_RS13465 ← / ← USA300TCH1516_02490 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,611,883 | 0 | C | A | 5.7% | 864.2 / 30.0 | 245 | intergenic (‑206/+6) | USA300HOU_RS13465/USA300TCH1516_02490 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (129/102); new base A (8/6); total (137/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
TTTATCTTATCATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGATACATTT > USA300TCH1516_ALE/2611795‑2611972 | tttATCTTATCATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCag > 1:2388323/1‑91 (MQ=255) ttatcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCaga < 1:1464817/91‑1 (MQ=255) tatcttatcATCAATTTTTCTTTTTTTTTCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACTCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCagag > 2:3733631/1‑91 (MQ=255) atcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAgg < 1:2620229/91‑1 (MQ=255) tcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATAGGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTGAAGAGGt < 1:3365027/91‑1 (MQ=255) tcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTTTTCAGAGGt > 1:3726274/1‑91 (MQ=255) tcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGt < 1:2597211/91‑1 (MQ=255) tcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGt > 2:2903777/1‑91 (MQ=255) tcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGt < 1:80340/91‑1 (MQ=255) tcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGt < 2:2500242/91‑1 (MQ=255) tcttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTGAAGAGGt < 2:3238111/91‑1 (MQ=255) cttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGtt < 2:1671218/91‑1 (MQ=255) ttatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCCGAGGTTa > 2:448382/1‑91 (MQ=255) tatcATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTaa > 2:3705890/1‑91 (MQ=255) tcatcaATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAAtt > 1:2490119/1‑91 (MQ=255) tcatcaATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAAtt > 1:505974/1‑91 (MQ=255) caATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTc > 1:2927120/1‑91 (MQ=255) aaTTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCa < 1:2785654/91‑1 (MQ=255) aTTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCAc < 2:2034818/91‑1 (MQ=255) tttttCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCAcc > 1:1863117/1‑91 (MQ=255) tCTTTTGGGTTCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatt > 2:239784/1‑91 (MQ=255) tCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatt < 2:3056926/91‑1 (MQ=255) cTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTCCAGAGGTTAATTTTTCACCAattt > 2:3604760/1‑91 (MQ=255) ttttGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatttc < 1:1560222/91‑1 (MQ=255) ttttGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAat > 2:2464082/1‑88 (MQ=255) ttttGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAat < 1:2464082/88‑1 (MQ=255) tttGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatttca > 2:3488742/1‑91 (MQ=255) tttGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatttca > 2:3489016/1‑91 (MQ=255) ttGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatttcat > 1:868031/1‑91 (MQ=255) ttGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatttcat > 2:1652885/1‑91 (MQ=255) ttGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTGCACCAatttcat < 1:2990946/91‑1 (MQ=255) tGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatttcatt > 1:1196459/1‑91 (MQ=255) ggATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatttcatttc < 1:252612/91‑1 (MQ=255) ggATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAatttcatttc < 2:2388323/91‑1 (MQ=255) gATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTcc < 2:568938/91‑1 (MQ=255) gATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTcc < 1:2928370/91‑1 (MQ=255) aTCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCa > 1:893577/1‑91 (MQ=255) cTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAAc < 1:1489929/91‑1 (MQ=255) tGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAAct > 1:2606763/1‑91 (MQ=255) gTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAActt < 2:1185276/91‑1 (MQ=255) gTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAActt > 1:3280084/1‑91 (MQ=255) gTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAActt < 2:3119389/91‑1 (MQ=255) ttCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAActtct > 1:3087382/1‑91 (MQ=255) tCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAActtctt > 1:476232/1‑91 (MQ=255) tCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAActtctt < 1:1006286/91‑1 (MQ=255) aaGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTgc < 2:2683899/91‑1 (MQ=255) aaGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTgc > 1:1603324/1‑91 (MQ=255) aaGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCCTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTgc < 2:2038368/91‑1 (MQ=255) ttACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCtt > 1:696199/1‑91 (MQ=255) tACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCttt < 1:2739611/91‑1 (MQ=255) tACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCttt > 1:937898/1‑91 (MQ=255) tACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCttt < 1:962846/91‑1 (MQ=255) tACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCttt > 1:1317688/1‑91 (MQ=255) cTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCttttt > 2:328079/1‑91 (MQ=255) tttCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCtttttt > 2:2341820/1‑91 (MQ=255) tCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTcc > 1:1684090/1‑91 (MQ=255) cATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCa < 1:3551156/91‑1 (MQ=255) cATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCa > 1:775188/1‑91 (MQ=255) aTACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCACTTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAg > 1:1053902/1‑91 (MQ=255) aCGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGtt > 1:3121706/1‑91 (MQ=255) gcgcCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGt > 2:1984500/1‑91 (MQ=255) gcgcCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGt < 1:178203/91‑1 (MQ=255) cgcCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCTCTTTTTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGtt > 2:1591117/1‑90 (MQ=255) cgcCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGtc < 1:615606/91‑1 (MQ=255) ccACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGtctc < 1:3246833/91‑1 (MQ=255) cACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTcc > 1:2028283/1‑91 (MQ=255) aCCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTcc < 1:2352999/60‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCaa > 2:1350452/1‑91 (MQ=255) ccTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCaa < 1:1123398/91‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCaa > 1:640940/1‑91 (MQ=255) tCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTa > 2:1470989/1‑91 (MQ=255) ttAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTAtg > 1:1388437/1‑91 (MQ=255) tAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTAtgt < 2:1266387/91‑1 (MQ=255) tAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTAtgt < 1:126397/91‑1 (MQ=255) aaTTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTAtgtg > 2:2333009/1‑91 (MQ=255) aaTTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTAtgtg < 2:577580/91‑1 (MQ=255) aTTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGc < 1:1608402/91‑1 (MQ=255) ttCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGcc < 2:3087197/91‑1 (MQ=255) ttCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGcc < 2:102420/91‑1 (MQ=255) tCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCa > 2:3466567/1‑91 (MQ=255) cATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCAt < 2:1900525/91‑1 (MQ=255) cTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATcgc > 1:3793085/1‑91 (MQ=255) cTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATcgc > 1:2216917/1‑91 (MQ=255) cTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATcgc < 1:209092/91‑1 (MQ=255) ttaACCTCTGAAGAGGTTAATTTTTCTCCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGt > 2:2212693/2‑91 (MQ=255) ataACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGt > 2:2080675/1‑91 (MQ=255) aaCCTCTGAAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGa > 1:3270590/1‑91 (MQ=255) aCCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGAt > 1:1167408/1‑91 (MQ=255) aCCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGAt < 2:1267369/91‑1 (MQ=255) aCCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGAt > 1:2113348/1‑91 (MQ=255) aCCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGAt > 1:2495782/1‑91 (MQ=255) aCCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGAt < 1:3058933/91‑1 (MQ=255) aCCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGAt > 1:3345444/1‑91 (MQ=255) aCCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGAt < 1:3542203/91‑1 (MQ=255) aCCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGAt < 2:1397309/91‑1 (MQ=255) ccTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGATa < 2:893338/91‑1 (MQ=255) ccTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGATa > 2:958792/1‑91 (MQ=255) ctctTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCTCGTGATAc > 2:1809608/1‑91 (MQ=255) tctTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGATACa > 2:1304735/1‑91 (MQ=255) ctTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATATGCCTTCGCATGATActt > 2:3365522/1‑89 (MQ=255) | TTTATCTTATCATCAATTTTTCTTTTGGGATCTGTTTCAAGTTTACTTTCATACGCGCCACCTTTTCTTAATTCATCTATAACCTCTTCAGAGGTTAATTTTTCACCAATTTCATTTCCAACTTCTTGCGCTTTTTTCCAGTTGTCTCCAAATTTATGTGCCATCGCGTGATACATTT > USA300TCH1516_ALE/2611795‑2611972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |