| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,653,200 | A→G | 5.1% | M591V (ATG→GTG) | fbp → | Fructose‑1,6‑bisphosphatase class 3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,653,200 | 0 | A | G | 5.1% | 695.2 / 15.0 | 216 | M591V (ATG→GTG) | fbp | Fructose‑1,6‑bisphosphatase class 3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (120/85); new base G (2/9); total (122/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
AAGATGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGCGTCGTAGATA > USA300TCH1516_ALE/2653110‑2653290 | aaGATGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTa > 1:921519/1‑91 (MQ=255)aaGATGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTa > 2:3511060/1‑91 (MQ=255) gATGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATg > 2:285933/1‑91 (MQ=255) gATGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATg > 2:286856/1‑91 (MQ=255) aTGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGc < 2:528306/91‑1 (MQ=255) aTGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGc < 2:2175701/91‑1 (MQ=255) tGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCa > 1:844520/1‑91 (MQ=255) tGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCa > 1:2110582/1‑91 (MQ=255) tGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCa > 2:2170250/1‑91 (MQ=255) gtttGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCaa < 2:275961/89‑1 (MQ=255) cTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAAc > 2:552213/1‑91 (MQ=255) ttGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACt > 1:1147305/1‑91 (MQ=255) tGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAAcga < 2:3858624/91‑3 (MQ=255) tGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTc < 1:2785904/91‑1 (MQ=255) tGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTc < 1:419517/91‑1 (MQ=255) tGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATGGTATAATTCATTCGGTATGCAACTc < 2:2701754/91‑1 (MQ=255) gTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTGTGCAAcgag < 1:3561135/91‑4 (MQ=255) gTCATTGATGGCGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACATTGTTGTATAATTCATTCGGAATGCAACTCg < 2:1161636/91‑1 (MQ=255) tCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGt > 2:1389704/1‑91 (MQ=255) cATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGtt > 2:3547796/1‑91 (MQ=255) cATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGtt > 1:3570559/1‑91 (MQ=255) ttGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTGTGCAACGAGTTGc < 2:1420159/91‑1 (MQ=255) tGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGca > 2:1668502/1‑91 (MQ=255) gtggCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACca < 2:244264/91‑1 (MQ=255) tggCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACcaa < 1:53097/91‑1 (MQ=255) ggCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACcaac < 1:239268/91‑1 (MQ=255) ggCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACcaac > 2:772779/1‑91 (MQ=255) tttCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTCTTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAAtt > 1:3074783/1‑91 (MQ=255) tttCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAAtt > 1:145584/1‑91 (MQ=255) aaaaGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAAc > 1:2387248/1‑91 (MQ=255) aaaaGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAAc > 2:1282945/1‑91 (MQ=255) aaaGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACg < 2:1051111/91‑1 (MQ=255) aaGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGc < 2:1517026/91‑1 (MQ=255) aaGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGc < 1:3821819/91‑1 (MQ=255) gCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTa > 2:3077642/1‑91 (MQ=255) gCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTa > 2:713658/1‑91 (MQ=255) gCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTa > 2:906242/1‑91 (MQ=255) ttATCAGTCAACAACTGGCCTTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTaaa > 2:1026670/1‑91 (MQ=255) ttATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTaaa > 1:1084217/1‑91 (MQ=255) ttATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTaaa > 1:1083974/1‑91 (MQ=255) ttATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTaaa > 1:3255457/1‑91 (MQ=255) tATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAg > 2:1561214/1‑91 (MQ=255) tATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAg > 2:48883/1‑91 (MQ=255) aTCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGa < 1:1557646/91‑1 (MQ=255) tCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGaa > 2:159283/1‑91 (MQ=255) tCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGaa > 1:2212362/1‑91 (MQ=255) tCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGaa > 2:859866/1‑91 (MQ=255) cAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGaaa > 1:2544536/1‑91 (MQ=255) cAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGAACACCAACAATTTAACGCTAAAGaaa > 1:1871256/1‑91 (MQ=255) aGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGaaaa < 2:1951141/91‑1 (MQ=255) gTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGaaaaa < 1:463020/91‑1 (MQ=255) tCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGaaaaaa < 1:2660821/91‑1 (MQ=255) aacaacTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATa > 2:3166495/1‑91 (MQ=255) acaacTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAAAAAAAAAAAAAAAATAc < 2:2808777/91‑1 (MQ=255) acaacTGGCATTGCAGGCTATACACGATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATAc < 1:3600927/91‑1 (MQ=255) caacTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACt < 2:2065164/91‑1 (MQ=255) acTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACttt > 1:2551580/1‑91 (MQ=255) cTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACttcc > 1:3796320/1‑89 (MQ=255) cTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTc > 1:2123987/1‑91 (MQ=255) cTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTc < 1:1097938/91‑1 (MQ=255) tGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTcc < 2:3470893/91‑1 (MQ=255) ggCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCg > 1:2663573/1‑91 (MQ=255) gCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGa > 2:902141/1‑91 (MQ=255) ttGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAgg > 1:3721407/1‑91 (MQ=255) tGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGt > 2:360648/1‑91 (MQ=255) ggCTATATACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAAAAAAAATACTTTCCGAAGGTCTCg < 2:3440247/91‑1 (MQ=255) aattataCAATAGTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCg > 1:1837825/4‑91 (MQ=255) gCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGa > 1:3234334/1‑91 (MQ=255) ataCACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGa > 1:3423784/1‑91 (MQ=255) acTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACtt > 2:1177657/1‑91 (MQ=255) acTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACtt < 1:2616458/91‑1 (MQ=255) tATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTc > 1:1903201/1‑91 (MQ=255) tATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTc > 1:256135/1‑91 (MQ=255) tataATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATg > 2:966494/1‑79 (MQ=255) tataATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATg < 1:966494/79‑1 (MQ=255) ataATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATaaa < 2:2187689/91‑1 (MQ=255) ataATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATaaa < 1:1967638/91‑1 (MQ=255) ataATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATaaa < 2:2002930/91‑1 (MQ=255) ataATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATaaa < 2:1674648/91‑1 (MQ=255) taATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAg < 2:3244343/91‑1 (MQ=255) aaTTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAgc < 1:693749/91‑1 (MQ=255) aaTTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAgc < 1:285933/91‑1 (MQ=255) aaTTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAgc < 1:286856/91‑1 (MQ=255) attcattcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAGAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAgcg > 2:3417449/1‑91 (MQ=255) attcattcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAgcg > 2:2581212/1‑91 (MQ=255) attcattcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAgcg > 1:1648018/1‑91 (MQ=255) tccattcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAgcgc < 1:1424202/89‑1 (MQ=255) tcattcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGcgcg > 1:822375/1‑91 (MQ=255) tcattcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGcgcg > 1:1304977/1‑91 (MQ=255) attcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGcgtc > 2:2051326/1‑91 (MQ=255) ttcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGcgtcg > 1:98505/1‑91 (MQ=255) ttcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGcgtcg < 2:3775579/91‑1 (MQ=255) tcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGcgtcgt > 1:2790536/1‑91 (MQ=255) tcGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGcgtcgt < 1:1667830/91‑1 (MQ=255) ggTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGCGTCGTAg > 1:1212136/1‑91 (MQ=255) gTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGCGTCGTAGa > 2:1888400/1‑91 (MQ=255) gTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGCGTCGTAGa < 2:1147305/91‑1 (MQ=255) tATGCAACTCGTTGGACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGCGTCGTAGAt > 2:3295605/1‑91 (MQ=255) tATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGCGTCGTAGAt < 1:5842/91‑1 (MQ=255) aTGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGCGTCGTAGATa < 1:1707047/91‑1 (MQ=255) | AAGATGCTTGTCATTGATGGTGGCTTTTCAAAAGCTTATCAGTCAACAACTGGCATTGCAGGCTATACACTATTGTATAATTCATTCGGTATGCAACTCGTTGCACACCAACAATTTAACGCTAAAGAAAAAATACTTTCCGAAGGTATCGATGAACTTTCTATAAAGCGCGTCGTAGATA > USA300TCH1516_ALE/2653110‑2653290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |