| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
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aTAGCGTGAGCTATTAAGCCGATCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGTACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAat < 1:209228/135‑1 (MQ=255) aTAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAat > 1:516308/1‑135 (MQ=255) gCTATTATGCGGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGaa > 2:550440/1‑135 (MQ=255) gCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGaa > 2:459030/1‑135 (MQ=255) aTTAAGCCGACCATTCGACAAGATTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCGCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGa > 1:395987/1‑135 (MQ=255) tAAGCCGACCATTCGACAAGATTTGAGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAgg > 1:181160/1‑135 (MQ=255) aGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGgtg < 2:584472/135‑1 (MQ=255) aGCCGACAATTCGACAAGTTTTGGTATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGgtg < 2:275456/135‑1 (MQ=255) cATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAACCATATAAGTTATAATCCATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATg < 2:330815/135‑1 (MQ=255) catgTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCaaa > 1:145708/4‑135 (MQ=255) aGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATT‑TTCCCTATGGTTTTAATGATGTGTATTATGATTCAAACg < 1:458135/135‑1 (MQ=21) gTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACgg < 1:341134/135‑1 (MQ=255) tttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAACAGgtt > 2:191714/1‑135 (MQ=255) tttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGgtt > 2:12208/1‑135 (MQ=255) ttGGGATTTCTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGATTGAGGTGTATTATGATTCAAACGgttg < 1:493311/135‑1 (MQ=255) ttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGgttg < 2:400346/135‑1 (MQ=255) ttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGgttg < 1:590057/135‑1 (MQ=255) ttGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGgttg < 1:325294/135‑1 (MQ=255) | GAAGTGTCTCCATGTCTACGCATAGACACGCATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATAT‑TTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTG > CP000731/4247‑4515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |