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ttATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCa < 2:83248/141‑1 (MQ=255) aTTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACTCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGa > 2:500320/1‑141 (MQ=255) tttttGTGAAAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGAc < 1:162925/141‑1 (MQ=255) ttttGTGACAcaatatattgcgtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttg > 1:30925‑M1/1‑10 (MQ=255) tttGTGACAcaatatattgcgtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataataaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttcc > 2:736703‑M1/1‑9 (MQ=255) tttGTGACAcaatatattgcgtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttct > 1:326071‑M1/1‑9 (MQ=255) tttGTAACAtaatatattgcgtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgc < 2:184727‑M1/141‑133 (MQ=255) ttGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAACCCCCTGGATTCTCTGGCTTTGCCAGACCTa < 2:356117/141‑1 (MQ=255) tgtgACAcaatatattgcgtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgctt > 2:770571‑M1/1‑7 (MQ=255) tgtgACAACTGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTAt > 2:158528/1‑141 (MQ=255) tgtgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTAt > 2:223546/1‑141 (MQ=255) gtgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc < 1:717258/141‑1 (MQ=255) tgACAcaatatattgcgtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgctttt > 2:120477‑M1/1‑5 (MQ=255) aCAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGACTTTCTGGCTTTGCCAGCCCAATCCtt > 2:686750/1‑141 (MQ=255) aCAAATGCTGTATGTAGTGCCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACCGAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATTATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAtt < 2:337558/141‑1 (MQ=255) cacaatatattgcgtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaacaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcga < 1:13497‑M1/141‑140 (MQ=255) cAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAttt > 1:420533/1‑141 (MQ=255) | CAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTT > NC_012417/917‑1197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |