| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,135,045 | G→A | 5.3% | R55C (CGT→TGT) | USA300HOU_RS05620 ← | Nicotinamide‑nucleotide adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,135,045 | 0 | G | A | 5.3% | 228.8 / 2.8 | 76 | R55C (CGT→TGT) | USA300HOU_RS05620 | Nicotinamide‑nucleotide adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/39); new base A (2/2); total (35/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.23e-01 | |||||||||||
ACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGAAAGGGATTATAT > USA300TCH1516_ALE/1134905‑1135181 | aCTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTCATAATGCCATTTTTGCACg < 1:577712/141‑1 (MQ=255) cTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGa > 1:147561/1‑141 (MQ=255) ccAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGGTGATAATGCAATTTTTGCACGGGTa > 2:12368/1‑141 (MQ=255) aaaTGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATCACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTaaa > 2:54034/1‑141 (MQ=255) aaaTGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTaaa > 2:462120/1‑141 (MQ=255) aaTGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAAc > 2:202257/1‑141 (MQ=255) aaTGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAAc > 2:655937/1‑141 (MQ=255) aaTGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACAAGTAAAc > 2:143334/1‑141 (MQ=255) aaTGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACAAGTAAAc > 2:720877/1‑141 (MQ=255) aaTTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACttatt < 2:289342/141‑1 (MQ=255) tATCGACACTCATATACTCTGCGACTTTAACTGCCCGTTCGGCAAGTTGTTCACCAGCTTATAAACATTCAGTTACCGCTTCTTCGACAGCTAAATCTTTTCGTGATGATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGa < 2:181488/141‑1 (MQ=255) tATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGa > 1:88711/1‑141 (MQ=255) gattgACACTCATATAAGCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGa < 2:101518/137‑1 (MQ=255) cacTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTg < 1:655937/141‑1 (MQ=255) cTCCTATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGt < 1:247831/141‑1 (MQ=255) cATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTc < 1:158004/141‑1 (MQ=255) cATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAAATGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTGGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTc > 2:258564/1‑141 (MQ=255) atatAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCg > 2:496590/1‑141 (MQ=255) tctaATCTGCGACTTTAACTGCGAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGCTAATGCCATTTTTGCACGAGTAACCTTATTATAGATTGCTGGTTCGc < 2:623722/139‑1 (MQ=255) tataATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGc < 1:128137/141‑1 (MQ=255) ataATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGcc < 1:517899/141‑1 (MQ=255) cTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCa > 1:93177/1‑141 (MQ=255) cTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCa > 1:628412/1‑141 (MQ=255) cTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCa > 2:723594/1‑141 (MQ=255) cTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCa > 1:12552/1‑141 (MQ=255) caCTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGAc < 1:12368/140‑1 (MQ=255) cTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATCATGCTTTTTTTCGACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACaa < 2:278763/141‑1 (MQ=255) ttAACTGCTAGTTCGGCAAAATGGTCTCCAGATGATAACCTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAg < 2:122827/141‑1 (MQ=255) aaCTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAATTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGtt < 1:497978/141‑1 (MQ=255) aaCTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGtt > 1:715168/1‑141 (MQ=255) aCTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTTCTCGTTTTTTCTTATTATAGATTGCTGGTTAGCCACGCATGACAAAGTTa > 2:689608/1‑141 (MQ=255) aCTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTa > 2:689626/1‑141 (MQ=255) ttggTTCCGCAATATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTTGTTCGATAACTATATCATCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTCGAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCAc < 2:47811/138‑1 (MQ=255) tAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAATTGGCAGTTGCTGGTAGTGAGATAACTAAAACAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCAcc > 2:162595/1‑140 (MQ=255) tAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCAcc > 2:8992/1‑140 (MQ=255) tAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACt < 1:403209/141‑1 (MQ=255) aGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATATTTGACAGAGTTAACTTATGATAGATTGCTTGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTc < 2:546208/141‑1 (MQ=255) tCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCatt < 1:699551/141‑1 (MQ=255) tCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCatt < 2:118148/141‑1 (MQ=255) ctgCAAAATGATCCCCAGATGAGAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAAATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCatta < 2:692270/139‑1 (MQ=255) ggCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAACCTTATTTTAGATTGCTGGTTGGCACCGCATGACAAAGTTACAACTCattat > 1:595113/1‑141 (MQ=255) aaaaTGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGc < 1:160446/141‑1 (MQ=255) aaTGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGATGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCaa > 2:766004/1‑141 (MQ=255) tGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAGAGTTACCACGCATAATTGCAATa > 1:448575/1‑141 (MQ=255) aTCGACAGATGAGAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCCGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACATATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGt < 1:762353/141‑1 (MQ=255) cGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCA‑TTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAAc < 2:675826/141‑1 (MQ=255) gCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAAc > 2:329307/1‑141 (MQ=255) atAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACAAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCAt < 1:143334/141‑1 (MQ=255) atAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACAAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCAt < 1:720877/141‑1 (MQ=255) tAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAACCTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCAtt < 2:620059/141‑1 (MQ=255) tAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCAtt < 2:521974/141‑1 (MQ=255) ttGGCAGTTGCGGGTGGTTGGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTGTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACGCATTATTGCACTAGTAACGTCAGCATTTGTa < 2:335826/140‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTGCTGTTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTa < 2:624074/141‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCCCGCATGACAATGTCACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTa < 1:408675/141‑1 (MQ=255) tGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTaa < 1:258564/141‑1 (MQ=255) ttGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGttttt < 1:272221/141‑1 (MQ=255) ttGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTGGTAAGttttt > 2:734019/1‑141 (MQ=255) ggcgggTAGGTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGtttttt < 2:379571/137‑1 (MQ=255) ggTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAgat > 1:344388/1‑141 (MQ=255) gTAGTTCGATAAGTAAATCAGCTGTTGATAATTGCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCACGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCCTTTGTAAGTTTTTTAgatt < 2:433140/141‑1 (MQ=255) ttCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAgattgatt < 2:173043/141‑1 (MQ=255) cGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGGTTaa > 1:648950/1‑141 (MQ=255) accTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATg < 2:637496/139‑1 (MQ=255) aaaaGCAGCGTTTGATAATGTCATTTTTGTACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGata < 2:215113/140‑1 (MQ=255) aTCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTg > 2:56823/1‑141 (MQ=255) cAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGAt < 2:528930/141‑1 (MQ=255) cTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGcc < 1:428592/141‑1 (MQ=255) gTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCa > 2:678726/1‑141 (MQ=255) tAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATg < 2:250872/141‑1 (MQ=255) tttttGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGAAAGGGAt < 1:766004/141‑1 (MQ=255) ttttGCACGCGTACACTTTTCACGGCTTGTTTGTTCGCCCCGCATGTCTCCGCCACGACCGATTATTGCGATTTTAACGTCAACATTTGTAAGTTTTGTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGAAAGGGAtt < 2:448575/141‑1 (MQ=255) tttGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGCACGGGAGta > 2:726563/1‑141 (MQ=255) tttGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGAAAGGGATta > 1:586582/1‑141 (MQ=255) ttGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGAAAGGGATtat > 1:360558/1‑141 (MQ=255) gCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTGGAGGGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGAAAGGGATTatat > 1:294654/1‑141 (MQ=255) gCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATTGCCATTATGAAGAGGATTatat > 2:434845/1‑141 (MQ=255) gCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGAAAGGGATTatat > 2:235075/1‑141 (MQ=255) | ACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGCAGTTGCTGGTAGTTCGATAACTAAATCAGCTGTTGATAATGCCATTTTTGCACGAGTAAACTTATTATAGATTGCTGGTTCGCCACGCATGACAAAGTTACCACTCATTATTGCAATAGTAACGTCAGCATTTGTAAGTTTTTTAGATTGATTAATATGATATTGATGCCCATTATGAAAGGGATTATAT > USA300TCH1516_ALE/1134905‑1135181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |