| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,005,078 | T→C | 6.0% | I508T (ATT→ACT) | pepF1_1 → | Oligoendopeptidase F, plasmid |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,005,078 | 0 | T | C | 6.0% | 199.0 / 3.3 | 67 | I508T (ATT→ACT) | pepF1_1 | Oligoendopeptidase F, plasmid |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (21/42); new base C (2/2); total (23/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
AATGTTCGCAGAATTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGTAGATAGATATATTAAT > USA300TCH1516_ALE/1004941‑1005217 | aaTGTTCGCAGAATTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAg < 1:133637/141‑1 (MQ=255) tGTTCGCAGAAGTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTa < 1:391044/141‑1 (MQ=255) tCGCAGAATTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATAGTTCGGTGACTCAGTGTTATTGGATGAAGATATTTGTAAgg < 1:510680/141‑1 (MQ=255) tCGCAGAATTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAgg < 1:383067/141‑1 (MQ=255) tCGCAGAATTTGAGCACAAAAGTCAAGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAgg < 1:179696/141‑1 (MQ=255) gCAGAATTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTCAGGaa > 2:399590/1‑141 (MQ=255) aTTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTc > 1:561940/1‑141 (MQ=255) tGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACg < 2:8644/141‑1 (MQ=255) tGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACg > 1:409778/1‑141 (MQ=255) tGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATACTAGTAAGGAATGGTCACg > 2:195985/1‑141 (MQ=255) tGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATACTAGTAAGGAATGGTCACg > 2:637924/1‑141 (MQ=255) gCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTAt < 1:672953/141‑1 (MQ=255) aTAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTc < 2:304432/141‑1 (MQ=255) aaaaGTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCca < 2:442064/141‑1 (MQ=255) aaaCTCATGCAATTGAAGCAGCGGATGTACCATTAACGCCAACGAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCcac < 2:660534/141‑1 (MQ=255) ttCCTGCAATGGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACt < 1:287942/141‑1 (MQ=255) tCAGGCAATTGAATAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACtt < 2:276879/141‑1 (MQ=255) cATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTc < 2:188068/141‑1 (MQ=255) cATGCAAGTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTTATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTc < 2:356998/141‑1 (MQ=255) aTGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCAAACTTCt > 2:340543/1‑141 (MQ=255) tGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCta > 2:673688/1‑141 (MQ=255) tGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCta < 2:617594/141‑1 (MQ=255) tGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCta < 2:653933/141‑1 (MQ=255) aTTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGCAAATGCCTGGGGAAAGAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTTCACACTTCTATATg < 1:364521/141‑1 (MQ=255) gaagaaGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAat < 2:358279/141‑1 (MQ=255) gaagaaGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAat < 1:594383/141‑1 (MQ=255) aagaagCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATACTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAatt < 1:637924/141‑1 (MQ=255) aagaagCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATACTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAatt < 1:195985/141‑1 (MQ=255) agCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAAttatta < 1:75333/141‑1 (MQ=255) cAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATg > 2:414600/1‑141 (MQ=255) cAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATg > 1:59806/1‑141 (MQ=255) tAGAATGAATGAGGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAGACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTa > 1:268398/1‑141 (MQ=255) tAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAGCTGGTTa > 1:110276/1‑141 (MQ=255) tAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTa > 1:659966/1‑141 (MQ=255) tAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATAAATACGCCACAGGTTa > 2:131738/1‑141 (MQ=255) tAGAATGAATGAAGAAGATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGCATTATTATGTATATCAATACACAACTGGTTa > 1:110239/1‑141 (MQ=255) tgaatgaaGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTCCAGTg > 1:667220/1‑141 (MQ=255) gaatgaaGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGc < 1:590339/141‑1 (MQ=255) atgaaGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTGCATTGCAg > 1:613772/1‑141 (MQ=255) atgaaGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAg < 1:170903/141‑1 (MQ=255) tgaaGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGc < 2:409778/141‑1 (MQ=255) aagaaTATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTc < 2:513437/141‑1 (MQ=255) aagaaTATGCCAAATTAAATAAATAATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTc > 1:506941/1‑141 (MQ=255) agaaTATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACCGTGCAGCCCa > 2:28198/1‑141 (MQ=255) tGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATCTTCGCAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCtt > 1:334088/1‑141 (MQ=255) aTTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGtca < 2:571142/141‑1 (MQ=255) atattCTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATGAGTAAGGTATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGAAACTTCTTACCGGGCAGTTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTa < 2:252684/140‑1 (MQ=255) tgctgctaTTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGaa < 2:307710/134‑1 (MQ=255) ggTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATTTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGt < 2:498812/141‑1 (MQ=255) tGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCTCGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTaa < 1:470333/141‑1 (MQ=255) tCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCGCGTATTCCACACTTCTGTATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGCCATCAACTTTTAACACAAGGTAAGAca > 2:400731/1‑141 (MQ=255) tCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCca < 1:673688/141‑1 (MQ=255) gTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGTAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCcagca < 1:642912/141‑1 (MQ=255) gTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCcagca < 1:391553/141‑1 (MQ=255) gTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCcagca < 1:593655/141‑1 (MQ=255) gTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGATAAGCcagca < 1:503286/141‑1 (MQ=255) gTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCAACCAATAATAACAGAAGGTAAGCcagca > 2:518055/1‑141 (MQ=255) tAGAAACTGATGAAGATATTAGTCAGGAATGCGCACGGATTCCACACCTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGACGGTAAGCcagcag < 2:315265/141‑1 (MQ=255) tAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGTCAAGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCcagcag < 2:315321/141‑1 (MQ=255) gaGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCcagcag < 2:281501/140‑1 (MQ=255) gaGAAACCGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGGCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCcagcag < 2:422004/140‑1 (MQ=255) aGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGGATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGt < 2:66564/141‑1 (MQ=255) aaCTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTATCAGAAGGTAAGCCAGCAGtagg < 2:506941/141‑2 (MQ=255) tgatgaAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACATTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCTAAGTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGtagatag < 2:29792/141‑1 (MQ=255) tgatgaAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCagaagaaaa > 2:605748/1‑138 (MQ=255) tgaAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGTAgatagata > 1:397994/1‑141 (MQ=255) taaGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGTAGATAGatat < 2:20350/140‑1 (MQ=255) aatatTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATTTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTCAGCCAGCTGTAGATAGATATAtt < 2:669594/140‑1 (MQ=255) atTAGTAAGTAATGGTCACGTATTCCCCACTTCGCTATGTATTACTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGTTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGTAGATAGATATATTAAt < 2:537908/141‑1 (MQ=255) | AATGTTCGCAGAATTTGAGCATAAAATTCATGCAATTGAAGAAGCAGGTGAACCATTAACGCCAACTAGAATGAATGAAGAATATGCCAAATTAAATAAATTATACTTCGGTGATTCTGTAGAAACTGATGAAGATATTAGTAAGGAATGGTCACGTATTCCACACTTCTATATGAATTATTATGTATATCAATACGCAACTGGTTACAGTGCAGCTCAAAGCTTAAGTCATCAAATTTTAACAGAAGGTAAGCCAGCAGTAGATAGATATATTAAT > USA300TCH1516_ALE/1004941‑1005217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |