Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*USA300TCH1516_ALE512,6430AG46.3% 33.3 / 226.2 176intergenic (+711/‑6052)recR/speA_2Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (48/46);  new base G (45/36);  total (94/82)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.49e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 183 total aligned reads displayed.

GGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACATCATAA  >  USA300TCH1516_ALE/512504‑512783
                                                                                                                                           |                                                                                                                                            
 gtgtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaat                                                                                                                                            <  2:795016/141‑1 (MQ=255)
   gaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTACATGTtgataa                                                                                                                                          <  1:743972‑M1/28‑1 (MQ=255)
     agttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATaaaa                                                                                                                                        <  1:461345‑M1/30‑1 (MQ=255)
     agttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggctaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATaaaa                                                                                                                                        <  1:493499‑M1/30‑1 (MQ=255)
       ttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATg                                                                                                                                      >  1:786238‑M1/110‑141 (MQ=255)
         tttACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGta                                                                                                                                    <  1:584389/141‑1 (MQ=255)
         aagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttcagctagtgtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAATTGta                                                                                                                                    >  1:700451‑M1/108‑141 (MQ=255)
          ttgcttgtgttAAGCATATTGAAATCCTGAATAGTATTTATTTTTCGAGTCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGtat                                                                                                                                   <  2:810439/134‑1 (MQ=255)
             cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTTTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat                                                                                                                                >  2:369930/1‑141 (MQ=255)
             cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat                                                                                                                                >  1:532114/1‑141 (MQ=255)
              tgtaattAAGAAATTTTAAAGCCTGTATAGTATTAATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACCCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAAAAAATATAAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt                                                                                                                               <  2:922005/136‑1 (MQ=255)
               gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTTtatttt                                                                                                                              >  2:245725/1‑140 (MQ=255)
                ttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaa                                                                                                                             >  1:245639‑M1/101‑141 (MQ=255)
                           tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATGTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                                                  <  2:421046/141‑1 (MQ=255)
                           ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATACTTGTCGGt                                                                                                                  <  1:447202‑M1/52‑1 (MQ=255)
                               aaaGCTTGTAAAGTATTAATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTACAATTTATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                                              <  1:509098/141‑1 (MQ=255)
                               aaaGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAGTTAATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                                              >  1:639001/1‑141 (MQ=255)
                                     cttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggtaaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATg                                                                                                        <  1:342105‑M1/62‑1 (MQ=255)
                                       tataGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                                                      >  2:412070/1‑141 (MQ=255)
                                        acgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAc                                                                                                     >  1:962813‑M1/77‑141 (MQ=255)
                                         cgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTGGGTAAGAAAAATGAACa                                                                                                    <  1:365148‑M1/66‑1 (MQ=255)
                                          gttctgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAt                                                                                                   >  2:524361‑M1/75‑141 (MQ=255)
                                          gttacgatagaggagaacgtggtcagtcagttttttaatccaattatcgttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGAGAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTATGAAAAATGAACAt                                                                                                   >  2:946029‑M1/75‑141 (MQ=255)
                                            tccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 >  2:950600‑M1/73‑141 (MQ=255)
                                            tatttattTGTTTAGGCAAATAAAACAATTATACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 <  1:300810/141‑1 (MQ=255)
                                            tatttattTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 <  2:594475/141‑1 (MQ=255)
                                            tattgattGGTGGAGGCAAACAAAACAAGTAAACTTAAGAAATAACTTGAATTAGTAACGAAAATTAAGTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                                                 <  2:483197/141‑1 (MQ=255)
                                             atttatttCTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGa                                                                                                <  2:762565/141‑1 (MQ=255)
                                                 tagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc                                                                                            >  1:82072‑M1/68‑141 (MQ=255)
                                                  tttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           <  1:855688/141‑1 (MQ=255)
                                                  tttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           <  1:102679/141‑1 (MQ=255)
                                                  tagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                                           >  1:848062‑M1/67‑141 (MQ=255)
                                                   ttgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGGAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATAAAAATTGAAAACTg                                                                                          >  2:874142/1‑141 (MQ=255)
                                                   ttgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                                          >  1:989926/1‑141 (MQ=255)
                                                       agaacgtgacctggcagtttttttatcaatgtttggttaaaaaataaaatggaatagataaAAAAAGTTATTTACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAACACTGAATg                                                                                      >  2:899180‑M1/62‑141 (MQ=255)
                                                          ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACa                                                                                   >  2:266597/1‑141 (MQ=255)
                                                          ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACa                                                                                   >  1:950385/1‑141 (MQ=255)
                                                          ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTAAAATACTAAAGAAAATTAATTATAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTATTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACAGAATAACa                                                                                   >  2:315529/1‑141 (MQ=255)
                                                           gCAAACAATACAACTCAACTTTAGAAATAAATTGAATTACTAACGAAAAAAAATAAAAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAACAAGTTGTTTTGTTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACaa                                                                                  <  2:391763/141‑1 (MQ=255)
                                                           gCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATTACaa                                                                                  <  2:362463/141‑1 (MQ=255)
                                                           cgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACaa                                                                                  >  1:909750‑M1/58‑141 (MQ=255)
                                                                 aaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTc                                                                            <  2:640658/141‑1 (MQ=255)
                                                                  aggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                                           >  1:964564‑M1/51‑141 (MQ=255)
                                                                  aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                                           <  1:638216/141‑1 (MQ=255)
                                                                      aggtttttaataaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt                                                                       >  1:104790‑M1/47‑141 (MQ=255)
                                                                       actcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt                                                                      >  2:494794/1‑141 (MQ=255)
                                                                       actcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt                                                                      >  2:10863/1‑141 (MQ=255)
                                                                          ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagatcaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt                                                                   >  1:705089‑M1/43‑141 (MQ=255)
                                                                          ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt                                                                   >  1:417639‑M1/43‑141 (MQ=255)
                                                                          ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAAAAAAATGAACATTGAAAACTGAATAACAATATGTCAACGttatt                                                                   <  2:264593‑M1/99‑3 (MQ=255)
                                                                          ttttaatcaaattttggtcaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTAGTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt                                                                   >  1:811608‑M1/43‑141 (MQ=255)
                                                                            actTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTACTTc                                                                 >  1:374264/1‑141 (MQ=255)
                                                                            actTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTc                                                                 >  1:257397/1‑141 (MQ=255)
                                                                             ctTAAGAAATAACATGAATAACAAACGAAAAATAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAAATAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc                                                                <  2:676907/141‑1 (MQ=38)
                                                                               tAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                                              <  2:299227/141‑1 (MQ=255)
                                                                               tAAGAAATAACTTAAATTACTAATGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAATACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                                              <  1:245924/141‑1 (MQ=255)
                                                                               atcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                                              >  1:808210‑M1/38‑141 (MQ=255)
                                                                                 aGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTAAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAAAAAAATGAACATTGAAAACTAACTGACAATATGTCACCGTAAATTCCaaaa                                                            >  2:28011/1‑141 (MQ=255)
                                                                                  aaattttggttaaaaaataaaaaggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaa                                                           >  2:732729‑M1/35‑141 (MQ=255)
                                                                                      tttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGt                                                       <  2:823501‑M1/111‑1 (MQ=255)
                                                                                      tttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGt                                                       <  2:24299‑M1/111‑1 (MQ=255)
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                                                                                          ttGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATCAGACGTTGAAAGATGTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACt                                                   <  1:472908/141‑1 (MQ=25)
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                                                                                                                          ttATTGATTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCACCGTTAATTCCAAAAAACGTAACTAGAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAg                   <  1:173333/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           tATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACACTATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTCGTATTTATGAGc                  >  2:424635/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                           tATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACAATATTTAGTATTTATGAGc                  >  1:4501/1‑141 (MQ=255)
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                                                                                                                              tGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGACAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTaa               >  2:633768/1‑141 (MQ=255)
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                                                                                                                                           aataaAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACATCATaa  >  1:541070/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                           |                                                                                                                                            
GGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCTAATCAAACATCATAA  >  USA300TCH1516_ALE/512504‑512783

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑