| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,063,849 | C→T | D214N (GAC→AAC) | ywtF ← | Putative transcriptional regulator YwtF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,063,849 | 0 | C | T | 98.5% | 215.8 / NA | 68 | D214N (GAC→AAC) | ywtF | Putative transcriptional regulator YwtF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (31/36); total (31/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGC > USA300TCH1516_ALE/1063711‑1063986 | cAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAGGTTTg > 1:124309/1‑141 (MQ=255) agagTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGa > 2:613080/1‑141 (MQ=255) agttagttAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAAt < 1:323915/141‑1 (MQ=255) agttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGGTTTAAGTTGGAATCatg > 1:269348/1‑141 (MQ=255) gttaAATTAAGCTTTGCATTTTTACCTACAAGTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCACTTGAATAAAATTCTTGTGATTTTTGGATTAAAATCTTATTTAAATCAATTTGAAGTTGTCCACGTTTCAAGTTTGAATCatgt > 2:268992/1‑140 (MQ=255) ttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCatgat < 1:143085/141‑1 (MQ=255) aaaTTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGt < 2:751653/141‑1 (MQ=255) gCTTTGCATTGTTACCTACATTTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTATTTc > 2:337375/1‑141 (MQ=255) gCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCa < 1:297761/141‑1 (MQ=255) tttACCTACAATTTTAATCACGTTATCAAGTTTATCAACAGAAGCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGc < 2:393439/141‑1 (MQ=255) ttACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCt > 1:416828/1‑141 (MQ=255) aCCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTaa < 1:249072/141‑1 (MQ=255) aCCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTaa < 2:160155/141‑1 (MQ=255) tGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCGTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCCAGTTCTAGCAACTGCTCAAGCCtcatca > 1:562581/1‑141 (MQ=255) aaTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCAcc > 1:834594/1‑141 (MQ=255) accgcGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa < 2:562581/137‑1 (MQ=255) aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAGTAAAATCTTAATTAATTGCATTCGCCGTTGTACACGTTTTTAGTTTGAATAGTGATGTCTAGTTCTAGTAACTGCTAAGGTTtcatcaacc > 1:446464/1‑138 (MQ=255) aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAACATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAGGCCTCATCACCa > 1:981660/1‑141 (MQ=255) aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa > 2:115840/1‑141 (MQ=255) aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa > 1:956906/1‑141 (MQ=255) aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa > 1:910467/1‑141 (MQ=255) aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAAAATCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCAACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCa > 2:654581/1‑141 (MQ=255) cACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCAtt < 2:906169/141‑1 (MQ=255) aTCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAAttt > 1:621378/1‑141 (MQ=255) aTCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCCCATCACCATTTACttt > 2:663032/1‑141 (MQ=255) aGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTgg < 2:327461/141‑1 (MQ=255) tATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTAcc < 1:859605/141‑1 (MQ=255) tATCAATAGAAGCAACTTCCTGGGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTAcc < 1:744706/141‑1 (MQ=255) tCAATAGGATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCt < 2:708568/141‑1 (MQ=255) tCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCt < 2:877545/141‑1 (MQ=255) tCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGAAGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGGAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTTATTTTTGGTACCCt < 2:286816/141‑1 (MQ=255) tCAATAGAATCAACCTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCCCGTATAAAGTCTAATACTTATTTATTAGGTCTAGCAACTTCTGAAGCCTCATCACCATTTCATATTTGGGACCCt < 2:209374/141‑1 (MQ=255) aGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAATTCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTATTTGTTTTATGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTGGCATCTGCTAATGTGTTTTCATATTTTTTTTTTTGGTGCTCtttttt > 2:102130/1‑141 (MQ=255) aGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCtttttt > 2:970085/1‑141 (MQ=255) aCTTCCTGTGCTTTTTTTTTTTTTTTCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTATTTTTTGTTACCCTTttttaatttta > 2:755602/1‑141 (MQ=255) cTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGGTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTttttaattttaa < 1:448527/141‑1 (MQ=255) ttCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTtttaattttaat > 2:496837/1‑141 (MQ=255) tCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATc > 1:781947/1‑141 (MQ=255) ccTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCt > 1:619788/1‑141 (MQ=255) cTGTGCTTTTTGGAATAAACTCTTAAGTAATTCCATTTGACGTTGTCCACTTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAATGCCTCCTCACCATTTATTTTTTGGTACCCTTTTTTTATTTTAATCtt < 2:160167/141‑1 (MQ=255) cTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTCATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCtt < 2:160151/141‑1 (MQ=255) gtgCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAGGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTtttttatttttatttttat > 2:589331/1‑140 (MQ=255) cTTTTTGGACTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAg < 2:690388/141‑1 (MQ=255) cTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAg < 2:233886/141‑1 (MQ=255) tttttGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTACTCTTACCTGt < 2:834594/141‑1 (MQ=255) tttttGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGt < 1:38854/141‑1 (MQ=255) tttGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTat < 1:878864/141‑1 (MQ=255) ggAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCCCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTctcat > 2:586003/1‑141 (MQ=255) aaTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCt > 2:905498/1‑141 (MQ=255) aaTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCt < 1:613080/141‑1 (MQ=255) aaTAAAATCTTAATAAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACTAGTTTCATCt > 2:673805/1‑141 (MQ=255) tAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCtgt < 1:990686/141‑1 (MQ=255) tAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCtgt < 1:446231/141‑1 (MQ=255) tAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGCCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCtgt < 1:263802/141‑1 (MQ=255) tAAAACTTTAATTAATTCCATGTGACGTTGTCCACGGGTTATGTTTGAAGCATGATGTCTAGTACTAGCAACTGCTAAAGCCTCACCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCtgt < 1:622961/141‑1 (MQ=255) ttaattCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCAt < 2:18043/141‑1 (MQ=255) ttaattCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCAt < 2:292036/141‑1 (MQ=255) attCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTa < 2:981660/141‑1 (MQ=255) aTTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCGGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCg > 1:766007/1‑141 (MQ=255) aTTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTTTGTTAGGTGCTTTTagttct > 1:441818/1‑136 (MQ=255) tGACGTTGTCCACGTGGTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACAGCTTAAGCCTCATCACCATGTAATCTGTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTAt > 1:197011/1‑141 (MQ=255) gACGTTGTCCACTTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATg < 2:558768/141‑1 (MQ=255) gACGTTGTCCACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATg < 2:188183/141‑1 (MQ=255) ccACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCAcatca > 2:985064/1‑141 (MQ=255) cACGTTTTAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGAGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGcacacaca > 2:765494/1‑137 (MQ=255) tAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTatat < 1:613034/141‑1 (MQ=255) tAAGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTatat < 1:114841/141‑1 (MQ=255) aGTTTGAATCATGATGTCTAGTTCGAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGc < 1:403790/141‑1 (MQ=255) | CAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGAATAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGC > USA300TCH1516_ALE/1063711‑1063986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |