| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000731 | 81 | N→G | 100% | intergenic (–/‑151) | – / → repA | –/replication protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000731 | 81 | 0 | N | G | 98.9% | 283.4 / ‑5.0 | 86 | intergenic (–/‑151) | –/repA | –/replication protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base N (0/0); major base G (39/46); minor base T (1/0); total (40/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.96e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTANAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATGGAAAGA > CP000731/1‑220 | gatatttatcaatggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGa > 2:211532‑M1/60‑141 (MQ=255)gatatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGa < 1:238973‑M1/82‑1 (MQ=255) atatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGaa > 1:169523‑M1/59‑141 (MQ=255) atatttatcaagggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAAACCCAACTACTGGGAATAGTCCGGGATTAGTAATAAAACGTTTAGaa < 1:91000‑M1/83‑1 (MQ=255) agggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGtttatt > 1:345763‑M1/49‑141 (MQ=255) gggtttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGtttattt < 2:78308‑M1/94‑1 (MQ=255) ggtttataaacccttgataaagctatattttctcttttataagtttGTTTAAAGTGCTATAATAATATTCATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTATTAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTCGAAAATgtttatttt < 2:75245‑M1/95‑2 (MQ=255) ttataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTtatat > 1:233736‑M1/44‑141 (MQ=255) tataaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTtatata < 1:17908‑M1/99‑1 (MQ=255) taaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAGAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTCCTGGTAATAGTCGGGGATTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTATTTATTTATATAAt < 2:7466‑M1/101‑1 (MQ=255) taaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAAt < 1:374801‑M1/101‑1 (MQ=255) aaacccttgataaagctatattttcccttttataagtttCTCTAACGTGATATAACAAACTTAATATAACAACAACCCCAACTACTGCTAATCGTCGGTCTTCGGTAATAAAACGCTGAGAAACTGTTTATTTATATAAtt < 2:231278‑M1/102‑1 (MQ=255) aacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAAttt > 2:351890‑M1/39‑141 (MQ=255) aacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAAAGTTTATAATCGGTTTATTTATATAAttt > 1:193539‑M1/39‑141 (MQ=255) aacccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACAAAAAATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAAttt > 2:227927‑M1/39‑141 (MQ=255) cccttgataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAGAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTc > 2:263350‑M1/37‑141 (MQ=255) ccttgataaagctatattttcccttttataagtttCTTTAAAGTGCTATCATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATattttttt < 2:60011‑M1/106‑3 (MQ=255) gataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATAc < 1:346508‑M1/110‑1 (MQ=255) gataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATAc > 1:338958‑M1/32‑141 (MQ=255) gataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATAc > 1:192455‑M1/32‑141 (MQ=255) ataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACt < 2:329848‑M1/111‑1 (MQ=255) ataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACt < 1:30082‑M1/111‑1 (MQ=255) ataaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAAGTTTCGATACt < 2:359669‑M1/111‑1 (MQ=255) taaagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACtt < 1:276674‑M1/112‑1 (MQ=255) aagctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGt > 2:79163‑M1/28‑141 (MQ=255) agtgctattttcccttatataaggttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAGACCCCGACTACTGGTAATAGTCGGTGTTTGGTAATGAAGAGGATAGAAACGGTTTATTAATATAATTTTCGATACTTGta > 2:144262‑M1/27‑141 (MQ=255) agctatattttccgttctataagtttATTTAAAGTGCTATAAAAAACTTAATATAACAAAAACCCCAAATACCGGTAAAAGTCGGGGTTTGGTTATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGta > 1:148249‑M1/27‑141 (MQ=255) agctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGta < 2:388397‑M1/115‑1 (MQ=255) ctatattttcccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGtatt < 1:329762‑M1/117‑1 (MQ=255) cccttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAACCTGTTTATTTATATAATTTTCGATACCTGTCTTATATAATGa > 2:293099‑M1/16‑141 (MQ=255) ttttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGaata < 1:17563‑M1/129‑1 (MQ=255) tttataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTGATATAACAAAAACCCCAACTACTGGAAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGaataa < 2:91008‑M1/130‑1 (MQ=255) tataagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAataata > 1:47790‑M1/10‑141 (MQ=255) tacaagtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAataata > 1:47763‑M1/10‑141 (MQ=255) agtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCtt < 2:335616‑M1/136‑1 (MQ=255) gtttATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTAAATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTa < 2:131061‑M1/137‑1 (MQ=255) tAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAg < 2:132470/141‑1 (MQ=255) aaGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACGCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAgac > 2:328788/1‑139 (MQ=255) aaGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCa < 1:78308/141‑1 (MQ=255) aGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCAc < 2:238973/141‑1 (MQ=255) aGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGATAATAATAGGGATTTGGTAATAAAACGTTTAGTAGTTTCGCAGACACATAATTGCCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTCGTACAATCAc > 2:281195/1‑141 (MQ=255) gTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAAAAATATCTTAGTGCAAGCAcc > 2:121507/1‑141 (MQ=255) cTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑aa < 1:343123/141‑1 (MQ=255) tataATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGATTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑aaa > 1:227754/1‑141 (MQ=255) taataaACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTATTGCAAGCCCCT‑AAATc > 2:6434/1‑141 (MQ=255) taataaACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATc > 1:240039/1‑141 (MQ=255) taataaACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATc > 2:196835/1‑141 (MQ=255) ataaACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCAt > 2:128022/1‑141 (MQ=255) ataaACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCAt < 1:263471/141‑1 (MQ=255) aaCTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATtaa > 2:140284/1‑141 (MQ=255) atatAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTaaataaat > 2:340277/1‑141 (MQ=255) atatAAAAAAAACCTCAAATAAGTGTAATATTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTaaataaat < 2:21561/141‑1 (MQ=255) aataACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATg < 1:193842/140‑1 (MQ=255) aaaaCCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTGTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAAACATTAAATAAATGTAAAGCt > 1:54684/1‑141 (MQ=255) ccccAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCtaaaa > 1:263113/1‑140 (MQ=255) cccAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCtaaata < 1:196009/141‑1 (MQ=255) cccAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCtaaata < 2:265972/141‑1 (MQ=255) ccAACTACTGGTAATTGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCtaaataa < 1:271011/141‑1 (MQ=255) ccAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCtaaataa < 1:10288/141‑1 (MQ=255) ctactGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAAc < 2:276674/141‑1 (MQ=255) ctactGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATAATTAAATAAATGTAAAGGTAAATaaaaag > 2:247197/1‑140 (MQ=255) ctGGTAATAGTCGGTGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCGCCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAACCGtt < 1:285045/141‑1 (MQ=255) ctGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGtt < 2:149621/141‑1 (MQ=255) atatTCGGAGGTTGGTAATAAAACTTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGTACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTttatta < 2:268240/141‑1 (MQ=255) aGTCGTGGGTTGGTAATAACACGTCTCGAATCTGTTTATTTATATAACTTCCGATACTTGCATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCCACT‑GAATCCTTAAATAAATGGAAAGCTAAATAGAACCGTTTTATTAcc < 2:249822/141‑1 (MQ=255) aGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTAcc < 2:229323/141‑1 (MQ=255) gTCGGGGTTTGGTAATAAAACTGTGAGAGACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACct < 1:7796/141‑1 (MQ=255) gTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACct < 1:129025/141‑1 (MQ=255) cGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACctct > 1:360755/1‑141 (MQ=255) gggTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTa < 2:134527/141‑1 (MQ=255) gTTTGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTAcc < 2:381944/141‑1 (MQ=255) tGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAACTAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCaaa > 1:370161/1‑141 (MQ=255) tGGTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCAAGTCAAGTCGATCTGT‑TAGGTACAGCTAAATAATAACTCTTTATTACCTCTTACCaaa > 1:389795/1‑141 (MQ=255) gTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACt < 1:140284/141‑1 (MQ=255) gTAATAAAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACt < 2:263113/141‑1 (MQ=255) aataaAACGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTaa < 1:319127/141‑1 (MQ=255) aaCGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAatat > 2:111038/1‑141 (MQ=255) aaCGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAatat < 2:160687/141‑1 (MQ=255) cGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTCTTATATACAGAATAATATCGTAGTACAATCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAGCGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATgg > 1:191285/1‑141 (MQ=255) cGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATgg > 1:365637/1‑141 (MQ=255) cGTTTAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATgg > 1:365623/1‑141 (MQ=255) tttAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATGGaa > 2:203830/1‑141 (MQ=255) ttAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTCCCAAACTAACATATGaaaa > 2:213959/1‑141 (MQ=255) ttAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATGGaaa > 1:232730/1‑141 (MQ=255) tAGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATGGAAag < 1:335616/141‑1 (MQ=255) aGAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATGGAAaga > 1:212678/1‑141 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTAAAGTGCTATAATAAACTTAATATAACAAAAACCCCAACTACTGGTAATAGTCGGGGTTTGGTAATAAAACGTTTANAAACTGTTTATTTATATAATTTTCGATACTTGTATTATATAATGAATAATATCTTAGTGCAAGCACCT‑AAATCATTAAATAAATGTAAAGCTAAATAAAAACGTTTTATTACCTCTTACCAAACTAAAATATGGAAAGA > CP000731/1‑220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |