New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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4:131705/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 3:325047/141‑1 (MQ=255) aCATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAg < 2:707432/141‑1 (MQ=255) ttAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAt > 2:711432/1‑141 (MQ=255) ttAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAt > 2:1018491/1‑141 (MQ=255) aaTCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTATTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttt > 4:337195/1‑141 (MQ=255) aTCCCTAAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttt < 2:42470/141‑1 (MQ=255) cT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtgat < 4:334975/141‑1 (MQ=255) cT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtgat < 1:809099/141‑1 (MQ=40) | AATCCACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGG > USA300TCH1516_ALE/2478112‑2478389 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |