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| * | USA300TCH1516_ALE | 628,618 | 0 | T | A | 6.9% | 250.5 / 3.5 | 97 | S8T (TCG→ACG) | nagB_1 | Glucosamine‑6‑phosphate deaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/37); new base A (3/5); total (55/42) | |||||||||||
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AATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATTAAATAAAAAT > USA300TCH1516_ALE/628478‑628758 | aaTCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGAt > 2:456073/1‑141 (MQ=255) acAAAAATTTGTTGGAATGTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCg < 1:579036/140‑1 (MQ=255) cAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAAATAGGGATCGa > 2:423688/1‑141 (MQ=255) aaaaaTTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGaa < 1:716075/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATtaaa < 1:768971/141‑1 (MQ=255) ggATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATtaaataaa > 1:716309/1‑141 (MQ=255) aTCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGGGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAAATTGTTAATTTATTCAATaaaaa > 1:328941/1‑141 (MQ=255) tCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATTAAATAAAAAt > 2:707410/1‑141 (MQ=255) tCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATTAAATAAAAAt > 2:76723/1‑141 (MQ=255) | AATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATTAAATAAAAAT > USA300TCH1516_ALE/628478‑628758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |