| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,134,851 | A→T | 5.4% | I119I (ATT→ATA) | USA300HOU_RS05620 ← | Nicotinamide‑nucleotide adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,134,851 | 0 | A | T | 5.4% | 235.1 / 2.1 | 73 | I119I (ATT→ATA) | USA300HOU_RS05620 | Nicotinamide‑nucleotide adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/32); new base T (2/2); total (39/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
TAGCAATTGCTTTCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGC > USA300TCH1516_ALE/1134712‑1134991 | tagcaATTACTGTCGGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCaa < 1:641713/141‑1 (MQ=255) gcaATTGCTTTCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAAtt > 2:733120/1‑141 (MQ=255) ttGCTTTCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCAt < 1:758446/141‑1 (MQ=255) ttGCTTTCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCAt < 1:183929/141‑1 (MQ=255) tGCTTTCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCAtt < 1:29365/141‑1 (MQ=255) gCTTTCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTa > 1:737083/1‑141 (MQ=255) cTTTCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTaa < 1:673950/141‑1 (MQ=255) ttCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATg > 1:497222/1‑141 (MQ=255) gTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCtgtg < 1:337478/141‑1 (MQ=255) aaCTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCtgtgtg < 1:379369/141‑1 (MQ=255) aCTTATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTATCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTTAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGc < 2:878819/141‑1 (MQ=255) aCTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGc < 1:242658/141‑1 (MQ=255) cTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCt < 2:581809/141‑1 (MQ=255) ccAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGc > 1:131280/1‑141 (MQ=255) aaGTAGGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTTATAATTCGCAAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCtt < 2:621268/141‑1 (MQ=255) aGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCttt > 1:90669/1‑141 (MQ=255) gttgttAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGt > 2:896657/1‑141 (MQ=255) ttgttAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGTTGTGTGCTAATTGCTTTAATGtt > 1:67377/1‑141 (MQ=255) ttgttAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGtt > 1:596192/1‑141 (MQ=255) ttgttAGGACTTGCTAGTGCTGCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGtt > 1:220810/1‑141 (MQ=255) tgttAGGACTTGGTAGTGCTTCATGGTGATCTAATAATTCGCAGATGCTACGCGCGTATCGCAGGCCGACGGTGACCTTTGGTGAAAAGTATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGttt < 2:759979/141‑1 (MQ=255) aGGACTTGCTAGCGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATCAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGat < 1:284139/141‑1 (MQ=255) aCTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATc > 1:916560/1‑141 (MQ=255) gtgaGTGCTTCATGGTGCTCTAATTATTCGCTAATGATGCGAGGGTAGCTTTTCCCTTTTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTTATTAATGGTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCatta < 2:379544/138‑1 (MQ=255) cTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTCCTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCattat > 1:124634/1‑141 (MQ=255) tCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTCATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTTTTTTCACtc > 2:407931/1‑140 (MQ=255) cATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGTTACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTAc < 1:695982/141‑1 (MQ=255) atgatgCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGCAATGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTAcc > 2:594171/1‑141 (MQ=255) gatgCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCaa > 1:258518/1‑141 (MQ=255) gCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCTATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCCAATg > 2:560637/1‑141 (MQ=255) gCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCTATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATg > 2:25116/1‑141 (MQ=255) gCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATg < 2:837486/141‑1 (MQ=255) ctctAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGc > 1:488986/1‑141 (MQ=255) aatTCGCTAATGATTCGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTa < 2:403373/141‑1 (MQ=255) aatTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTCCCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTa < 1:785478/141‑1 (MQ=255) aatTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTa < 1:743256/141‑1 (MQ=255) aatTCGCTAAGGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGAGATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTa < 1:261763/141‑1 (MQ=255) aatTCGCGAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTa < 2:12065/141‑1 (MQ=255) aactCGCTAATGATACGACGGTAGCGCGTTCCTCCTCTTACTTGTTGTCAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTa < 2:494542/138‑1 (MQ=255) ttCGCTAATGATACGAGTGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATc < 1:522968/141‑1 (MQ=255) ttCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTTCCTTCTTTTATTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATTTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATc < 2:437353/141‑1 (MQ=255) ttCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATc < 1:243379/141‑1 (MQ=255) gCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATCGTATCGac > 1:732954/1‑141 (MQ=255) tAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCATTTACTTTTTGTGAAACGGATGCAGATTGTTCATTTTTATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTGTAATGTTTTGTTATCATTATTTTCTTTACTAAATGCACTTGTTTCGaccg > 2:169011/1‑139 (MQ=255) acgATACGAGGGTAGATTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATTGACACTc < 1:568003/139‑1 (MQ=255) aTGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATTGACACTc < 1:567960/141‑1 (MQ=255) tGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCa > 1:818100/1‑141 (MQ=255) tGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCa > 1:232685/1‑141 (MQ=255) tACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACGTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCatat < 2:742838/141‑1 (MQ=255) gggTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCt > 1:576156/1‑141 (MQ=255) tcTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGAc < 2:912313/140‑1 (MQ=255) cTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCTCTACCAAATGCAATTGTTTCGACACTCATATAATCTGCGACt > 2:777719/1‑141 (MQ=255) cTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACt > 2:307368/1‑141 (MQ=255) aCCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTGTTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAAc > 2:501447/1‑141 (MQ=255) aCCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAAc < 1:199807/141‑1 (MQ=255) ttttACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGTTTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAg < 2:534226/141‑1 (MQ=255) tACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTc > 1:788451/1‑141 (MQ=255) tACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTc > 1:300073/1‑141 (MQ=255) cTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTACCTGCTAGTTCgg > 2:433724/1‑141 (MQ=255) cTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGATAATTGCGTTAATGTTTTGATAGCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCgg > 1:901337/1‑141 (MQ=255) ttgAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCTTTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAAt < 1:51855/140‑1 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1:693783/1‑141 (MQ=255) aaaGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATc > 1:72007/1‑141 (MQ=255) ttCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACGCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATGGCCAga > 2:66572/1‑141 (MQ=255) catttggTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTAACGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTATTTCGGCAAACTGATGGCCGgatg > 2:236840/7‑141 (MQ=255) cAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCCTTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAgatg > 1:808716/1‑141 (MQ=255) cgATTGTTCTATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAgatga < 1:25116/140‑1 (MQ=255) aGATTGTTCTATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAgatga < 1:560637/141‑1 (MQ=255) ttCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAACATGATCGCCAGATGATAAACt > 1:858747/1‑141 (MQ=255) aaTTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGc > 1:836721/1‑141 (MQ=255) | TAGCAATTGCTTTCAGGTAACTAATACCAAGTATGTTGTTAGGACTTGCTAGTGCTTCATGATGCTCTAATAATTCGCTAATGATACGAGGGTAGCTTTTACCTTCTTTTACTTTTTGTGAAAAGGATTCAGATTGTTCAATTTCATTAATGCTGTGTGCTAATTGCTTTAATGTTTTGATATCATTATTTTCACTACCAAATGCAATTGTATCGACACTCATATAATCTGCGACTTTAACTGCTAGTTCGGCAAAATGATCGCCAGATGATAAACTGGC > USA300TCH1516_ALE/1134712‑1134991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |