| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,249,530 | G→A | 5.7% | A956T (GCG→ACG) | smc_2 → | Chromosome partition protein Smc |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,249,530 | 0 | G | A | 5.7% | 202.7 / 3.6 | 71 | A956T (GCG→ACG) | smc_2 | Chromosome partition protein Smc |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/31); new base A (2/2); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.83e-01 | |||||||||||
CAAGTTTGTCACCAAGATATTTTAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAATGAACGTTA > USA300TCH1516_ALE/1249395‑1249666 | aaaGTTTGTCAGCAAGATATTTTAGCTAGCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGaaa < 1:427070/140‑1 (MQ=255) gTCACCAAGATATTTTAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGACTAGTCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAat > 1:435411/1‑141 (MQ=255) cAAGATATTTTAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATAca > 2:168365/1‑140 (MQ=255) atatTTTAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATATATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGtg > 2:780983/1‑141 (MQ=255) ttttAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAGCGTGCGGAATCTGCATATACAATtgata > 2:480006/1‑140 (MQ=255) ttttAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGtgatg > 1:292605/1‑141 (MQ=255) ttttAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGtgatg > 1:322231/1‑141 (MQ=255) ttttAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGtgatg > 2:262873/1‑141 (MQ=255) ttAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGaa > 2:310739/1‑141 (MQ=255) ttAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGaa > 1:604158/1‑141 (MQ=255) aGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATc < 1:786378/141‑1 (MQ=255) acTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGGATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAAGATCAACTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCg < 1:512094/140‑1 (MQ=255) aTCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGAtt < 1:541186/141‑1 (MQ=255) tCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTg > 1:871927/1‑141 (MQ=255) tCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTg > 2:594949/1‑141 (MQ=255) aaaTCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGCCGc > 2:608081/1‑141 (MQ=255) caatACCAAAATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGACATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTa < 2:686327/138‑1 (MQ=255) cACTACCAAGATAATAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTa < 1:473138/141‑1 (MQ=255) aCTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTAc > 2:488182/1‑141 (MQ=255) aCTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATAGATTGACGCATTaa > 2:372041/1‑140 (MQ=255) tACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATAATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGAGGAAATACga > 2:539878/1‑140 (MQ=255) ccAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTaa < 1:490114/141‑1 (MQ=255) ccAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTACGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTaa > 2:158114/1‑141 (MQ=255) ccAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTACGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTaa > 2:389827/1‑141 (MQ=255) aaGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAGTGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATAGATTGATGCATTACGTGAAAacgttaagt > 1:895365/1‑141 (MQ=255) atcAATCAAAGTTAGACGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATAGACGAGTGCTGGTACAAATGACGCATTACGTAAAAAAGTTCAGTTAATGa < 1:667224/139‑1 (MQ=255) aaCAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGa < 2:316971/141‑1 (MQ=255) cAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAg < 1:488593/141‑1 (MQ=255) aTCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGAt > 2:297997/1‑141 (MQ=255) tCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTACTGGAGATg > 2:136559/1‑141 (MQ=255) tCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTGAATGAAGATg > 2:501864/1‑141 (MQ=255) tCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGAGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGagg > 1:173790/1‑139 (MQ=255) aaGCTATATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCg < 2:427024/141‑1 (MQ=255) aGCTAGATGTATTAATACAACATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGa < 1:4772/141‑1 (MQ=255) gCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGAt < 2:615307/141‑1 (MQ=255) cTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGAtt > 1:226821/1‑141 (MQ=255) gATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCCATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGACAATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAATAAAGTTAAGTTAATGTAAGTGTCGATtgct > 2:579439/1‑139 (MQ=255) gATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATtgct > 2:913930/1‑139 (MQ=255) gATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATtgat > 2:6470/1‑141 (MQ=255) gATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTAAACGTGCGAAATCTCAATATAAGCTTGTTGAACTGATTGACTCATTACGTAGAAAAGTTAAGTTAATCAAAATGTCGATtgat > 2:78749/1‑141 (MQ=255) tATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAAc < 2:604158/141‑1 (MQ=255) aTTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTACGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACt > 2:372458/1‑141 (MQ=255) aTTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACt < 1:636544/141‑1 (MQ=255) aTTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACt > 1:841898/1‑141 (MQ=255) ttAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTa > 1:13332/1‑141 (MQ=255) aTTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGt < 1:103290/141‑1 (MQ=255) aTTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGt > 1:653731/1‑141 (MQ=255) atcatGCGATAGATCATTTAAATGCTGAGTATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTg > 1:578201/1‑141 (MQ=255) atcatGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTg < 1:327928/141‑1 (MQ=255) tGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGGGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTaaa < 1:98721/141‑1 (MQ=255) aTAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTAAACGTGAGAAATCTGAATAAACGGGGGATGAATCGATTGAAGCATTAGGTAAAAACGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAAGTAGGTCCTGtccacgaa > 2:135780/1‑134 (MQ=255) aGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCGGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTaaa > 2:316957/1‑141 (MQ=255) aaTCTTTTAAATTATGAATATCAATTCACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAAt < 1:892230/140‑1 (MQ=255) aaTCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAAt < 1:170739/140‑1 (MQ=255) aaaTGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGa < 2:64062/141‑1 (MQ=255) atgaATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAAt > 2:535289/1‑141 (MQ=255) atatCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTGGATTGATTAACGAGGTCTTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGa > 2:189355/1‑141 (MQ=255) atatCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGa < 2:614954/141‑1 (MQ=255) atatCAATTGACTGTTGAACGCGCGAAATCTGAATATACGATTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTTAACAATTTGa < 2:615065/141‑1 (MQ=255) tatCAATTGACAGGTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGCTTGATGCGTTACGTAAAAAAGTTAAGTTCATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTGTTTGAAACTTAGATGCAATTGAACAATTTGaa < 2:602508/141‑1 (MQ=255) aaTTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACCTAAATGCAATAGAACAATCTGAAGAGt < 2:440240/141‑1 (MQ=255) gaatggtGAACGTCAGAAAGCTGAATAAACGAGGGATGAATCGATTGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTaaa < 2:58658/135‑1 (MQ=255) aCTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAAt < 1:561710/141‑1 (MQ=255) aCTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAAt < 1:142916/141‑1 (MQ=255) aCTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAAt < 1:825881/141‑1 (MQ=255) tGTTGAACGAGAGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAATGa < 2:723806/141‑1 (MQ=255) aaCGTACGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAATGAACGtt < 1:158114/141‑1 (MQ=255) aaCGTACGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAATGAACGtt < 1:389827/141‑1 (MQ=255) aCGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAATGACAGTta > 2:133040/1‑141 (MQ=255) aCGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAATGAACGTta < 2:134364/141‑1 (MQ=255) aCGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAATGAACGTta < 2:248610/141‑1 (MQ=255) | CAAGTTTGTCACCAAGATATTTTAGCTATCGAAAATCACTACCAAGATATTAAAGCTGAACAATCAAAGCTAGATGTATTAATTCATCATGCGATAGATCATTTAAATGATGAATATCAATTGACTGTTGAACGTGCGAAATCTGAATATACGAGTGATGAATCGATTGACGCATTACGTAAAAAAGTTAAGTTAATGAAGATGTCGATTGATGAACTAGGTCCTGTAAACTTAAATGCAATTGAACAATTTGAAGAGTTAAATGAACGTTA > USA300TCH1516_ALE/1249395‑1249666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |