New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 512620 = | 90 (1.040) | 70 (1.110) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA |
46/216 | 0.1 | 51.7% | intergenic (+688/‑6075) | recR/speA_2 | Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1998278 = | NA (NA) | intergenic (‑6/+3329) | USA300TCH1516_01882/USA300TCH1516_01883 | tRNA‑Val/tRNA‑Ala |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
TTAGGATAAGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCT > USA300TCH1516_ALE/512472‑512768 | gcaaggaggtcccacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaa > 1:855956‑M1/149‑149 (MQ=255) gcaaggaggtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaa < 1:628849‑M1/1‑1 (MQ=255) gcaaggaggtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaaaggacaagataaa < 2:551096‑M1/1‑1 (MQ=255) caaggaggtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaa < 2:873975‑M1/2‑1 (MQ=255) aaggaggtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaa < 1:264995‑M1/3‑1 (MQ=255) gaggtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAg < 2:670131‑M1/6‑1 (MQ=255) gaggtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAg < 2:721936‑M1/6‑1 (MQ=255) gaggtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaacctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttataaaataaaatggacaagataaAAAAAg > 1:604876‑M1/144‑149 (MQ=255) gaggtcacacctgttcccagtccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAg > 1:118384‑M1/144‑149 (MQ=255) gggCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGGTAt > 1:243917/1‑149 (MQ=255) aaacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccaaagagtcgatagtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacggtgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatgaaaaaaaaaaAAAAAGTTATTg > 2:854101‑M1/138‑149 (MQ=255) acctgctaccgtgcggagcacagatggtaagctccttagcgttgatggtagtcgaacttccgttccgcgagagtagaacggtgccacgcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGAc > 2:793175‑M1/136‑149 (MQ=255) cctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcacattttggttaaaaaataaaatgaacaagataaAAAAAGTTATTGACt < 1:538569‑M1/15‑1 (MQ=255) cctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACt > 1:678932‑M1/135‑149 (MQ=255) tCAATACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACtt < 2:331965/149‑1 (MQ=255) ttcccatgccgaacaaagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTaaa > 1:200587‑M1/131‑149 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGt > 1:129154‑M1/128‑149 (MQ=255) atgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagacgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaatttaggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATgttg < 2:615864‑M1/24‑2 (MQ=255) tGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaat > 1:733246/1‑149 (MQ=255) aCAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaataa > 2:172971/1‑149 (MQ=255) gaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGATGATaaa < 1:416533‑M1/29‑1 (MQ=255) acaccgaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaactcacgtaccgctagagtagaaagttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAAt > 2:674666‑M1/119‑149 (MQ=255) aaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAATTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAAt < 1:404255/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGGGATTGACTTAAATGTTAATAAAAt < 1:693255/149‑1 (MQ=255) cagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagattaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGta < 1:253080‑M1/34‑1 (MQ=255) cagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGta > 2:349560‑M1/116‑149 (MQ=255) cagaagtgaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgtatcgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGta > 1:171805‑M1/116‑149 (MQ=255) ttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggccgttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaatta > 1:151548‑M1/110‑149 (MQ=255) tattaaCTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACGACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatta < 2:875523/144‑1 (MQ=255) gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGt > 1:351090/1‑149 (MQ=255) cgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa < 2:536715‑M1/53‑1 (MQ=255) cgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa < 1:800866‑M1/53‑1 (MQ=255) cgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgacaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa < 2:4981‑M1/53‑1 (MQ=255) cgtcgatggtagtcgaacttacgttcccctagaatagaacgttgccaggcagatttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGGATAATTAATTCTTGTCGGTa < 1:509797‑M1/53‑1 (MQ=255) aGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg > 2:208320/1‑149 (MQ=255) cAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTGTTATTAATTCTTGTCGTTAAGaa > 1:433381/1‑149 (MQ=255) atggtagtcgaacttcagttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaaa > 2:464537‑M1/92‑149 (MQ=255) ttttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaaaa < 1:48977/148‑1 (MQ=255) ggtggtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttgatcaaattttggttcaaaactaaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAGGaaaaa < 2:15463‑M1/60‑1 (MQ=255) ttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAAt > 2:1270/1‑149 (MQ=255) tagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATg > 1:715876‑M1/88‑149 (MQ=255) aacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAtt < 1:233395‑M1/68‑1 (MQ=255) tGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGa > 1:901311/1‑149 (MQ=255) gttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt > 1:721936‑M1/75‑149 (MQ=255) gttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt > 1:670131‑M1/75‑149 (MQ=255) gTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg > 2:488888/1‑149 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGGACATTGAAAACTGaa > 1:770386/1‑149 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGaa > 2:648528/1‑149 (MQ=255) atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGaa > 2:700684/1‑149 (MQ=255) gttatagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATg > 1:207412‑M1/70‑149 (MQ=255) gctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATg > 1:16277‑M1/70‑149 (MQ=255) ctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGATAAGAAAAATAAACATTGGAAACTGAATGa < 1:185985‑M1/81‑1 (MQ=255) agagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACa > 1:825309‑M1/67‑149 (MQ=255) agtagaacgttgccaggcagttttttactccaatcatgtttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATACTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat < 2:200023‑M1/85‑1 (MQ=255) tgAGGCTAACAGAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAACTACTAACCAAAAGTGATTTTAAAAAGGTATTGCCTTACGTATGAATAAAATATTTAATTAATTCTTGTCGGAAAGAAAAAAGAACATTGAAAAGTGAATGACAAGATg > 2:395416/1‑149 (MQ=255) tgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatatt > 2:676528/1‑148 (MQ=255) tgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg > 2:865963/1‑149 (MQ=255) gAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAAAGACGCTGAAAGTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGt < 1:175367/149‑1 (MQ=255) acgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAGATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAACATGAAGATTGAAGACTGAATGACTATATGTCa < 2:717382‑M1/91‑1 (MQ=255) caaacaaaACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAc > 1:125228/1‑149 (MQ=255) tgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt > 1:87263‑M1/55‑149 (MQ=255) aacaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AAtt > 1:522870/1‑149 (MQ=255) gcagttttttaataaaattctggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACACTATGTCAACGTT‑AATTc > 1:593792‑M1/49‑149 (MQ=255) acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTc < 2:583268/149‑1 (MQ=255) acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTc < 1:667019/149‑1 (MQ=255) acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTc < 2:52691/149‑1 (MQ=255) tttttaaataaaacttttgttaaaaaataaaataaaaaaaataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCaaa > 2:258885‑M1/45‑149 (MQ=255) caactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTGGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCaaaaa < 1:617898/149‑1 (MQ=255) caactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCaaaaa < 2:306342/149‑1 (MQ=255) ctTAAGAAATAACTTTAATTACTAACGACAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGGAAAATGAACATTGCAAACAGAATGACAATATGTCAACGGT‑AATTCCAAAAAACg > 1:582793/1‑149 (MQ=255) ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACg > 2:238944/1‑149 (MQ=255) ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACg > 2:854923/1‑149 (MQ=255) ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAAAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATCCCaaaaaaac > 2:55874/1‑147 (MQ=255) aatcaaattttggtaaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATCGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAACACTGAATTACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGt > 1:850837‑M1/39‑149 (MQ=255) tAAGAAATAACTTGAATTACCAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTCACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTAAAAAAAAAAAAAAATGAACATTGAAAACCGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTa < 2:882703/149‑1 (MQ=25) aaGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACGTTGAAAACTGAATGACAATATTTAAACATT‑AATACCAAAAAACATaa > 1:244695/1‑149 (MQ=39) gAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AAGTCCAAAAAACGTAACt > 1:79252/1‑149 (MQ=255) aaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACt > 1:255640‑M1/35‑149 (MQ=255) aattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAGAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACta > 2:577322‑M1/34‑149 (MQ=255) aaaTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACta > 2:197206/1‑149 (MQ=255) aTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACtata > 1:455980/1‑149 (MQ=255) tgttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACATTATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACTTAACTATAAGtt > 2:567365‑M1/28‑149 (MQ=255) ttGAATTACTACCGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa < 1:21813/149‑1 (MQ=255) ttGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa < 2:729692/149‑1 (MQ=255) ttGAATTACTAACGAAAATTAATTATAAAAAGATATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGCACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAAAAA‑AAAAAAAAAAAACGTAACTATAAGTTa < 2:448100/149‑1 (MQ=37) aaTTACTAACGAAAAATAATATTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAGAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAACGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTTAAAAAA‑AAAAAAAAAAAACGTAACTATAAGTTACaa < 2:773073/149‑1 (MQ=37) aTTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAAGAAG‑CTTCGATGAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa < 1:449908/149‑1 (MQ=38) aTTACGAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAGTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa < 2:479147/149‑1 (MQ=255) aataaaatggaaaaaataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACat > 2:416350‑M1/20‑149 (MQ=255) aCTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCCAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACat < 1:556732/149‑1 (MQ=255) aaaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta > 1:873975‑M1/18‑149 (MQ=255) aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattat > 1:4981‑M1/17‑149 (MQ=255) aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattat > 2:800866‑M1/17‑149 (MQ=255) tggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg < 1:700006‑M1/137‑1 (MQ=255) aaaaTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg > 1:365611/1‑149 (MQ=255) aaaaTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg > 1:892462/1‑149 (MQ=255) acaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTagtgt < 2:247958‑M1/140‑3 (MQ=255) tAAAAAGTTATTGACTTGAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGTATGACAATATGTTAACGTT‑AATTAAAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGc < 2:338648/149‑1 (MQ=25) aaaaaGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGGGCt > 1:382033/1‑149 (MQ=255) aaaaaGTTATTGACTTAAATGGTAATAAAATGTATACATAATCCTTATGGGTAAGAAAAATGAAAATTCAAAACTGAATTAGAGAATGGCAACATT‑AATCACAAAAAACGTAACGATAAGTTACACACATTATGTAATATTGATGAGCt > 2:415657/1‑149 (MQ=255) | TTAGGATAAGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTT‑AATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTATTTATGAGCT > USA300TCH1516_ALE/512472‑512768 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |