| Predicted mutation | ||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 478,502 | 0 | C | A | 98.8% | 521.2 / ‑5.9 | 172 | D342E (GAC→GAA) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
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Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
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1:340043/141‑1 (MQ=255) aCAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTATCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACt < 1:299380/141‑1 (MQ=255) cAAGCATCTGCTAAAGACGCTTATGGCTAGATTTTCATGGGCCGTGTATTGACTATTACCGAGGTAGCGCGTTTTCGACTGATTCCTCGCAGACGTTCGTATGCAGTGTTAAGTGCACTCGTCCTAGGACGGTCGTTGCtt > 2:673491/1‑141 (MQ=255) cAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTATCGTGGCTTTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACtt > 2:1374388/1‑141 (MQ=255) cAAGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTATCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACtt > 2:1103742/1‑141 (MQ=255) aGCATCTGCTAAAGAAGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTATCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGt < 2:538475/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) | GTTCAATGTGCATTGGGTGTATATTCAGCAGCGATTATTCATTTAATATTGCACGGTATTTTTAAAGCAACATTATTTTTACAATCAGGTTCTATCGTGAAGCGATTCAATATTCCAAAACAAGCATCTGCTAAAGACGCTTATGGCTGGATTGTCATGGGACGTGTATTAGCTATTATCGTGGCATTTCTATTTTGGATGAGTAGTGACAGAAGTGCATATGAAGTGTTAAGTGCACTCATTCTAGGATGGTCATTACTTGTATCTTGGAAT > USA300TCH1516_ALE/478365‑478637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |