Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	USA300TCH1516_ALE	1740141	1740212	72	2 [1]	[1] 2	[lytC]	[lytC]

AATAAATTTTAAGGCCATCAACAATTGCTTGTTCTAAAATTTGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGA  >  USA300TCH1516_ALE/1740211‑1740353   |                                                                                                                                             aataaatTTTAAGGCCATCAACAATTGCTTGTTCTAAAATTTGTCTATGTAATTGATTTTTCATTCTTTTGTCGACATAAGGGTTACTTAGATTGCCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACtt    >  1:29155/1‑141 (MQ=255)   taaatTTTAAGGCCATCAACAATTGCTTGTTCTAAAATTTGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTTACACTTGa  >  1:62349/1‑141 (MQ=255)   |                                                                                                                                             AATAAATTTTAAGGCCATCAACAATTGCTTGTTCTAAAATTTGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGA  >  USA300TCH1516_ALE/1740211‑1740353

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑