| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 528477 | 99 (0.710) | 5 (0.040) | 5/230 | NT | 5.3% | intergenic (+18/‑149) | dtd3/rnmV_1 | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/Ribonuclease M5 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 528526 | 92 (0.740) | intergenic (+67/‑100) | dtd3/rnmV_1 | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/Ribonuclease M5 | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
AATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTGTAGGAAGG > USA300TCH1516_ALE/528337‑528617 | atcatctcgtccttctacaactataaactcattgattttcatttaaaacgccttcctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGa < 2:1014463‑M1/14‑1 (MQ=255)aaTGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGGGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGA > 2:304791‑M1/1‑141 (MQ=255) aCCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCAcc > 2:473780/1‑141 (MQ=255) ggCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGcc < 1:25625/141‑1 (MQ=255) cGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCAt < 1:1123766/141‑1 (MQ=255) gTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATg > 4:63764/1‑141 (MQ=255) tAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGt < 1:360315/141‑1 (MQ=255) aaCTTTACTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTa < 2:30983/141‑1 (MQ=255) aCTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTaa > 1:774759/1‑141 (MQ=255) aCTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTaa > 1:456728/1‑141 (MQ=255) tttAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAAc > 1:119423/1‑141 (MQ=255) ttAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACg > 2:762441/1‑141 (MQ=255) gtagCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATg > 2:1070138/1‑141 (MQ=255) gAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTatat < 2:395486/141‑1 (MQ=255) cAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCg > 1:993092/1‑141 (MQ=255) aaaTTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGt > 3:499496/1‑141 (MQ=255) aaaTTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGt < 1:941982/141‑1 (MQ=255) aTTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGttt > 2:796905/1‑141 (MQ=255) ttGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTa > 2:610359/1‑141 (MQ=255) tGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTaa > 1:289319/1‑141 (MQ=255) tGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTaa > 2:534920/1‑141 (MQ=255) tGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAatat < 3:16356/141‑1 (MQ=255) ttAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTa > 2:268157/1‑141 (MQ=255) ttAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTa < 2:164857/141‑1 (MQ=255) ggCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtc < 2:366795‑M2/141‑3 (MQ=255) gCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtct < 1:1014463‑M2/141‑4 (MQ=255) cttatcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctt < 2:201234‑M2/141‑5 (MQ=255) ttatcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtcttt < 1:1162613‑M2/141‑6 (MQ=255) ttatcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtcttt < 2:319203‑M2/141‑6 (MQ=255) ttatcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtcttt < 3:371759‑M2/141‑6 (MQ=255) ttatcttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtcttt > 4:1080‑M2/1‑136 (MQ=255) tatcgtatAAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttc > 4:459337‑M2/1‑135 (MQ=255) ctacaattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGttctttc > 1:270265‑M1/73‑141 (MQ=255) ctacaattcttaatttcaaagctcggaccttctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGttctttc > 3:353199‑M1/73‑141 (MQ=255) cttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctca < 4:67862‑M2/141‑10 (MQ=255) ttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctcac > 3:468075‑M2/1‑131 (MQ=255) ttatGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctcac > 1:304791‑M2/1‑131 (MQ=255) aattcttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCAc > 2:1094601‑M1/69‑141 (MQ=255) atGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcactt < 1:166289‑M1/141‑62 (MQ=255) ttaatttcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAA‑GATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACtttttt > 1:584805‑M1/64‑141 (MQ=255) aagaagTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACttttt < 1:1144277/141‑1 (MQ=255) aagaagTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACttttt < 3:188953/141‑1 (MQ=255) aagaagTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACttttt < 2:127413/141‑1 (MQ=255) agTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaa > 2:640427/1‑141 (MQ=255) gtgtGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaat < 4:153738/141‑1 (MQ=255) tgtgCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaacttta < 1:963997‑M1/141‑71 (MQ=255) tcaaagctctaaccatctctatcgcacgtattccacatgcacgatattttaatttaaAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaatt > 3:188001‑M1/58‑141 (MQ=255) tgCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatg < 3:344884‑M1/141‑73 (MQ=255) gagtacaaacaaAAAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATATATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaattaaa < 2:860256/137‑1 (MQ=255) gCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaattaaa > 4:261376/1‑141 (MQ=255) cacaacaaacaACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTttaaattaaa < 2:119798/138‑1 (MQ=255) caaacaaTTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATc < 2:827486/141‑1 (MQ=255) aaacaaCTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCg < 3:379139/141‑1 (MQ=255) acaacTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTg > 2:969991/1‑141 (MQ=255) acaacTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTg < 1:1034670/141‑1 (MQ=255) caacTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGc < 1:629394/141‑1 (MQ=255) caacTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAAATTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATAACCGCAATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGc > 2:1123118/1‑141 (MQ=255) acTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCAt < 1:925538/141‑1 (MQ=255) aaaaaTGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCAtgtg < 3:261376/141‑1 (MQ=255) aaaaTGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTgg < 1:201234/141‑1 (MQ=255) tGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATa > 3:369631/1‑141 (MQ=255) cAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACg > 1:819785/1‑141 (MQ=255) agaAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATTCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGc < 1:623040/141‑1 (MQ=255) agaAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGc < 3:246008/141‑1 (MQ=255) aaaTTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGa < 1:201193/141‑1 (MQ=255) aaTGGTGTAATTTAAAGTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACGGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGAt < 2:923061/141‑1 (MQ=255) aTTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATa < 1:1128888/141‑1 (MQ=255) atttaaATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGt < 2:746948/141‑1 (MQ=255) atttaaATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGt < 1:924883/141‑1 (MQ=255) atttaaATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATACTATATACGTTTACTATGCTATGGCTCTATCTCTCATTTTTAAATTAAAATATCGTGCAGGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGt < 1:237550/141‑1 (MQ=255) ttCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCt > 2:214867/1‑141 (MQ=255) ttCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCt < 1:902998/141‑1 (MQ=255) tCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCtt > 2:517654/1‑141 (MQ=255) cATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTtctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgca < 3:344884‑M2/141‑70 (MQ=255) aTAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTTTTTTTTTTTATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCtttt > 2:84389/1‑140 (MQ=255) aaGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGaaa > 2:588052/1‑141 (MQ=255) aaGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGaaa > 1:44457/1‑141 (MQ=255) aGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAAt < 1:997669/141‑1 (MQ=255) gTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAAtt > 4:356/1‑141 (MQ=255) aaaaGTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacncttcttc > 2:896664‑M1/1‑14 (MQ=255) aaaaGTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttc > 3:497986‑M1/1‑14 (MQ=255) AAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGa < 1:576734‑M1/141‑1 (MQ=255) aaGTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcat < 1:1176295‑M1/141‑130 (MQ=255) AGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAAt < 1:1117322‑M1/141‑1 (MQ=255) gTGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataa > 3:468075‑M1/1‑10 (MQ=255) tGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataag < 2:200472‑M1/141‑133 (MQ=255) tGAGAAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataag < 4:502202‑M1/141‑133 (MQ=255) TGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTg > 3:118885‑M1/1‑141 (MQ=255) gagaAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataaga < 3:378405‑M1/141‑134 (MQ=255) gagaAAGAaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataaga < 2:191805‑M1/141‑134 (MQ=255) aaagaaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataagataa < 2:5822‑M1/141‑137 (MQ=255) AAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTGTAgg > 3:420228‑M1/1‑141 (MQ=255) AAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTGTAgg > 2:435137‑M1/1‑141 (MQ=255) aagaaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataagataag < 2:201234‑M1/141‑138 (MQ=255) AAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCGCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTGTAGGa > 1:675618‑M1/1‑141 (MQ=255) agaaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataagataagc < 1:1014463‑M1/141‑139 (MQ=255) gaaccatagcatattaaacgaatatagcatcgtttacatttatggcggtgatctttctcacttttaactttatgaatttaaattaaacaatttctctgcatttttagttgtttgttcgcacacttcttcataagataagcc > 2:799471‑M1/1‑2 (MQ=255) ATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTGTAGGAAgg > 2:1099588‑M1/1‑141 (MQ=255) ATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTGTAGGAAgg < 1:743952‑M1/141‑1 (MQ=255) ATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTGTAGGAAgg > 2:859706‑M1/1‑141 (MQ=255) | AATGAACCGGCGAGAGTAACTTTAGTAGCTGAACAAATTGCTGAATTAAAAGGCTTATCTTATGAAGAAGTGTGCGAACAAACAACTAAAAATGCAGAGAAATTGTTTAATTTAAATTCATAAAGTTAAAAGTGAGAAAGATCACCGCCATAAATGTAAACGATGCTATATTCGTTTAATATGCTATGGTTCTTTCTCACTTTTTTAAATTAAAATATCGTGCATGTGGAATACGTGCGATAGAGATGGTTAGAGCTTTGAAATTAAGAATTGTAGGAAGG > USA300TCH1516_ALE/528337‑528617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |