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(MQ=255) tttGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACAt < 1:128653/141‑1 (MQ=255) tttGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACAt < 4:503630/141‑1 (MQ=255) tGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACATaa < 1:915314/141‑1 (MQ=255) gACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACATaaa > 3:74924/1‑141 (MQ=255) ccTTTAGTAGTGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACATAAAAACtt < 2:573509/141‑1 (MQ=255) ccTTTAGTAGTGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATGATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAAAAAAAAAAAAAAAACtt < 4:383764/141‑1 (MQ=255) tttAGTAGTGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACATAAAAACtttt < 2:803440/141‑1 (MQ=255) gtGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTGTTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACATAAAAACTTTTaacacaa > 2:197748/1‑141 (MQ=255) gtGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACATAAAAACTTTTaacacaa > 2:221549/1‑141 (MQ=255) tGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACATAAAAACTTTTaacacaac > 2:1023045/1‑141 (MQ=255) | TTTTTGAATTGTATTTTAATAAAAATGATATAAGTTATAATAAAGGTGTACCTTCGATAACGAATAAACATCTCTTAAAAGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACGTTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTAAACATAAAAACTTTTAACACAAC > USA300TCH1516_ALE/854240‑854518 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |