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| * | USA300TCH1516_ALE | 618,759 | 0 | T | C | 6.8% | 402.0 / 3.6 | 148 | D1287D (GAT→GAC) | sdrD | Serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
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Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
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2:642749/1‑141 (MQ=255) cGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCaa > 1:608352/1‑141 (MQ=255) ggATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAAt > 3:165114/1‑141 (MQ=255) gATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATg > 2:116233/1‑141 (MQ=255) tAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCTGACTCAGACATTTATTCAGACTTAGACTGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATGAg > 3:300245/1‑141 (MQ=21) gATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATGCAGGTAAGCACACACCTGTTAAACCAATGAGtact > 4:202248/1‑141 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |