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* | USA300TCH1516_ALE | 1,055,126 | 0 | T | G | 5.2% | 420.3 / 13.9 | 133 | T352T (ACA→ACC) | patA_2 | Putative N‑acetyl‑LL‑diaminopimelate aminotransferase |
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4:76143/1‑141 (MQ=255) ccGAATTCTGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATTGCTAAATGTGTTGATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAAtc > 2:188463/1‑141 (MQ=255) cGAATTCTGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATTGCTAAATGTGTTGATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAAtct > 2:1075121/1‑141 (MQ=255) gAATTCGGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATTGCTAAATGTGTTGATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAAtctc > 1:557383/1‑141 (MQ=255) aaTTCTGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATTGCTAAATGTGTTGATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAATCTCa < 2:127027/141‑1 (MQ=255) ttCTGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATTGCTAAATGTGTTGATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAATCTCaaa < 2:330475/141‑1 (MQ=255) ttCTGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATCGCTAAATGTTTTGATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAATCTCaaa < 3:270213/141‑1 (MQ=255) cTGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATTGCTAAATGTGTTGATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAATCTCAAAAc < 1:733236/141‑1 (MQ=255) tGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATTGCTAAATGTGTTTATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAATCTCAAAAcc < 1:941359/141‑1 (MQ=255) | TGAATTTAGTTCACGACGTCCAGTTCAACATATCATTTTTATTTAGTATTTAAATATTTAGCAAGTCTCTTCATACCTTCTTTTAAAACATCCATTTCATAAGCATAGGAAATCCTTACAAATCCTTTACCGAATTCTGTAAAGGATGAGCCTGGAACGATTGCTAAATGTGTTGATTCAAGTAAATCGACACAAAATTCGAAATCGTCATCGGTGATATGTTTAATACTTGGGAAAATATAAAACGCGCCTTCAGGTTGAGCGGTAATCTCAAAACC > USA300TCH1516_ALE/1054989‑1055266 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |