BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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gtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaa                                                                                                                                             <  2:155165‑M1/1‑1 (MQ=255)

 tcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaa                                                                                                                                            <  1:424821‑M1/2‑1 (MQ=255)

 gggCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCACACTTGACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaa                                                                                                                                            <  1:325563/141‑1 (MQ=255)

   gCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTATTAACTAAAATTAATTTTaaaa                                                                                                                                          <  1:429827/141‑1 (MQ=255)

    cGTACAGTACAGATGACTAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaaa                                                                                                                                         <  2:171593/141‑1 (MQ=255)

         aGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATAAATATaaaaaacaaaa                                                                                                                                    >  1:812/1‑136 (MQ=255)

          ttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTAtt                                                                                                                                   <  2:716953‑M1/11‑1 (MQ=255)

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             ccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGAc                                                                                                                                >  1:675128‑M1/128‑141 (MQ=255)

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             ccatgccgaacacagaagtaaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgcaagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatgaaaaaaaaaaAAAAAGTTATTGAc                                                                                                                                >  2:34038‑M1/128‑141 (MQ=255)

               gATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAATAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACtt                                                                                                                              <  1:375464/141‑1 (MQ=255)

                atcactaaGGTGTAATTTTTATTGTTGTTAAGCAGATTGATAGCCTATATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTa                                                                                                                             <  2:777991/135‑1 (MQ=255)

                aTGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTa                                                                                                                             <  2:809765/141‑1 (MQ=255)

                   aCAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGAATGTATAGTATATTGTTGTTGAGGCAACCACAACAACTCAACTTAGGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAAt                                                                                                                          >  2:301493/1‑141 (MQ=255)

                     aacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        >  1:806851‑M1/120‑141 (MQ=255)

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                      acacagaagttaagctcctgagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                       <  1:501450‑M1/23‑1 (MQ=255)

                      aatgtgtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGGTTGAAAGTCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                       <  2:739066/138‑1 (MQ=255)

                       aaaagaagttaagatccttagcgttgatgatagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaataaataaaaaaaaaaaaaaaaAAAAAGTTATTGACTTAAATgttg                                                                                                                      >  2:406025‑M1/118‑140 (MQ=255)

                        ggTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTTTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaa                                                                                                                     <  1:569961/141‑1 (MQ=255)

                         cagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAatgttgat                                                                                                                    <  1:281135‑M1/26‑4 (MQ=255)

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                                                                                gAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGa                                                             >  2:163745/1‑141 (MQ=255)

                                                                                 aacgttgccaggcagttttttaatcaaattgtggttaaaaaataaaatggaccacataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAc                                                            <  1:24499‑M1/82‑1 (MQ=255)

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                                                                                  ggCAAACAAAACAACGCAACTTAAGAAATAACTTGAATTGATAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGCCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACa                                                           <  2:552319/141‑1 (MQ=255)

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                                                                                    gttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat                                                         <  1:695473‑M1/85‑1 (MQ=255)

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                                                                                            acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACACTATGTCAAc                                                 >  2:630338/1‑141 (MQ=255)

                                                                                            acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAc                                                 >  1:121291/1‑141 (MQ=255)

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                                                                                               gttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt                                              <  1:160860‑M1/96‑1 (MQ=255)

                                                                                                  ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAATCTGAATGACAatatgtcaaaaaaaaa                                           >  2:501450‑M1/43‑134 (MQ=255)

                                                                                                  ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt                                           >  1:388918‑M1/43‑141 (MQ=255)

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                                                                                                    ttaatcaaatgttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTc                                         >  2:424821‑M1/41‑141 (MQ=255)

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                                                                                                       atcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                      <  1:805943‑M1/104‑1 (MQ=255)

                                                                                                        acaaattttggttaaaaaataaaatagaaaaaataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa                                     >  2:81608‑M1/37‑141 (MQ=255)

                                                                                                         caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTACTTCCaaaa                                    <  1:104686‑M1/106‑1 (MQ=255)

                                                                                                         caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                    >  2:58836‑M1/36‑141 (MQ=255)

                                                                                                         aGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                    <  1:663824/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                          aaaaaaaCTTGAATTAATAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaa                                   <  2:133180/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                          aaaaTAATATGAATTAATAACGAAAATTAATTTAAAAAAGTGATTGACTTAAATGTTAATAACATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATGCCaaaaa                                   <  2:680621/140‑1 (MQ=37)

                                                                                                           aaatatggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa                                  >  1:554913‑M1/34‑141 (MQ=255)

                                                                                                                 cTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAAAGAACATTCAAAACTGAATGACAATATTTCAACAGTAATTCCAAAAAACGTAAc                            >  1:531826/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                   tGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTATTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACCATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACta                          >  1:145739/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                    gAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATACAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtat                         >  2:184931/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                          cTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa                   <  1:595663/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                          ataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAAGATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTAtaagata                   <  2:290097‑M1/123‑4 (MQ=255)

                                                                                                                           taaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAc                  <  2:96191‑M1/124‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             aaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAgttaaaa                <  1:94445‑M1/126‑4 (MQ=255)

                                                                                                                               atggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAAc              <  2:272142‑M1/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTCATTCCGATCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt       >  1:325587/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAGAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAGTATGTCAAGGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTGCCAAcctacttt       >  2:258068/1‑134 (MQ=25)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt       >  2:530480/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt       <  2:184798/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                       attTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTa      >  1:489530/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                        tcttAAAAAGGTATTGACTTGAACTTAAAGAAAATGCATAATTAATTCTTGTCGGTAAGACAAATGAACGTTGACAACTCAATGACCAAACGTCAGCCTGCATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTGACAAACATCATATAg     >  2:262563/3‑141 (MQ=16)

                                                                                                                                        ataaAAAAAGTTATTGTCTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg     >  2:334736‑M1/5‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                        ataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg     >  2:684421‑M1/5‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                          aaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATAGGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTAACAAACATCATTTAGTa   <  2:775231‑M1/139‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                           aAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAt  <  1:105459‑M1/140‑1 (MQ=255)

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  USA300TCH1516_ALE/512480‑512759

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.