Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 1,435,065 | 0 | C | G | 20.0% | 200.2 / 10.9 | 76 | A141G (GCT→GGT) | dapH | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (21/39); new base G (15/0); total (36/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTAAAG > USA300TCH1516_ALE/1434926‑1435211 | aTTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATGGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTgg > 1:897611/1‑149 (MQ=255) ttcaaacAGGTGCGCTTATTAGAGAACAAGCCATTAGTGAAGTTGGGGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCGGTGGTAGTCGAGGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt < 2:401770/143‑1 (MQ=255) aaCCCGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAGGGTACAATGTTTGATATGAATGATACTCTCGGTGGTCGTGCTACAAATGGTaaa > 1:520997/1‑149 (MQ=255) aaCCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACCACTGGTaaa > 1:191083/1‑149 (MQ=255) aaCCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGGCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaa < 1:550280/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaaa < 1:338186/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCCACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaaa < 1:47898/149‑1 (MQ=255) aGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTGGTGCTACAACTGGTAAAAATg > 1:925293/1‑149 (MQ=255) ggggCGTTGATTAGAGAACAAGCCATTATTGACGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAGGGCACAATGGATGATAGGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGGTATCACTGGCaaaaaaga > 2:458683/4‑146 (MQ=255) ggggCGGTTATCAGGGAACAAGCCATGATTGGGGAGGGTGCTGTGGGTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGGAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGt < 2:28481/146‑1 (MQ=255) ggTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGt > 1:486375/1‑149 (MQ=255) tGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGGTACAACTGGTAACAATGTaa > 1:853126/1‑148 (MQ=255) tGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATCGAGGCTGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAACATGTAc > 1:1102733/1‑149 (MQ=255) cGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCGGGCTTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt < 1:483069/149‑1 (MQ=255) attaGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGGCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAgg > 2:693791/1‑149 (MQ=255) gagaACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACCATTGGTAAAAAAGTACATGTAGGGGCt > 2:184158/1‑149 (MQ=255) agaACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCGGTATCATTAATAAAAAAAAACATGTAGGGGCTg > 2:365576/1‑149 (MQ=255) aaCAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGgc > 1:1010377/1‑149 (MQ=255) 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aaGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCa < 1:372861/149‑1 (MQ=255) aGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAg < 1:33577/149‑1 (MQ=255) ggcATTATTGAAGTTGGTGCAGTCGTGTGGATGGGCGAAACAATTTATATTGGCGCAGGCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGt < 2:17389/147‑1 (MQ=255) gCCATTAATAAAATTGGCGCTGTTGTAATGATGGGCGGAACAAGTAATATTTGTGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTAAAACTGGTAAAACTGTACACGTAGGGGCTGGCGCatt < 2:380207/149‑3 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTa > 1:972679/1‑149 (MQ=255) ccATTAGTGAAGATGGGGCGGTCGGTATGATGGAGGCAAGAGTTTTCAGTGGCGCAGTCGTTGGGGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTa < 2:235268/149‑1 (MQ=255) aacaTGGTGCTGTCGTTACGATGGCCGCAACAAGTAATATTGGCGCAGTCCTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGACTGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAACAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGgt < 1:112362/146‑1 (MQ=255) aaGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACCATTGAAAAAAAAGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAggg > 2:884882/1‑148 (MQ=255) aaGATGGTGCTGCCGTTATGAGGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGgt < 1:13634/149‑1 (MQ=255) aGATGGGGCTGACGTAAAGAAGAGAGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGgtg < 2:432792/149‑1 (MQ=255) gTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCGGTACCATTGAAAAAAAAGTACATGTAGGGGCTGGCGGAGTATTAGCAGGTGTGAtg > 2:409750/1‑148 (MQ=255) tGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCCTACCACTAGAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTg > 2:743054/1‑149 (MQ=255) gCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGa > 1:733012/1‑149 (MQ=255) ttgacGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGAGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGACATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGaa < 2:808003/145‑1 (MQ=255) tctgcGTAATGAGGGGCGCAACAATTAATATTTGCGCAGTCGTTGGGGAAGGTTCAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTATAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTGGCAGGTGTGATTGaa < 2:518790/145‑1 (MQ=255) tGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAc > 1:512053/1‑149 (MQ=255) ctctattatGGGTGCAATAATTAAGATTGGCCCAGTCGTTGGCGAATGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTGGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAcccc < 1:508444/146‑1 (MQ=255) cGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAcccc < 1:908804/149‑1 (MQ=255) tgatgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGGATTAACAGGTGAGATTGAACCCCCtcgg > 2:929789/1‑146 (MQ=255) gccacaaATAATATTGGCGCAGTCGTTTGCGCAGGTACAACGATTGATATGAATGCTACCCACGGTGGTGGTGAAAAAAATAGAAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCAcc < 2:673980/146‑1 (MQ=255) gcAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACCCTCGGTGGTCGTGCTACAACTTGTAAAAATGTACAAGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCAcc < 1:235546/149‑1 (MQ=255) ccaataaTTAAGATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATCATTGATATGATTGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCAcc < 2:701879/148‑1 (MQ=255) acaaTTAATGTTGGCGCAGTGGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACGCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGt < 2:188994/149‑1 (MQ=255) aaTATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGAAGGTGGGATTGAACCACCTAGTGCTTCACCGGTTATAAt > 2:125737/1‑149 (MQ=255) atatTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTCGTATCATTAAAAAAAAAGTACATGTAAGGGCTGGCACCGTATTAACCGGTGAGATGGAACCCCCT‑GTGCTTCACCGGTCATAAtgg > 2:487600/1‑147 (MQ=255) atTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCTTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGa < 1:560471/149‑1 (MQ=255) atTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCGCAGTGCTTCACCGGTTATAATCGa < 1:560514/149‑1 (MQ=255) tGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAgg > 1:257297/1‑149 (MQ=255) tGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAgg > 1:173076/1‑149 (MQ=255) gcgcAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGgat > 1:68885/1‑149 (MQ=255) cgcAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAAAACATGTCGGGGCTGGACCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAACCCCTAGTGCTTCACCGGTTCTAATCGTGgaag > 2:613427/1‑147 (MQ=255) cgcgcagtGGGGAAGATAAAATGAGTGATATGAATGCGACGGTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATGAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGgatgat < 2:473085/142‑1 (MQ=255) tccttGTCGAATGTACAATGATTGATATGAAGGCTTCTCGCGGTGGTCGTGCTACAACTGGGAAAAATGTACAGGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGGGATTGATCCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTa < 2:873537/146‑1 (MQ=255) ttGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTa < 1:184158/149‑1 (MQ=255) gccaaGGGACAATGATTGATAGGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGTAGGTGGGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATc < 2:216993/146‑1 (MQ=255) 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gatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTAt < 2:867890/149‑1 (MQ=255) ataaGAATGCTACTCTGGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGAAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTGAtt < 2:299491/149‑1 (MQ=255) tatGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTAttt > 1:556315/1‑149 (MQ=255) tatGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAAAACATGTGGGGGGTAGCGCAGAATTGGCAGATAAGATTGAACGCCCTAGTGCTGCACCGGTTATAATCGAGGATGACGTATCAATCAGTGCCAATTCAGTTAttt > 2:175817/1‑149 (MQ=255) gAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCACAGTATTGGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAGTCGAGGATGATGTATTAACAGGTGCAACAGCCATTACTTTAg > 2:1096910/1‑149 (MQ=255) aTGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGaa > 1:15024/1‑149 (MQ=255) aTGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAAAACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGACCCACGCGGTGATGCAGCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCCACTGCAGTTTTTTTAGaa > 2:951958/1‑149 (MQ=255) aCTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAAGGCAGTTATTTTAGAAGgtgt > 1:313239/1‑149 (MQ=255) ctcGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAAGCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACg > 1:234686/1‑149 (MQ=255) gtggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGtt < 1:693791/149‑1 (MQ=255) tggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTg < 1:450005/149‑1 (MQ=255) gtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGt > 2:703379/1‑149 (MQ=255) tGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATGATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTAAAg > 2:140423/1‑149 (MQ=255) | ATTGAACCAGGTGCGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTAAAG > USA300TCH1516_ALE/1434926‑1435211 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |