New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 14186 | 290 (1.010) | 16 (0.060) | 14/142 | NT | 5.5% | intergenic (+87/‑563) | serS_1/ygaZ | Serine‑‑tRNA ligase/Inner membrane protein YgaZ |
? | USA300TCH1516_ALE | = 14200 | 292 (1.150) | intergenic (+101/‑549) | serS_1/ygaZ | Serine‑‑tRNA ligase/Inner membrane protein YgaZ |
Only 100 of 445 total aligned reads displayed.
ATAAAGGCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGTTTAAT > USA300TCH1516_ALE/14096‑14276 | ataaaGGCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGG > 2:2994475‑M1/1‑91 (MQ=255) aaGGCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGa < 2:4944640/91‑1 (MQ=255) aGGCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGAc < 1:1054242/91‑1 (MQ=255) aGGCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGAc > 1:2648492/1‑91 (MQ=255) aGGCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGAc < 2:627042/91‑1 (MQ=255) ggCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACg > 1:2858398/1‑91 (MQ=255) gCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGa < 1:3973657/91‑1 (MQ=255) cTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGaa > 2:4593742/1‑91 (MQ=255) tttAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAg > 1:1857947/1‑91 (MQ=255) tttAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAg < 1:2276710/91‑1 (MQ=255) gCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGcgacagcttcgt < 1:1418831‑M1/91‑13 (MQ=255) gCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGt < 1:1676838/91‑1 (MQ=255) gCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGt > 1:3563125/1‑91 (MQ=255) tACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCg < 1:3048811/91‑1 (MQ=255) acgaGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGc < 1:4251922/88‑1 (MQ=255) cAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGcc > 1:4205915‑M2/1‑89 (MQ=255) cAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGcc > 1:1323137‑M2/1‑89 (MQ=255) cAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGcc > 2:4182174‑M2/1‑89 (MQ=255) aGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGccac > 1:510313‑M2/1‑87 (MQ=255) aGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGccac > 2:4718037‑M2/1‑87 (MQ=255) gCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGccact > 2:5140549‑M2/1‑86 (MQ=255) gCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGccact > 1:3829501‑M2/1‑86 (MQ=255) ttAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGccactttt < 2:2406436‑M2/91‑9 (MQ=255) ttAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGccactttt < 1:2007253‑M2/91‑9 (MQ=255) tAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGccacttttt < 2:1810134‑M2/91‑10 (MQ=255) aaaaGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACttttttt > 1:213318/1‑91 (MQ=255) aaGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTtgt < 2:2303349/91‑1 (MQ=255) atatatCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTg > 1:1243761/1‑91 (MQ=255) atatatCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTg > 2:1970443/1‑91 (MQ=255) atatatCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACATTTTTTGTGCTg > 2:3623080/1‑91 (MQ=255) atatCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTa > 1:3649358/1‑91 (MQ=255) tatCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTaa < 2:848246/91‑1 (MQ=255) tatCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCAACTTTTTTTGTGCTGTaa > 2:137471/1‑91 (MQ=255) aCGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAACAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGta > 2:1145372/1‑91 (MQ=255) aCGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGta < 2:2331412/91‑1 (MQ=255) gTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGtata < 2:127186/91‑1 (MQ=255) tataCTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTataa > 1:2404644/1‑91 (MQ=255) ataCTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTataat < 1:3415260/91‑1 (MQ=255) ataCTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTataat > 1:5312642/1‑91 (MQ=255) taCTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTataata > 1:3850482/1‑91 (MQ=255) aCTTAAAGCTAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTTACGAATCTGTCGCTACTTTTTTTGTGCTGTAACAGTATAATAg > 2:1726762/1‑91 (MQ=255) aCTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAg < 1:621113/91‑1 (MQ=255) aCTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAg < 1:3233221/91‑1 (MQ=255) aaGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGc > 1:5046614/1‑91 (MQ=255) gCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCa > 2:1996605/1‑91 (MQ=255) gCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCa > 2:1029222/1‑91 (MQ=255) cAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAGAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCaa < 1:5238077/91‑1 (MQ=255) aGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATg > 2:5004179/1‑91 (MQ=255) aGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATg < 1:2501398/91‑1 (MQ=255) gggCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTTTTTTGTTTAAGTATAATAGTGAGCCAATGc > 2:4905269/1‑91 (MQ=255) gggCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGCGCCAATGc > 2:1881503/1‑91 (MQ=255) gggCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGc > 2:4255638/1‑91 (MQ=255) gggCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGc > 2:1589985/1‑91 (MQ=255) gggCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTCAGCCAATGc > 2:5359134/1‑91 (MQ=255) aaGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACAt > 1:5610979/1‑91 (MQ=255) aaGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACAt < 2:4794818/91‑1 (MQ=255) aGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATa > 2:785289/1‑91 (MQ=255) gATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATaa > 1:90301/1‑91 (MQ=255) gATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATaa > 2:1497736/1‑91 (MQ=255) aTACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATaac < 1:5444210/91‑1 (MQ=255) aTACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATaac < 1:4912971/91‑1 (MQ=255) aTACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATaac < 1:390226/91‑1 (MQ=255) tACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATaaca < 1:4329621/91‑1 (MQ=255) cTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATaacaac > 2:2153011/1‑91 (MQ=255) cTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATaacaac > 1:694217/1‑91 (MQ=255) ttAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAAcaacaa > 1:2194484/1‑91 (MQ=255) ttAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAAcaacaa > 1:4865329/1‑91 (MQ=255) ataataTTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATaaa < 2:2682482/91‑1 (MQ=255) taataTTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAAt > 1:3728438/1‑91 (MQ=255) aataTTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAAtt < 2:4053666/91‑1 (MQ=255) atatTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTa > 2:3065875/1‑91 (MQ=255) atatTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTa > 1:4570800/1‑91 (MQ=255) tatTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTaa < 1:1911875/91‑1 (MQ=255) tatTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTaa > 1:5474416/1‑91 (MQ=255) ttttAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGt < 1:3156150/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGt > 1:4544574/1‑91 (MQ=255) ttAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGttt < 1:4963846/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGttt > 2:3248763/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGACGGAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTtg < 2:4351232/91‑1 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTtg < 2:3563125/91‑1 (MQ=255) aaaaaGTGGcgacagcttcgtcaccactttttaaaatattatttaaagtctcttgcccttgctttaagtatacgtagatatatacttttta < 2:5218268‑M1/91‑83 (MQ=255) aaaaaGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTtgt < 1:1508396/91‑1 (MQ=255) aaaaGTGGcgacagcttcgtcaccactttttaaaatattatttaaagtatcttgcccttgctttaagtatacgtagatatatactttttaa < 1:2128551‑M1/91‑84 (MQ=255) aaaaGTGGcgacagcttcgtcaccactttttaaaatattatttaaagtatcttgcccttgctttaagtatacgtagatatatactttttaa < 2:2891304‑M1/91‑84 (MQ=255) aaaGTGGcgacagcttcgtcaccactttttaaaatattatttaaagtatcttgcccttgctttaagtatacgtagatatatactttttaaa < 2:4014261‑M1/91‑85 (MQ=255) aaaGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTgg < 2:3932225/91‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTgg < 1:786829/91‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTGTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTgg < 1:3486739/91‑1 (MQ=255) aaGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGt > 1:2792839/1‑91 (MQ=255) aGTGGcgacagcttcgtcaccactttttaaaatattatttaaagtatcttgcccttgctttaagtatacgtagatatatactttttaaagc > 2:32116‑M1/1‑5 (MQ=255) aGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGTGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGtt < 2:280377/91‑1 (MQ=255) gtggtgACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTTTTCTTTTTAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGttt > 2:3019777/1‑91 (MQ=255) gtggtgACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGttt > 1:332310/1‑91 (MQ=255) tggtgACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGTTTa > 1:4075212/1‑91 (MQ=255) ggtgACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATCGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGTTTaa > 2:4029761/1‑91 (MQ=255) ggcgacagcttcgtcaccactttttaaaatattatttaaagtatcttgcccttgctttaagtatacgtagatatatactttttaaagcttg > 2:3166500‑M1/1‑2 (MQ=255) gtgACGAAGCTGTCGccactttttaaaatattatttaaagtatcttgcccttgctttaagtatacgtagatatatactttttaaagcttgt < 2:5500634‑M2/91‑77 (MQ=255) gtgACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGTTTAAt > 1:3078861/1‑91 (MQ=255) gtgACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGTTTAAt < 1:1171804/91‑1 (MQ=255) gcgacagcttcgtcaccactttttaaaatattatttaaagtatcttgcccttgctttaagtatacgtagatatatactttttaaagcttgt < 1:1464301‑M1/91‑91 (MQ=255) | ATAAAGGCTTTAGCTACAAGCTTTAAAAAGTATATATCTACGTATACTTAAAGCAAGGGCAAGATACTTTAAATAATATTTTAAAAAGTGGTGACGAAGCTGTCGCCACTTTTTTTGTGCTGTAAAAGTATAATAGTGAGCCAATGCACATAACAACAATAAATTAAGTTTGTGGTTTAAT > USA300TCH1516_ALE/14096‑14276 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |