New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2483085 = | 346 (1.200) | 20 (0.080) | 11/136 | NT | 6.8% | intergenic (+5/‑158) | hssS/USA300HOU_RS12790 | Heme sensor protein HssS/putative HTH‑type transcriptional regulator |
? | USA300TCH1516_ALE | 2483126 = | 256 (1.050) | intergenic (+46/‑117) | hssS/USA300HOU_RS12790 | Heme sensor protein HssS/putative HTH‑type transcriptional regulator |
Only 100 of 432 total aligned reads displayed.
TATGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGTTT > USA300TCH1516_ALE/2483036‑2483216 | tATGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCTCTTTAATCTCTTCCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTAt < 1:4708957/91‑1 (MQ=255) tagaaattaaatgttaagtggctagaaagcgctaatcaatataaaagaTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATc > 1:3906475‑M1/49‑91 (MQ=255) tGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCt > 1:3305610/1‑91 (MQ=255) agaaattaaatgttaagtggctagaaagcgctaatcaatataaaagaTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCt > 1:2807111‑M1/48‑91 (MQ=255) accaccTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTta > 2:456542/1‑91 (MQ=255) cTTTACTATTACGCTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTg > 1:822514/1‑91 (MQ=255) cTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTg < 1:3088821/91‑1 (MQ=255) cTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTg < 1:4264941/91‑1 (MQ=255) tttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGa < 1:141802/91‑1 (MQ=255) tttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGa > 1:2111371/1‑91 (MQ=255) tttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGa > 2:582174/1‑91 (MQ=255) ttACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGAt < 2:904116/91‑1 (MQ=255) aCTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTa < 1:1840886/91‑1 (MQ=255) aCTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTa > 1:3406021/1‑91 (MQ=255) aCTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTa > 2:3917076/1‑91 (MQ=255) cTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAg > 1:4069215/1‑91 (MQ=255) tATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgc < 2:3139539/91‑1 (MQ=255) tATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgc < 1:1565453/91‑1 (MQ=255) aTTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgcg > 1:4372488/1‑91 (MQ=255) aTTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgcg > 1:4658151/1‑91 (MQ=255) aTTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgcg < 2:4167137/91‑1 (MQ=255) aTTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgcg < 2:671785/91‑1 (MQ=255) aTTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAgcg < 1:1884394/91‑1 (MQ=255) tACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCt > 1:2913028/1‑91 (MQ=255) acacTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCtt < 1:2490/91‑1 (MQ=255) acTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTc < 2:5006230/91‑1 (MQ=255) cTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCt < 2:1874429/91‑1 (MQ=255) cTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCt < 1:5641807/91‑1 (MQ=255) cTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCt > 1:5374735/1‑91 (MQ=255) tGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTa > 2:2823079/1‑91 (MQ=255) tGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTa < 1:1228212/91‑1 (MQ=255) gCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAg < 2:1539525/91‑1 (MQ=255) ccAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGc < 1:2745952/91‑1 (MQ=255) cAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGcc > 2:859406/1‑91 (MQ=255) cAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGcc > 1:4835753/1‑91 (MQ=255) aataatTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCAc > 2:1262409/1‑91 (MQ=255) gctaatcaatataaaagaTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACt > 1:2626167‑M1/19‑91 (MQ=255) ataatTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACt > 2:2185504/1‑91 (MQ=255) taatTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACtt < 2:1170583/91‑1 (MQ=255) taatTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACtt < 1:4572437/91‑1 (MQ=255) atTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTaa < 2:1919555/91‑1 (MQ=255) atTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTaa > 2:4285137/1‑91 (MQ=255) atTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTaa > 1:3153215/1‑91 (MQ=255) ttCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAAc < 2:1073298/91‑1 (MQ=255) tCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑TAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGCGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACa < 2:5231847/91‑1 (MQ=255) tCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACa < 2:345160/91‑1 (MQ=255) tCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACa > 2:4971212/1‑91 (MQ=255) tCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACa > 2:4509553/1‑91 (MQ=255) tCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATATCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACa > 1:4759861/1‑91 (MQ=255) cACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACAt < 1:1737319/91‑1 (MQ=255) aatataaaagaTACCTCCTGAAATAAAAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAAc > 1:4422332‑M1/12‑91 (MQ=255) aCTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTTTATTTTTTTCACGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACAtt > 2:5448256/1‑91 (MQ=255) aCTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACAtt > 1:886125/1‑91 (MQ=255) aCTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACAtt > 1:3578692/1‑91 (MQ=255) aTCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAAttt > 1:221329/1‑91 (MQ=255) aTCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAAttt < 1:1087194/91‑1 (MQ=255) aTCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAAttt < 1:4965857/91‑1 (MQ=255) aTCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATATAAttt > 2:5163252/1‑91 (MQ=255) tctcTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTc > 2:330533/1‑91 (MQ=255) ctctACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCt < 1:1344386/91‑1 (MQ=255) ctACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTAc < 2:3578692/91‑1 (MQ=255) aagatacctcctgaaataaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTc > 2:2838136‑M2/46‑91 (MQ=255) TACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGTTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTAcc < 2:1214798‑M1/91‑1 (MQ=255) TACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTAcc < 1:2877610‑M1/91‑1 (MQ=255) TACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTAcc < 2:5056930‑M1/91‑1 (MQ=255) CCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCAt > 1:1018867‑M1/1‑91 (MQ=255) CTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCAtt < 1:3806406‑M1/91‑1 (MQ=255) TCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTc > 1:5543536‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTca > 1:3634964‑M1/1‑91 (MQ=255) TGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaac > 2:1637940‑M1/1‑91 (MQ=255) GAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaaca < 1:5012930‑M1/91‑1 (MQ=255) GAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaaca > 2:402538‑M1/1‑91 (MQ=255) AAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTcaacaa < 2:5513233‑M1/91‑1 (MQ=255) taaaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAt > 2:5597969‑M2/30‑91 (MQ=255) aaaacagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAttt > 2:3779532‑M2/28‑91 (MQ=255) aCATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAAttt < 2:4054357/91‑1 (MQ=255) cATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTa > 2:4785324/1‑91 (MQ=255) tttCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATCTTGAGTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTaaa < 2:2356615/91‑1 (MQ=255) tttCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTaaa < 2:3745852/91‑1 (MQ=255) tttCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTaaa < 1:596106/91‑1 (MQ=255) tttCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTaaa < 1:5393056/91‑1 (MQ=255) acagaaatgttttttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTaaa > 2:3214080‑M2/25‑91 (MQ=255) ttCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAat > 1:5114910/1‑91 (MQ=255) tttttATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATc < 2:1730155/91‑1 (MQ=255) tttATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGa > 2:2653858/1‑91 (MQ=255) aTTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATgg < 1:3205979/91‑1 (MQ=255) aTTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATgg < 2:4652513/91‑1 (MQ=255) tttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTGACATTTAATTTCTTCCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGt < 1:3054072‑M2/79‑1 (MQ=255) tttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGt < 2:1454907‑M2/79‑1 (MQ=255) ttcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTc < 1:5448256‑M2/80‑1 (MQ=255) tcaggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCa < 2:2991350‑M2/81‑1 (MQ=255) caggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCAt > 1:5212089‑M2/10‑91 (MQ=255) aggaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCAtt > 2:2453911‑M2/9‑91 (MQ=255) gaggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTa < 1:3779886‑M2/85‑1 (MQ=255) ggtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATg > 2:4399734‑M2/5‑91 (MQ=255) gtaTCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATgg > 2:1393080‑M2/4‑91 (MQ=255) aTCTTTTATATTTATTAGCGGTTTCTAGACACTTGTCATTTAATTTCTACCATTCATCAAAATTTCAATATATCGATGGTCATTTATgggt < 2:4718793/91‑3 (MQ=255) tCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGttt > 2:4820652/1‑91 (MQ=255) tCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGttt > 2:2053445/1‑91 (MQ=255) tCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGttt < 2:2011820/91‑1 (MQ=255) | TATGTAACCACCTTTACTATTACACTGCCAAATAATTCACTTTAATCTCTACCTCCTGAAA‑‑‑AAACATTTCTGTTTTTATTTCAGGAGGTATCTTTTATATTGATTAGCGCTTTCTAGCCACTTAACATTTAATTTCTACCATTCAACAAAATTTAAATATATCGATGGTCATTTATGGTTT > USA300TCH1516_ALE/2483036‑2483216 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |