Missing coverage evidence... | ||||||||||
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AAATTTTAAAATTATTAAACTCTTAACTTATACTACTTACAACCTTACATAGATAGTACTTTATTAATAGATAACTTATACTAAAAAAATATAAAGCATATAAATTAATCTATAATATCCGTATTAAATAATTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCTTTAAATACCTAATGTTATCGATATCTATTTCTGTCTCTTTATATTTCTCTAACAAGTTATATGCGGTAACTATTCTTT > USA300TCH1516_ALE/2348714‑2348969 | aaaTTTTAAAATTATTAAACTCTTAACTTATACTACTTACAACCTTACATAGATAGTACTTTATTAATAGATAACTTATACTAAAAAAATATAAAGCATATAAATTAATCTATAATATCCGTATTAAATAATTCATCTTCa > 1:573661/1‑141 (MQ=255) tACAACCTTACATAGATAGTACTTTATTAATAGATAACTTATACTAAAAAAATATAAAGCATATAAATTAATCTATAATATCCGTATTAAATAATTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCt > 2:501440/1‑141 (MQ=255) cTTTATTAATAGATAACTTATACTAAAAAAATATAAAGCATATAAATTAATCTATAATATCCGTATTAAATAATTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCTTTAAATACCTAATGTTATCGa < 2:573661/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTATAAAGCATATAAATTAATCTATAATATCCGTATTAAATAATTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCTTTAAATACCTAATGTTATCGATATCTATTTCTGTCTCTTTATAttt < 1:501440/141‑1 (MQ=255) atatAAATTAATCTATAATATCCGTATTAAATAATTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCTTTAAATACCTAATGTTATCGATATCTATTTCTGTCTCTTTATATTTCTCTAACAAGTtat > 2:262015/1‑141 (MQ=255) tatCCGTATTAAATAATTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCTTTAAATACCTAATGTTATCGATATCTATTTCTGTCTCTTTATATTTCTCTAACAAGTTATATGCGGTAACTAttcttt < 1:262015/141‑1 (MQ=255) ataatTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCTTTAAATACCTAATGTTATCGATATCTa < 3:11629/78‑1 (MQ=255) ataatTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCTTTAAATACCTAATGTTATCGATATCTa > 4:11629/1‑78 (MQ=255) | AAATTTTAAAATTATTAAACTCTTAACTTATACTACTTACAACCTTACATAGATAGTACTTTATTAATAGATAACTTATACTAAAAAAATATAAAGCATATAAATTAATCTATAATATCCGTATTAAATAATTCATCTTCAAAAATTATTGTATAAATATCATTTGTTATTATTTTCTTTAAATACCTAATGTTATCGATATCTATTTCTGTCTCTTTATATTTCTCTAACAAGTTATATGCGGTAACTATTCTTT > USA300TCH1516_ALE/2348714‑2348969 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |