| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1114090 = | 73 (0.820) | 4 (0.050) | 3/246 | 10.4 | 6.1% | intergenic (+19/+63) | USA300HOU_RS05510/mntH_1 | hypothetical protein/Divalent metal cation transporter MntH |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1114149 = | 60 (0.770) | intergenic (+78/+4) | USA300HOU_RS05510/mntH_1 | hypothetical protein/Divalent metal cation transporter MntH | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTGATGGCTCTTAATTTAATTGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTC > USA300TCH1516_ALE/1113954‑1114225 | tttGATGGCTTTTAATTTAATTGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAAc < 2:963700/141‑1 (MQ=255) gATGGCTCTTAATTTAATTGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATAATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACAAt > 2:770149/1‑141 (MQ=255) tGGCTCTTAATTTAATTGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTa < 2:196048/141‑1 (MQ=255) tGGCTCTTAATTTAATTGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTa < 2:249627/141‑1 (MQ=255) tttaatttgatTGCAATTGTCTTATGGGTGATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATg < 2:199987/140‑1 (MQ=255) ctTAATTTAATTGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATg < 1:467687/141‑1 (MQ=255) aatttaattGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTa < 1:974191/141‑1 (MQ=255) ttaattGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAgt < 1:4161/141‑1 (MQ=255) aattGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAgttg < 2:607497/141‑1 (MQ=255) attGTAATTGTGTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTATAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAgttgt < 2:42087/141‑1 (MQ=255) attGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAgttgt < 2:502116/141‑1 (MQ=255) attGCAATTGTCTTATGGGTTATAGTGATGAATATGTTGATTTATAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAgttgt < 2:312275/141‑1 (MQ=255) tGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTa < 1:676168/141‑1 (MQ=255) ttGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAattat < 1:528987/141‑1 (MQ=255) ttGTCTAATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAATAGAAACGACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCAAAAAAAATAAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAattat < 2:653212/141‑1 (MQ=255) tGTCGTATGGGTTATCGTTATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTAAAAAAAAAAAAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAattatt < 2:287265/141‑1 (MQ=255) gTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAAttatta > 2:781707/1‑141 (MQ=255) catATGGGTTATCGTTATGAATATGTTGATGTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACTAGTAGTATATTTATCATTAATATGTTCAGAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGa < 2:328691/139‑1 (MQ=255) aTGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATaa > 1:990188/1‑140 (MQ=255) tGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATAca < 1:987375/141‑1 (MQ=255) tGGGTTATCGTGATGATTAGGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACGACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATGGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATAca < 2:645469/141‑1 (MQ=255) tGGGTTAGCGTGATGATTATGTGGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTGATCATTAATATGTTCATAGGAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATAca < 2:154293/141‑1 (MQ=255) gTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATAcaacc > 2:939038/1‑141 (MQ=255) tCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGATAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACa > 2:48188/1‑141 (MQ=255) tCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACAAAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACa > 2:82867/1‑141 (MQ=255) gTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAtt < 1:135332/141‑1 (MQ=255) tgatgaTTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAttt < 2:347819/141‑1 (MQ=255) gatgatTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAtttt > 1:141592/1‑141 (MQ=255) gatgatTATGTAGACTTCTAAAAAGGACTCAAAACAAACAAACCATAAGGACGATGAGTAAAATTATGATTAATATGTACATAGAAAAAAAAAAACAATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGCTAAAAAAAACaatat > 2:337583/1‑137 (MQ=255) tGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGttt > 1:780689/1‑141 (MQ=255) tGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTGTAATGGttt > 1:146227/1‑141 (MQ=255) aTTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttt < 2:37043/141‑1 (MQ=255) aTTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttt > 1:785323/1‑141 (MQ=255) tCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTACTTATTAAATCAAACCAACTTTTTAACGGctttcggttta > 1:465071/1‑134 (MQ=255) tAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAAc > 1:569730/1‑141 (MQ=255) aaaaaaGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAGTTATTAGATGCAACCACAATTTTAATGGTTTTATTTTTAACt > 1:246892/1‑141 (MQ=255) taaTCAGTAGAAACTACACATTATGACGATGAGTATAATCATTCTTAATATGTTCATAGCAAAAGCATAAACATTAAAATGTTAAGTTGTTTATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTGTTAACTTTGTAg < 2:572710/140‑1 (MQ=255) tCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTc > 1:354295/1‑141 (MQ=255) aaaaGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCtt > 1:970532/1‑141 (MQ=255) aacaacACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATg < 1:751740/141‑1 (MQ=255) aacaCATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGttt > 1:303050/1‑141 (MQ=255) aacaCATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGttt < 1:879861/141‑1 (MQ=255) aacaCATAAGGACGATGAGTATACTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTGGTTCTTGGAATGttt > 2:89144/1‑141 (MQ=255) aacaCATAAGGACGATGAGTATACTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGttt > 2:287473/1‑141 (MQ=255) aacaCATAAGGAAGATGAGTATACTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGttt > 2:88944/1‑141 (MQ=255) acacATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTg > 2:540126/1‑141 (MQ=255) aacaTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGa < 1:760975/140‑1 (MQ=255) caTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAAc > 1:242926/1‑141 (MQ=255) aTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACg < 2:785323/141‑1 (MQ=255) tAAGGAAGATGAGTAGATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGa < 1:292882/141‑1 (MQ=255) aaaGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGa < 2:169977/140‑1 (MQ=255) aGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTACTGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGAtt > 1:424677/1‑141 (MQ=255) aTGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAg > 1:245351/1‑141 (MQ=255) aGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACa > 2:745107/1‑141 (MQ=255) gTATAGTGATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAt < 2:837234/141‑1 (MQ=255) tataATTATCATTAATTTGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAATATGTCAAGTTGTTAATTAGTAGATACCACCAACCTTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTCGAATGTTTGTACGATTAAATAGACAtt < 2:1041/141‑1 (MQ=255) actgttATGATTAATAGGTTGATAGCAAACGAAAGACCAGTAATTTTGTATGGTGTTAATTATTAGATACTTCCAACACTTTAATGCTTTTATCTTTAACTTTGTTGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAttt < 2:422244/137‑1 (MQ=255) tATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAAt > 1:746724/1‑141 (MQ=255) aTCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATa < 1:826802/141‑1 (MQ=255) tCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATAc > 1:896116/1‑141 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTATTGTTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAAACATTTaaattcct > 1:212611/1‑136 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACt < 1:702244/141‑1 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACt > 1:167333/1‑141 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCGTGCATTGTCATAACCATTAAATAGACATTTAAAATACt < 1:478104/141‑1 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGCTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACt < 1:676376/141‑1 (MQ=255) ttAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTa < 2:803484/141‑1 (MQ=255) tAATATGTTAAAAACAAAAAAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAg < 2:569730/141‑1 (MQ=255) aaTATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTAGAATGTTTGAGCGATTAAATAGACTATTAAAATACTTAGa > 2:521644/1‑141 (MQ=255) atGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaata < 1:54527/141‑1 (MQ=255) ttCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataata > 1:712483/1‑141 (MQ=255) aTAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAGATACTTAGAataataata > 1:917148/1‑141 (MQ=255) gCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAgt < 2:169248/141‑1 (MQ=255) aaaGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTCATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTc > 2:159299/1‑141 (MQ=255) | TTTGATGGCTCTTAATTTAATTGCAATTGTCTTATGGGTTATCGTGATGATTATGTTGATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTC > USA300TCH1516_ALE/1113954‑1114225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |