Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 2,223,916 | A→T | 6.2% | L420* (TTA→TAA) | atpA ← | ATP synthase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 2,223,916 | 0 | A | T | 6.2% | 194.4 / 2.1 | 67 | L420* (TTA→TAA) | atpA | ATP synthase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/30); new base T (3/2); total (35/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATTCTGCCCAGTGGTTTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCAGCAACTTTCTTCATTGC > USA300TCH1516_ALE/2223779‑2224055 | aTTCTGCCCAGTGGTTTAACTCGTCGTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATACACCCCAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAg > 2:498873/1‑140 (MQ=255) ttCTGCCCAGTGGTTTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTGATGCATAAATAATCAAAACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGa > 2:397584/1‑140 (MQ=255) gCCCAGTGGTTTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTc > 1:193734/1‑140 (MQ=255) gCCCAGTGGTTTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTc > 2:173868/1‑140 (MQ=255) gCCCAGTGGATTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTc > 1:403744/1‑140 (MQ=255) gTGGTTTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGAGTGCGACGGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAg < 1:17877/140‑1 (MQ=255) tGGTTTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGt < 1:494613/140‑1 (MQ=255) tGGTTTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGt > 2:449480/1‑140 (MQ=255) tAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGtt > 2:519987/1‑140 (MQ=255) gTCTTTAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCAc < 1:504445/140‑1 (MQ=255) cTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGCAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGt < 1:335240/140‑1 (MQ=255) taaaaCGTGTGATATCTTCAACTGGCATATCATCTAAATTTCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTTTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCt < 1:338521/139‑1 (MQ=255) cAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCt > 1:116001/1‑140 (MQ=255) aaaCGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCAACTGGTAATGGATTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTaa > 1:145320/1‑140 (MQ=255) atgtgtTATATCTACAACTGGAATATTATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTTGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAAtt < 1:548381/138‑1 (MQ=255) aCGTGTGATATCTACCACTGGAATATCATCTAAAAATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAAtt < 2:19006/140‑1 (MQ=255) cGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAAttt < 2:486278/140‑1 (MQ=255) gtgATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTTTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACt < 1:447507/140‑1 (MQ=255) tgATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACtt < 2:254419/140‑1 (MQ=255) atCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACATTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAg < 1:218700/140‑1 (MQ=255) atCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAg < 1:543164/140‑1 (MQ=255) aCTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATtc > 1:394017/1‑140 (MQ=255) aCTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATtc > 1:84537/1‑140 (MQ=255) tGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTAAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGAAGTAAATtcat > 1:496252/1‑140 (MQ=255) ggAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATtcatc > 2:248464/1‑140 (MQ=255) aaTATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCaa > 1:528539/1‑140 (MQ=255) tAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAAc < 1:549711/140‑1 (MQ=255) ataaTAACCTTTTGTTAATCTATAAATAACCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACATTACGTTTACCACGTTCTAATTTCCTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAAc < 2:71144/138‑1 (MQ=255) aaaTATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAAcc < 2:191325/140‑1 (MQ=255) atatCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGa > 2:439806/1‑140 (MQ=255) ttttGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATtgtg < 2:58634/140‑1 (MQ=255) gTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGACTGAACCGAATTGTGCaaa > 1:438023/1‑140 (MQ=255) ttAATGCATAAATAATCAACAGTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTATTGATATTGTTTTAAGACTTCAACAGTAAGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAATAAATTCATCAAGGTCTGACCAGAAGTGTTCAAAt > 2:202357/1‑140 (MQ=255) ttAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTGAGCAGTACGTTTAGCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAAGTCATCAAGGTCAGAACCGACTTGTGCAAAt > 2:410186/1‑140 (MQ=255) ataaataaTCAACACTTGGTGTTCGACTTGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCaa < 1:97705/140‑1 (MQ=255) taaataaTCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAg < 1:439806/140‑1 (MQ=255) aaataaTCAAGACTTGGTGTTCGAGTGGTCATGGTCCGGCCGGTGCGTGTTTTAAAACTGCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAgg > 1:402755/1‑139 (MQ=255) ataatCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTtc < 1:221717/140‑1 (MQ=255) aatCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTtctc > 1:362227/1‑140 (MQ=255) atCAACACTTGGTGTTGGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACATTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGATctct > 1:275191/1‑140 (MQ=255) tCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTg > 2:39735/1‑140 (MQ=255) cAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGt > 1:464597/1‑140 (MQ=255) ttGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTCCGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACg > 1:19173/1‑140 (MQ=255) ttGGGGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACg < 1:449814/140‑1 (MQ=255) tGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGc > 2:507209/1‑140 (MQ=255) ggTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCt < 2:52141/140‑1 (MQ=255) gtgtTCGACTGGGAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTTAGTCTTTTATAGTAGGTTTACCACGTTCTAATTTACGTGCAGTAAAGTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTa < 1:93870/140‑1 (MQ=255) tgtTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTTAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTaa < 1:534849/140‑1 (MQ=255) tgtTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCCCTGTATGACGCTaa < 1:306043/140‑1 (MQ=255) gACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCaa > 1:443815/1‑140 (MQ=255) cTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTCTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCAGTATGACGCTACGTCAAGa > 2:228790/1‑140 (MQ=255) tGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGac < 1:519987/140‑1 (MQ=255) gTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTGTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGacgt < 1:118214/140‑1 (MQ=255) tAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATAACGCTAAATCAAGacgta > 1:238385/1‑140 (MQ=255) tGGTTTGTTTTGATTGTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGacgtaacg < 2:452380/140‑1 (MQ=255) tGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTACGAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAAacgtaacg > 1:235289/1‑140 (MQ=255) gtttgtttTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGacgtaacgta < 1:272451/140‑1 (MQ=255) tgtttTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCa < 2:227893/140‑1 (MQ=255) tgtttTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCa < 2:507660/140‑1 (MQ=255) tgtttTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCa < 1:521090/140‑1 (MQ=255) tGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAGGACGTAACGTACCAGCAAc > 2:171916/1‑140 (MQ=255) tCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCAGCAACttt > 2:419791/1‑140 (MQ=255) gTTTTTAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCAGCGACTttgttc > 2:18242/1‑140 (MQ=255) gTTTTTAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCAGCAACTgtcttc > 2:18235/1‑140 (MQ=255) gTTTTTAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGAAGTAACGTACCAGCAACTttcttc > 2:18252/1‑140 (MQ=255) gTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCAGCAACTttcttc < 2:403744/140‑1 (MQ=255) ttAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCAGCAAGTTTCTTCAtt > 2:441568/1‑140 (MQ=255) aaGACTTCACAAGTACCCTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCAGCAACTTTCTTCATTGc > 2:120596/1‑140 (MQ=255) | ATTCTGCCCAGTGGTTTAACTCGTCTTCAAAACGTGTGATATCTACAACTGGAATATCATCTAAATATCCTTTTGTTAATGCATAAATAATCAACACTTGGTGTTCGACTGGTAATGGTTTGTTTTGATCTTGTTTTAAGACTTCAACAGTACGTTTACCACGTTCTAATTTACTTGCAGTAAATTCATCAAGGTCTGAACCGAATTGTGCAAATGATTCAAGTTCTCTGTATGACGCTAAGTCAAGACGTAACGTACCAGCAACTTTCTTCATTGC > USA300TCH1516_ALE/2223779‑2224055 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |