| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1954767 = | 287 (0.800) | 17 (0.060) | 8/138 | NT | 7.0% | intergenic (‑29/+36) | nisB/gdmA | Nisin biosynthesis protein NisB/Lantibiotic gallidermin |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1954795 = | 206 (0.670) | intergenic (‑57/+8) | nisB/gdmA | Nisin biosynthesis protein NisB/Lantibiotic gallidermin | |||||
CAAGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTATTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1954867‑1954767‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggctctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCT > USA300TCH1516_ALE/1954795‑1954884 aAAGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGG < 2:5207192/90‑1CAAGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGG < 1:4691833/91‑1CAAGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGG < 1:475270/91‑1CAAGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGG < 2:4973/91‑1 AAGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGG > 2:2434054/1‑91 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTACTAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC < 2:6783403/91‑1 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC < 1:5723286/91‑1 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC > 1:2884176/1‑91 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC < 2:137547/91‑1 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC < 1:278022/91‑1 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC < 2:2634542/91‑1 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC > 1:2256067/1‑91 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC < 1:3294519/91‑1 AGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGC < 1:3902520/91‑1 GTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCT < 1:557242/91‑1 GTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCT > 2:1317793/1‑91 TCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTTCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTC < 2:6471144/91‑1 TCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTC < 1:4173163/91‑1 TCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTC < 1:1948553/91‑1 TCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTC > 1:107555/1‑91 CATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCT > 2:1050436/1‑91 CATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCT > 1:6903640/1‑91 CATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCT > 1:6376597/1‑91 CATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCT > 2:5184796/1‑91 CATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCT > 1:1264953/1‑91 CATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCT > 1:1264916/1‑91 ATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAATACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTA < 2:5783818/91‑1 ATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTA > 1:5055954/1‑91 ATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTA > 1:4658487/1‑91 ATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTA < 2:80316/91‑1 ATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTA > 1:2272729/1‑91 ATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTA > 1:2132867/1‑91 TAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTAT < 1:1040200/91‑1 TAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTAT > 1:6482081/1‑91 TAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTAT > 1:3929508/1‑91 GTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTATTT > 1:4918648/1‑91 TTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTATTTG < 1:2912436/91‑1 TTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCGCTATTTG > 1:5545997/1‑91 TTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCACTATTTG > 1:5546250/1‑91 TTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAGCCCTTTCA‑GGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAG < 1:5888163/91‑1 TGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAGCCCTTTCA‑GGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGC < 1:3452344/91‑1 TGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGC < 1:1383124/91‑1 GCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAGCCCTTTCA‑GGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGA < 1:525027/91‑1 ACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAGCCCTTTCA‑GGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTAT < 1:4811258/91‑1 TAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGG < 2:489226/51‑1 TAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGG > 1:489226/1‑51 TAGTTTTAATAGCCTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGG > 1:490208/1‑51 TAGTTTTAATAGCCTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGG < 2:490208/51‑1 AG‑CCTGAAAGGGCTCTATTTGTTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGAC > 1:3032170/1‑91 G‑CCTGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACT > 1:5628767/1‑91 G‑CCTGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACT > 2:3313509/1‑91 CCTGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTT > 1:3360917/1‑91 CCTGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTT > 2:667672/1‑91 CCTGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTT > 1:1845030/1‑91 CCTGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTT > 1:2366571/1‑91 CCTGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTT > 2:2197595/1‑91 CCTGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATAAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTT > 2:6781802/1‑91 TGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGT > 1:5950138/1‑91 TGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGT > 2:4840435/1‑91 TGAAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACATGT > 1:6493048/1‑91 AAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAA > 1:3949152/1‑91 AAAGGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAA > 1:3945946/1‑91 GGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACG < 1:2992044/91‑1 GGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACG < 2:4654849/91‑1 GGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACG < 2:4654520/91‑1 GCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGT > 1:948161/1‑91 GCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGT > 2:768245/1‑91 GCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGT > 2:1970554/1‑91 GCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGT > 2:5460756/1‑91 GCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGT > 2:674657/1‑91 CTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTT > 1:2812969/1‑91 TCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTC > 2:4829799/1‑91 TCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTC < 1:2917646/91‑1 TCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTC > 1:494685/1‑91 TCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTC < 1:5601116/91‑1 TCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTC > 1:3230491/1‑91 TCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTC > 1:610783/1‑91 CTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACGAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCG < 2:4131147/91‑1 CTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCG < 2:1597501/91‑1 CTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCG > 1:411192/1‑91 CTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCG > 1:863226/1‑91 CTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCG > 1:566699/1‑91 CTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCG > 1:2165817/1‑91 CTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCG > 1:6665892/1‑91 CTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACAGAAACTATGACTTGTAATACGTTCG > 1:6630441/1‑91 TTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCA < 1:4210588/91‑1 TTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCAC < 2:5099101/91‑1 TTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCAC > 1:2091238/1‑91 TGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACC > 2:2628725/1‑91 TGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACC < 1:1975360/91‑1 TGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACC > 2:485679/1‑91 TGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACC < 2:3949152/91‑1 TGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACC < 2:3945946/91‑1 GCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCT > 1:6706962/1‑91 GCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCT > 1:767343/1‑91 GCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCT > 2:1260222/1‑91 GCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCT > 1:4315931/1‑91 CAAGTCATAGTTTATGTACTCCTGGTTGTGCTAAGACTGGTAGTTTTAATAGCTTCTGCTGTTAAGATTACAGCAAATAGAG‑CCTGAAAGGGCTCTATTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/1954867‑1954767‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggctctatttgCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCT > USA300TCH1516_ALE/1954795‑1954884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |