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ccTCGCTATCGTAAAAAAATTATTTTTGTAAAGTGAATATAAACGATAATCCACTGTTTTCAGTAATTCTAATTGATTCAATATCATCTTGCTCAAGCGTTTGATATGGTATTTCCACTTCATCTAAGCGCGATTTCGCtt > 1:619830/1‑141 (MQ=255) cGCTATCGTAAAAAAATTATTTTTGTAAAGTGAATATAAACGATAATCCACTGTTTTCAGTAATTCTAATTGATTCAATATCATCTTGCTCAAGCGTTTGATATGGTATTTCCACTTCATCTAAGCGCGATTTCGCTTGAt > 1:493578/1‑141 (MQ=255) cGCTATCGTAAAAAAATTATTTTTGTAAAGTGAATATAAACGATAATCCACTGTTTTCAGTAATTCTAATTGATTCAATATCATCTTGCTCAAGCGTTTGATATGGTATTTCCACTTCATCTAAGCGCGATTTCGCTTGAt < 3:77293/141‑1 (MQ=255) | TCGTTGATAACATCATATTGTTTGCCAACCGTTAACATGTCAGAAACTGTAAATTTCTTTGCATCTGTATTAATGACTTCTACTTTCTTGATTGGTGTACGTTCTTTCCAAGTTTCATGTAACATAAATTTTGTCCTCGCTATCGTAAAAAAATTATTTTTGTAAAGTGAATATAAACGATAATCCACTGTTTTCAGTAATTCTAATTGATTCAATATCATCTTGCTCAAGCGTTTGATATGGTATTTCCACTTCATCTAAGCGCGATTTCGCTTGAT > USA300TCH1516_ALE/1448299‑1448576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |