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aCCGCGATTAGAAAGTAAACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAATGCATCATTATGTATACTCAAATa > 1:383148/1‑141 (MQ=255) gcgATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATTTTACCATTAAATTGGCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGc > 3:109808/1‑141 (MQ=255) gcgATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGc < 4:49171/141‑1 (MQ=255) cgATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCa < 3:225150/141‑1 (MQ=255) gATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCAt > 4:291508/1‑141 (MQ=255) gATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCAt < 2:776682/141‑1 (MQ=255) aTTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATc < 3:74630/141‑1 (MQ=255) tAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGc < 3:218142/141‑1 (MQ=255) gAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGCCt > 4:251884/1‑141 (MQ=255) gAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGCCt < 2:312523/141‑1 (MQ=255) tAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGCCTTTGat < 1:399576/141‑1 (MQ=255) | AATTTGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGCCTTTGAT > USA300TCH1516_ALE/1740248‑1740526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |