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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 2,848,983 | 0 | C | T | 5.1% | 472.0 / 7.0 | 147 | intergenic (‑169/‑72) | USA300HOU_RS14590/moeZ_3 | Lactonase drp35/putative adenylyltransferase/sulfurtransferase MoeZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (73/65); new base T (2/6); total (75/72) | |||||||||||
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Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
ACTATCAATTTTATTTTAAACAAGATAACTATCAAATAAAATGATAACGGTTTCATCTATCTATTTTATCGGTCTAGTGGCTGATTTCAAGCTAGAAATATTGAATGACAATACAACTCTGTTAAAATGATGGACGTAGACAAATATGCGTATTGACGCTTTATTTT‑AAAAATTAACATGCTTATAACATGTTTATAGAAGGAGATTAACCTATGAACTATCAAGTTCTTTTATATTATAAATATATGACGATTGATGACCCTGAACAGTTTGCTCAGGA > USA300TCH1516_ALE/2848843‑2849122 | aTCAATTTTATTTTAAACAAGATAACTATCAAATAAAATGATAACGGTTTCATCTATCTATTTTATCGGTCTAGTGGCTGATTTCAAGCTAGAAATATTGAATGACAATACAACTCTGTTAAAATGATGGACGTAGACaaa > 1:386061/1‑141 (MQ=255) tCAATTTTATTTTAAACAAGATAACTATCAAATAAAATGATAACGGTTTCATCTATCTATTTTATCGGTCTAGTGGCTGATTTCAAGCTAGAAATATTGAATGACAATACAACTCTGTTAAAATGATGGACGTAGACAAat < 3:15318/141‑1 (MQ=255) ttttattttaAACAAGATAACTATCAAATAAAATGATAACGGTTTCATCTATCTATTTTATCGGTCTAGTGGCTGATTTCAAGCTAGAAATATTGAATGACAATACAACTCTGTTAAAATGATGGACGTAGACAAATATgg > 2:83864/1‑140 (MQ=255) tttaAACAAGATAACTATCAAATAAAATGATAACGGTTTCATCTATCTATTTTATCGGTCTAGTGGCTGATTTCAAGCTAGAAATATTGAATGACAATACAACTCTGTTAAAATGATGGACGTAGACAAATATGCGTATTg > 4:260782/1‑141 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |