| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 4399 | 166 (0.990) | 6 (0.010) | 6/238 | NT | 0.97% | intergenic (+364/‑101) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0006/cadR | hypothetical protein/cadmium binding protein |
| ? | NC_012417 | = 1963 | 1068 (0.940) | intergenic (+196/+130) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1315 total aligned reads displayed.
TTCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACC > NC_012417/1823‑2103 | ttCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGagaa > 2:71604/1‑141 (MQ=255)ttCCTATTGGTGCTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGCTGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGCCGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTCATTTTGagaa > 2:482174/1‑141 (MQ=255) tCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAg > 1:685554‑M2/1‑140 (MQ=255) tCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTCTCTATGAATATGATGCTTTTGTTTATATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAg > 1:492683‑M2/1‑140 (MQ=255) ccTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAga > 1:459799‑M2/1‑139 (MQ=255) tATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTTTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGGCGAGATGGAAGAAAAATATTATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGAAGACGAATTTATTCCAAGAAAACTTAATTATTTTTAGAAGAAc > 2:672502/1‑141 (MQ=255) tGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTGTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAgaaccct > 2:18708‑M2/1‑134 (MQ=255) gttgttGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAgaacccttaac < 2:416425‑M2/141‑12 (MQ=255) gttgttGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAgaacccttaac > 1:614156‑M2/1‑130 (MQ=255) gttgttGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACAAGATGGCAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTTATTTTGAGATtaacccttaac < 1:780961‑M2/141‑12 (MQ=255) gttgttGCTTACTTTTTATTTTTCTGTTGGGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAACTTATTGATGTTGAGAAgaacccttaac < 2:684139‑M2/141‑12 (MQ=255) gttgttGCTTACGCTTTGTTTTTCTATAAAGATGAGGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGGCGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAgaacccttaac > 2:70072‑M2/1‑130 (MQ=255) ttgttgCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGTTGGAAGAAAAATATGATTACCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACt > 1:579004/1‑141 (MQ=255) ttgttgCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACt > 1:593006/1‑141 (MQ=255) ttgCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATACCGAGAAAATTTATTGATGTTGCGCAGAACCCTTCACTaaa > 2:774369/1‑141 (MQ=255) cTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGATGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGTAGAACCCTTAACTAAAGtt > 2:22050/1‑141 (MQ=255) cTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAACTTTATCGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACtt > 2:381543/1‑141 (MQ=255) aCTTTTTGTTTTTATATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATAATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCa > 2:635905/1‑141 (MQ=255) ttttttttttTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGa < 1:652455/141‑1 (MQ=255) ttttaattttATATAAAGATGATGCTTTTAACGAGATTGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAc < 2:532472/135‑1 (MQ=37) ttttGTTTTTCTATAAAGATGCTGCTTTTGATGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAc < 2:583873/141‑1 (MQ=255) ttGTTTTATTACAAAAATTATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGa < 2:731559/141‑1 (MQ=37) gTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTATCTAAACTTCTAGACGAAt > 2:549136/1‑141 (MQ=255) ttttCTAAAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGt < 1:674712/141‑1 (MQ=255) ttCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCg > 1:737264/1‑141 (MQ=255) tCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCgg > 2:613171/1‑141 (MQ=255) ataAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCAt > 1:240066/1‑141 (MQ=255) ataAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCAt < 2:136399/141‑1 (MQ=255) ataAAGATGATGCTTCTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCAt < 1:287758/141‑1 (MQ=255) ataAAGATGATGATTTTGAAGAGATGAAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCAt < 2:496576/141‑1 (MQ=255) ataAAGATGATGATTTGGACGAGATTGATGAATAATAATATTATCATGAATATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTTAGAAGAACCCTTAACTAACCTTGCAGACGAATGTCGGCAt < 2:180191/141‑1 (MQ=21) tgatgCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACAACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTCATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACAAATGTCGGCACAGCGtta > 2:560854/1‑139 (MQ=255) atgCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGc > 1:268538/1‑141 (MQ=255) tgCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCt > 1:40525/1‑141 (MQ=255) gCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGCGCTa > 2:121492/1‑141 (MQ=255) cTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTAGCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTAt < 1:189670/141‑1 (MQ=255) tttGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTa > 1:374635/1‑141 (MQ=255) aCGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCTTGAGCTATTAATcc > 2:150735/1‑141 (MQ=255) cGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCg > 1:628652/1‑141 (MQ=255) gaTGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGAcc > 2:320718/1‑141 (MQ=255) tGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCAt < 1:751267/141‑1 (MQ=255) agaaAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCCTGAGCTATTAAGCCGAACATACGa > 2:444447/1‑141 (MQ=255) agaaAAAGATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGa < 2:372442/141‑1 (MQ=255) aaaaaTATGATTATCATGACGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAACTTATCCATGCTGAGAAGAACCCTTCACTAAACTTGCAGACGAATGTCAGCATAGAATAAGCTATACAGCCGACCATTcaaga > 2:357550/1‑137 (MQ=18) aaaaaTATGATCATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACa < 1:438899/141‑1 (MQ=255) aaaaaCATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACa < 1:90736/141‑1 (MQ=255) aaaaTATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACaa < 1:12051/141‑1 (MQ=255) aaaTATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAg > 1:100601/1‑141 (MQ=255) aaaTATGATTATCATAAAGAAAATAAAAAATAGACGAAGCATTTATGAAGAGAAACAATATTGATGTTAAGATGAACTACTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGTAAAGCCTGCGGGGTGGTGCCGACCATTCGACAAg < 2:203280/141‑1 (MQ=12) atatGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGtt < 1:641577/141‑1 (MQ=255) tatGATTATCATGAAGATAATAAAAAATTCGCCAATTATTAATGCAGAGACATTTTGTTGATTTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGttt < 1:696064/141‑1 (MQ=14) tatGATTATCATGAAAATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCAGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGttt < 1:483210/141‑1 (MQ=255) atGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGtttt > 1:72556/1‑141 (MQ=255) atGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGtttt < 1:765246/141‑1 (MQ=255) atGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAACTATTACGCCGACCATACCACAAgctat > 1:423127/1‑137 (MQ=18) atGAGTATTCTGAAGAGAAAAAAAAATAGACGACGGATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAATCTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGACCTATTAAGCCGACCATTTGACAAGtttt < 2:311173/141‑1 (MQ=14) aaTTATCATAAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTgg < 1:359066/140‑1 (MQ=255) ttATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAgaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtt > 1:305929‑M2/1‑65 (MQ=255) taatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTCAGCCGACCATTCGCCAAGTTTTGGGATTg < 2:653424‑M1/96‑1 (MQ=255) aatataataAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAg < 2:599736/138‑1 (MQ=255) aGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAgg > 2:393205/1‑141 (MQ=255) aGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAACAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAgg < 1:161417/141‑1 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTcc < 2:25899/141‑1 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTcc > 2:518860/1‑141 (MQ=255) ataaAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTcc > 2:158200/1‑141 (MQ=255) taaAAAATACAGTACGCATTAATGCCAACAAAATTTAATGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCg < 1:341837/141‑1 (MQ=11) aaaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGa > 1:135954/1‑141 (MQ=255) aaaaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTGAAGGGTTccaa > 1:602489/1‑139 (MQ=255) aaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGCTGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCGATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAgg > 1:542729/1‑141 (MQ=255) aaaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGCAAGGCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGCTAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAgg < 2:431161/141‑1 (MQ=14) aaaTAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGc < 1:396009/141‑1 (MQ=38) tAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCa > 1:526135/1‑141 (MQ=38) gatgaagCAGTTATGCCAAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAAc < 2:82878/135‑1 (MQ=255) gacgacGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAAc > 1:666037/1‑141 (MQ=35) acgacgCAGTTATGCCGAGAAAAGTGATTGAGGTTGAGAAGATCCCTGAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACg < 2:230047/141‑1 (MQ=11) tgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAAGCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGt < 2:749774/140‑1 (MQ=17) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGGTCCGAGGCTCAACGt > 1:516644/1‑141 (MQ=21) cgacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTCTTCGGATTGTTATGGTTCTCGAGGCTCAACGt > 2:467679/1‑141 (MQ=11) gacgCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTATTGGGATTGTTAAGGGTTCCCCGGCTCAACGTc > 2:290471/1‑141 (MQ=16) ggCATTTATGACGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCaa < 1:383162/140‑1 (MQ=17) gCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAAt < 2:334479/141‑1 (MQ=32) tttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGCGAAGAACCCTTAACAAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTAGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGtcaatcaa > 2:300623/1‑141 (MQ=255) ttATGGCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAg < 1:714357/141‑1 (MQ=17) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCGATAAAg > 1:259882/1‑141 (MQ=17) ttATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAg < 1:4487/141‑1 (MQ=32) tATGGCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGc < 2:110407/141‑1 (MQ=17) tATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGc < 1:31688/141‑1 (MQ=32) aTGCCGAGAAAATTCATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCa < 1:327558/141‑1 (MQ=17) gCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAAt < 1:15184/141‑1 (MQ=32) ccGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAAtt > 2:762182/1‑141 (MQ=32) agagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTg < 2:404274/140‑1 (MQ=17) gagaAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTgg < 1:468021/141‑1 (MQ=32) GATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTAGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATc > 1:559868‑M1/1‑141 (MQ=255) ATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCt > 1:173008‑M1/1‑141 (MQ=255) tGTTGAGAATAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa < 1:202843/141‑1 (MQ=37) tGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCCACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTa < 1:217332/141‑1 (MQ=37) ttGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATTGCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa < 1:508837/141‑1 (MQ=255) ttGAGAAGAACCCTTAACGAAAGTTACAGACGAATGGCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTaaa < 2:274703/141‑1 (MQ=255) tGAGAAGAACCCTTAAATAAATTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAg < 2:455375/141‑1 (MQ=255) agaagaACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGAGCATACGACAAGTTTTGGGAATGTTAAGGGTTCAAAGGCTCAACGTCACTAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTCAAGTa > 2:248862/1‑141 (MQ=14) | TTCCTATTGGTGTTGTTGCTTACTTTTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACC > NC_012417/1823‑2103 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |