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Only 100 of 1141 total aligned reads displayed.
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ggCTCAATGTCAAT‑‑AAAGTAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAAGCTGTATTTAAGA‑T‑TACATAGTACAATCTTCGAAACCATAGTAGTTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTg < 2:8152/141‑1 (MQ=255) ggCTCAACGTCAAT‑‑AAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA‑T‑TACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAAttttataa > 2:665761/1‑137 (MQ=255) ggCTCAACGTCAAT‑‑AAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA‑T‑TACATTGTACATCCTTCGAAACAAAAGTAGTTGCGATTCCAGCTCGTTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAAttttttcg > 2:275799/1‑139 (MQ=255) ggCTCAACGTCAAT‑‑AAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA‑T‑TACATTGTACATCCCTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTCGCTAATTTTTTTg > 2:222746/1‑141 (MQ=255) gCTCAACGTCAAT‑‑AAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA‑T‑TACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGc < 2:687114/141‑1 (MQ=255) 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ataaaGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA‑T‑TACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTa < 1:290471‑M2/136‑1 (MQ=255) aaaGCAATTGGGATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA‑T‑TACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTATTTTTTTTGCTACGCCCTTTAAg > 1:386782‑M2/4‑141 (MQ=255) aaGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA‑T‑TACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGt < 1:157778‑M2/139‑1 (MQ=255) | TTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAAT‑‑AAAGCAATTGGAATAAATAGTATCTAAAGTAACCCGTATTTAAGA‑T‑TACATTGTACATCCTTCGAAACCATAGTAGCTGCGATTCCAGCTAGGTTTCCTTTTATCCCAATTTTAGCTAATTTTTTTGCTACGCCCTTTAAGTTT > NC_012417/1933‑2213 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |