| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1525192 = | 117 (0.910) | 6 (0.050) | 6/232 | NT | 5.6% | intergenic (‑265/+57) | asnS/dnaQ | asparagine‑‑tRNA ligase/DNA‑directed DNA polymerase III epsilon subunit |
| ? | CP000730 | 1525239 = | 95 (0.810) | intergenic (‑312/+10) | asnS/dnaQ | asparagine‑‑tRNA ligase/DNA‑directed DNA polymerase III epsilon subunit | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ACATTAATTTATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATTTCACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCAAGTGT > CP000730/1525052‑1525332 | aCATTAATTTATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCATGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACcaaacaa < 1:1198572/141‑1 (MQ=255) gatgatcgactcataaacagtaattataaaaacttttttgaacaaacacttgaaaattatcgtcagaaaaaaggcgacattcaacagtttggaaaattattaagacaaattcaaaaaaagaaaaagtgaaatacaaagtaa > 1:1591692‑M1/140‑141 (MQ=255) cATTAATTTATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACcaaacaaa < 2:1382143/141‑1 (MQ=255) ataaacaaaacaaaaacagtaattataaaaacttttttaaacaaacacttgaaaaatatcatcagaaaaaaggcgacattcaacagtttggaaaattattaagacaaattcaaaaaaagaaaaagtgaaatacaaagtaaa > 2:1470843‑M1/139‑141 (MQ=255) aTTAATTTATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACaaaa > 1:8911/1‑141 (MQ=255) tgatcgactcataaacagtaattataaaaacttttttgaacaaacacttgaaaattatcgtcagaaaaaaggcgacattcaacagtttggaaaattattaagacaaattcaaaaaaagaaaaagtgaaatacaaagtaaaa > 1:554075‑M1/138‑141 (MQ=255) atcgactcataaacagtaattataaaaacatttttgaacaaacacttgaaaattatcgtcagaaaaaaggcgacattcaacagtttggaaaattattaagacaaattcaaaaaaagaaaaagtgaaatacaaagtAAAAtt > 2:620695‑M1/136‑141 (MQ=255) atcaactcaaaaacagaaataataaaaacttttttaaacaaacacttgaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggcgacattcaacagtttggaaaattattaagacaaattcaaaaaaagaaaaagtgaaatacaaagtAAAAtt > 2:202237‑M1/136‑141 (MQ=255) aTTTATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTc < 1:1178349/141‑1 (MQ=255) tttATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTTCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTGTACGACCAAACAACAATTCt > 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ctcataaacagtaattataaaaacttttttgaacaaacacttgaaaattatcgtcagaaaaaaggcgacattcaacagtttggaaaattattaagacaaattcaaaaaaagaaaaagtgaaatacaaagtAAAATTCTTGt < 2:1265642‑M1/11‑1 (MQ=255) aaGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAg > 1:737614/1‑141 (MQ=255) aaGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAg > 1:283146/1‑141 (MQ=255) acaatacaatCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAAc < 1:1377343/141‑1 (MQ=255) caatCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCACATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGca > 1:1164351/1‑141 (MQ=255) atcatcAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGcaca < 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(MQ=255) aacaaaAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATTTCACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCaa < 1:200213/141‑1 (MQ=255) aacaaaAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATTTCACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCaa < 1:782081/141‑1 (MQ=255) AAAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATTTCACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCAAgtgt < 1:1252771‑M1/141‑1 (MQ=255) | ACATTAATTTATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATTTCACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCAAGTGT > CP000730/1525052‑1525332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |