| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2716742 = | 119 (0.920) | 10 (0.080) | 10/232 | NT | 7.9% | intergenic (+50/+100) | ynzC/USA300HOU_2569 | hypothetical protein/possible lactoylglutatione lyase |
| ? | CP000730 | 2716816 = | 123 (1.040) | intergenic (+124/+26) | ynzC/USA300HOU_2569 | hypothetical protein/possible lactoylglutatione lyase | |||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
CACAATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATCAAGATCTT > CP000730/2716602‑2716882 | cacaATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACA < 1:424115‑M1/141‑1 (MQ=255)cacaATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACA > 2:1231885‑M1/1‑141 (MQ=255)cacaATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACA > 2:94125‑M1/1‑141 (MQ=255)cacaATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACA < 1:1066427‑M1/141‑1 (MQ=255) acaATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAA < 2:623344‑M1/141‑1 (MQ=255) acaATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAA < 1:1514815‑M1/141‑1 (MQ=255) agtgaaagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaaaa > 1:1447109‑M1/139‑141 (MQ=255) gtgaaagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAg < 2:275623‑M1/4‑1 (MQ=255) tgaaagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGc > 1:688132‑M1/137‑141 (MQ=255) tAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCC < 2:350548‑M1/141‑1 (MQ=255) gaaagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGcc > 2:1292163‑M1/136‑141 (MQ=255) gaaagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGcc > 1:1247681‑M1/136‑141 (MQ=255) aaagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGccc < 2:708073‑M1/7‑1 (MQ=255) aagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagattttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGCCCa < 2:1354138‑M1/8‑1 (MQ=255) aagaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGCCCa > 1:27290‑M1/134‑141 (MQ=255) aaGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCAT > 1:359151‑M1/1‑141 (MQ=255) gaagcgggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGCCCATa < 2:314053‑M1/10‑1 (MQ=255) aGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATA < 1:621260‑M1/141‑1 (MQ=255) gTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATAC > 1:165429‑M1/1‑141 (MQ=255) gTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATAC > 1:57425‑M1/1‑141 (MQ=255) tGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACt < 2:1071851/141‑1 (MQ=255) ggTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTg < 1:1305175/141‑1 (MQ=255) ggTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTg > 1:1462130/1‑141 (MQ=255) ggTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTg > 1:914996/1‑141 (MQ=255) ggtggcacagtcgttcaagaaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGCCCATACTGAtt < 2:1062524‑M1/16‑1 (MQ=255) aaTCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATAGGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCATGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATGGAAGaa > 1:198882/1‑140 (MQ=255) aTCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGaca > 1:1352964/1‑141 (MQ=255) tCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGacac < 1:817402/141‑1 (MQ=255) tCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGacac > 1:325403/1‑141 (MQ=255) gTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTaa > 2:828541/1‑141 (MQ=255) gATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATgtgt > 2:1469696/1‑141 (MQ=255) aTGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTc > 1:268720/1‑141 (MQ=255) gTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGc < 1:499656/141‑1 (MQ=255) gTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGc < 2:1520812/141‑1 (MQ=255) gTCACACCAGATAAAGCATATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGc < 1:434559/141‑1 (MQ=255) aaccaacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagcataaataaAAAGCNCATACTGATTGANGACACTAATGTGTCGc > 1:954916‑M1/107‑141 (MQ=255) tCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGATGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCa < 2:715083/141‑1 (MQ=255) tCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCa < 1:1588428/141‑1 (MQ=255) tCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCa > 1:1053107/1‑141 (MQ=255) tCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCa > 2:959011/1‑141 (MQ=255) tCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCa < 1:1566924/141‑1 (MQ=255) cacaCCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTGAAAATTCATATTTGCTCCCGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACAGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGCAGACACTAAAGTGTCGCAc > 1:131954/1‑141 (MQ=255) caacagtaagccaagggttttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaataaAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCAcc > 1:658873‑M1/104‑141 (MQ=255) tAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATAATCAAAACTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCGCTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGca > 1:1426245/1‑141 (MQ=255) aaGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTGATATTCAAAATTAATATTTGCGCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACGAATGTGTCGCACCATGGTGcaca > 2:157710/1‑141 (MQ=255) gTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGATACATACAACATTAATATTTCCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGTCCTCATAAACAAAGCCGATGCTGCTTGAAGACAGTCATGTGTCGCACCaacatgcgcagg > 2:143155/1‑130 (MQ=255) tttatggagcaatgttcaaagatcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataaacaaA‑‑GCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGc < 2:1567323‑M1/52‑1 (MQ=255) cTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCAt > 2:88705/1‑141 (MQ=255) ttCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACagagatgaagcgtaatgtgcaccatggtgcgacacattagtgtcttcaa < 2:972383‑M1/141‑50 (MQ=255) cGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACagagatgaagcgtaatgtgcaccatggtgcgacacattagtgtcttcaatc < 1:482514‑M1/141‑52 (MQ=255) cGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCAtctc < 2:751415/141‑1 (MQ=255) caacaaTACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTgt > 1:1570682‑M2/1‑139 (MQ=255) acaaTACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTgtat > 1:819008‑M2/1‑137 (MQ=255) acaaTACGGGTATATNCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTgtat < 2:458309‑M2/141‑5 (MQ=255) aaTACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTgtatgg > 2:1097726‑M2/1‑135 (MQ=255) tACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTgtatgggc > 1:1466837‑M2/1‑133 (MQ=255) aCGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTgtatgggct < 2:1607635‑M2/141‑10 (MQ=255) cGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTgtatgggctt < 1:1007733‑M2/141‑11 (MQ=255) ggTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTgtatgggcttt > 2:716269‑M2/1‑130 (MQ=255) gTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGATCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCtttt < 1:524925/141‑1 (MQ=255) atcttgatggacaccattttaattttttggtctgctaaaatgaaattctcaaaagaataactaaAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTttta > 1:1159425‑M1/65‑141 (MQ=255) atatTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTtttat < 2:588657/141‑1 (MQ=255) tatTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTTGAACCACTGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTtttatt < 1:1621176/141‑1 (MQ=255) tatTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTtttatt < 1:1522052/141‑1 (MQ=255) tatTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTtttatt < 2:1038475/141‑1 (MQ=255) tatTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTtttatt < 2:1656734/141‑1 (MQ=255) atatTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCCCCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTgag > 1:1650264/1‑141 (MQ=255) atatTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACCCTTCATCTCTGTATGCGCTTTTTATTTCTTATTTTaag > 2:433241/1‑141 (MQ=255) tatTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTgaga > 2:619846/1‑141 (MQ=255) tatTTGCGCGCGCGGCTTTGCACTTGGGATGCCAACTGACCTCATCAACAAAGCCCATCCTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTCTGGGCTTTTTATTTATTCTTTTgaga < 2:67258/141‑1 (MQ=255) atTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGaa < 2:487463/141‑1 (MQ=255) ttGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAAtt < 1:542371/141‑1 (MQ=255) ttGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAAtt > 2:116636/1‑141 (MQ=255) cACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCAtt > 1:1138200/1‑141 (MQ=255) aCGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTtttatt < 1:1630618/119‑1 (MQ=255) cGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCACGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCAtttt > 2:597115/1‑141 (MQ=255) gAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGACTTTCATTTTa > 1:870192/1‑141 (MQ=255) gAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTa > 1:961434/1‑141 (MQ=255) ggTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGc > 1:1190785/1‑141 (MQ=255) gTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCACATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGCATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGACTTTCATCTTAGCa > 2:1424226/1‑141 (MQ=255) aTTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGa > 2:1167715/1‑141 (MQ=255) aaGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAAt < 1:94125/141‑1 (MQ=255) aGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAAtt < 1:728211/141‑1 (MQ=255) aGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCCCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATCTCATTTTAGCAGACCAAAAAAtt > 2:936252/1‑141 (MQ=255) ggTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTa > 1:770515/1‑141 (MQ=255) gTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTtttatt > 1:1025491/1‑100 (MQ=255) gTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTaa > 2:1641731/1‑141 (MQ=255) gTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTaa < 1:666695/141‑1 (MQ=255) aCTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGgt > 2:1372167/1‑141 (MQ=255) gACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTc > 1:1497054/1‑141 (MQ=255) ccTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCa > 1:399164/1‑141 (MQ=255) ccTCAAAAACAAAGACCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCATCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCTTTTAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATGGTGTCCa < 2:1623179/141‑1 (MQ=255) cTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCAt < 1:802875/141‑1 (MQ=255) tCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATc > 1:1419511/1‑141 (MQ=255) tCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATc < 1:796039/141‑1 (MQ=255) aCAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATCAAGATc < 1:127807/141‑1 (MQ=255) cAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATCAAGATCt > 2:553473/1‑141 (MQ=255) aaaGCCCATACagagatgaagcgtaatgtgcaccatggtgcgacacattagtgtcttcaatcagtatgggctttgtttatgaggtcagttggcaccttaagtgcaatacctcgtgagcaaatattaattttgaatataacc < 2:432012‑M1/141‑131 (MQ=255) AAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATCAAGATCtt < 1:1358262‑M1/141‑1 (MQ=255) AAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATCAAGATCtt > 1:1329421‑M1/1‑141 (MQ=255) | CACAATAAAAGTGGTTGATCCAATCGGTCAGGATGTCACACCAGATAAAGTTTATGATCTTCGCCAACAATACGGTTATATTCAAAATTAATATTTGCTCACGAGGTATTGCACTTAAGGTGCCAACTGACCTCATAAACAAAGCCCATACTGATTGAAGACACTAATGTGTCGCACCATGGTGCACATTACGCTTCATCTCTGTATGGGCTTTTTATTTATTCTTTTGAGAATTTCATTTTAGCAGACCAAAAAATTAAAATGGTGTCCATCAAGATCTT > CP000730/2716602‑2716882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |