| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | 190627 = | 111 (0.860) | 6 (0.050) | 6/232 | NT | 5.8% | intergenic (+3/+62) | cap5P/isdG1 | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5P/heme‑degrading enzyme IsdG |
| ? | CP000730 | 190682 = | 94 (0.800) | intergenic (+58/+7) | cap5P/isdG1 | capsular polysaccharide biosynthesis protein Cap5P/heme‑degrading enzyme IsdG | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GACGTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTCAACCAA > CP000730/190542‑190821 | cgTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAat > 2:1242735/1‑141 (MQ=255) cgTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAat > 2:1462309/1‑141 (MQ=255) cgTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAat > 2:357280/1‑141 (MQ=255) cgTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAat > 2:382723/1‑141 (MQ=255) cgTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTGTTAat > 2:219987/1‑141 (MQ=255) tATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAatat < 1:696333/141‑1 (MQ=255) ttGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAATCCTGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATAtatt < 1:436487/141‑1 (MQ=255) ttGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATAtatt > 2:638784/1‑141 (MQ=255) tgtgAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTCGGGGGTTTTAATAtattt > 2:509972/1‑141 (MQ=255) gCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTAttttt > 2:1432529/1‑141 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aTTGCACACAGATAATCCTGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCa < 2:895718/141‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCat < 1:1361963/141‑1 (MQ=255) gcgcACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGATTTTTAATATATTTATTTTTTAGAGTGGTAGCCAATATCatat > 2:593569/1‑141 (MQ=255) tttacaGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATAtt > 2:368176/4‑141 (MQ=255) cgcACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATAtt > 1:409087/1‑141 (MQ=255) cgcACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATAtt > 2:1008942/1‑141 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aggggtttttAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGaa < 2:239127‑M2/131‑1 (MQ=255) ggggtttttAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAAt < 1:368387‑M2/132‑1 (MQ=255) ggtttttAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTc < 2:457738‑M2/134‑1 (MQ=255) ggttttgAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCAGATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTc < 2:1582483‑M2/134‑1 (MQ=255) tttttAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTTCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTCaa > 2:1508392‑M2/6‑141 (MQ=255) ttAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTCAACCa < 2:552981‑M2/139‑1 (MQ=255) ttAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTCAACCa > 1:1239631‑M2/3‑141 (MQ=255) tAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTCAACCaa < 2:1077155‑M2/140‑1 (MQ=255) tAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTCAACCaa < 1:7467‑M2/140‑1 (MQ=255) | GACGTATTTGTGAAGCAATAGAATATTATTTTGGATTGCGCACAGACAAGCCGGATGAATTCGTACCTTTACGTCACAAATAATAAAAAACCCCTAATCATGAAGTTGGTTTAGACAACCAGCGGTGACTAGGGGTTTTTAATATATTTATTTTTGATAGTGGTAGCCAATATCATATTTGAATACTTTATTTGATAATATTGGACTTTGCTGTCCATCGTCATCACTTTTTAAACGTACATTTTTATGAGCTTCTTTAAATACATCGGAATTCAACCAA > CP000730/190542‑190821 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |