| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1555341 | 108 (0.840) | 6 (0.050) | 4/234 | NT | 5.2% | intergenic (+37/+69) | fer/ribU | ferredoxin/hypothetical membrane protein |
| ? | CP000730 | = 1555365 | 119 (1.000) | intergenic (+61/+45) | fer/ribU | ferredoxin/hypothetical membrane protein | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
ATGCAATTGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATATTGAATGGTATAATTCC > CP000730/1555225‑1555505 | tGCAATTGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAACTTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAc < 1:246908‑M2/141‑2 (MQ=255) gCAATTGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcc > 2:890279‑M2/1‑139 (MQ=255) gCAATTGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcc > 1:453329‑M2/1‑139 (MQ=255) gCAATTGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcc < 1:537378‑M2/141‑3 (MQ=255) aTTGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcctgc < 2:1458935‑M2/141‑6 (MQ=255) aTTGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcctgc > 1:905197‑M2/1‑136 (MQ=255) tGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcctgctt > 1:195306‑M2/1‑134 (MQ=255) gatggatgCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcctgcttt > 1:1521967‑M2/1‑133 (MQ=255) atggatgCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGTTATCGTTTATTGATAGTCAcctgctttt > 1:1131420‑M2/1‑132 (MQ=255) cccTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttattatt > 1:138792/1‑141 (MQ=255) cccTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttattatt > 2:207996/1‑141 (MQ=255) aGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATgtgt > 1:704046/1‑141 (MQ=255) gATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGta > 1:906365/1‑141 (MQ=255) gATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGta < 2:664507/141‑1 (MQ=255) tATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTAtatta > 1:1188767/1‑141 (MQ=255) tATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTAtatta > 1:1516808/1‑141 (MQ=255) aaaTTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTg > 1:1103135/1‑141 (MQ=255) aaaTTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTg < 1:279567/141‑1 (MQ=255) aaaTTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTg > 1:1039395/1‑141 (MQ=255) aaTTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTAAAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGc < 2:1413961/141‑1 (MQ=255) aTTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCt < 2:698994/141‑1 (MQ=255) aTTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCt < 2:1590181/141‑1 (MQ=255) tGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCttt > 1:304613/1‑141 (MQ=255) gCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTa > 2:1188023/1‑141 (MQ=255) cAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTaa < 2:928367/141‑1 (MQ=255) aGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAAt > 1:505307/1‑141 (MQ=255) aaTCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGAt < 1:981102/141‑1 (MQ=255) tCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTa < 2:774385/141‑1 (MQ=255) cATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTGGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTaa < 2:1543447/141‑1 (MQ=255) cATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTaa < 2:1336692/141‑1 (MQ=255) atctgaactaaCGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAAt < 1:1600367/131‑1 (MQ=255) ttGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAAtt < 1:597413/141‑1 (MQ=255) ttGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAAtt > 2:1162507/1‑141 (MQ=255) ttGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAAtt < 1:741442/141‑1 (MQ=255) aTGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCtt > 1:623508/1‑141 (MQ=255) aTGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATAGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCtt > 2:880368/1‑141 (MQ=255) ggggACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCtttt > 2:1107918/1‑141 (MQ=255) ggggACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTTGTTAATTTTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCtttt > 2:176480/1‑141 (MQ=255) ggggACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGTTTAAATTCtttt > 2:293783/1‑141 (MQ=255) ggggACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCtttt < 2:216680/141‑1 (MQ=255) ggACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa < 2:611442/141‑1 (MQ=255) gACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCaa > 1:873408/1‑141 (MQ=255) gACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCGATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCaa < 1:1304333/141‑1 (MQ=255) gACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTCTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCaa < 1:1589268/141‑1 (MQ=255) cGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGa < 1:504219/141‑1 (MQ=255) cGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGa > 1:454827/1‑141 (MQ=255) gCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGaa > 1:353125/1‑141 (MQ=255) cTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGaaa > 2:536426/1‑141 (MQ=255) tAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTc > 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aTTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAg > 1:1334005/1‑141 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAACGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGt < 1:937988/141‑1 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTCATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGt < 2:155343/141‑1 (MQ=255) tttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTTTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGAAGGCCTTCTATATAGTa > 2:1311999/1‑141 (MQ=255) tttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTa < 2:1085929/141‑1 (MQ=255) ttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTaa < 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2:15033‑M2/1‑34 (MQ=255) aaGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGAt < 1:1646467/141‑1 (MQ=255) aGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcctgctttttctatagaacatttgtctaaaaaatcaattattcaaattttaaagcgtccccatcaaatgattcgtctgcaattttaatagaatctgtagggcatccatcaa < 1:1412979‑M2/141‑112 (MQ=255) aGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCAcctgctttttctatagaacatttgtctaaaaaatcaattattcaaattttaaagcgtccccatcaaatgattcgtctgcaattttaatagaatctgtagggcatccatcaa < 1:963037‑M2/141‑112 (MQ=255) gCAGGCGAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAACATAAATACAATAGAAATAACGATAc < 2:120181/141‑1 (MQ=255) gCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATAc > 2:1637767/1‑141 (MQ=255) aGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCt > 2:1106653/1‑141 (MQ=255) ggCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAAt < 2:393454/130‑1 (MQ=255) ggCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCtt > 1:295949/1‑141 (MQ=255) gCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGACATAACGATACCttt > 2:1152033/1‑141 (MQ=255) gCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCttt > 1:832877/1‑141 (MQ=255) aGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGTTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATTCCTTtaat < 2:421144/141‑1 (MQ=255) aGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTtaat < 1:536426/141‑1 (MQ=255) cTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTtaataa < 1:444543/141‑1 (MQ=255) tCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAatat < 2:28634/141‑1 (MQ=255) cGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATAtt > 1:1617260/1‑141 (MQ=255) tttATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATATTGa > 1:1173580/1‑141 (MQ=255) ttATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATa < 2:151867/118‑1 (MQ=255) ttGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATATTGAATgg < 2:881356/141‑1 (MQ=255) tGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATATTGAATGGt > 2:341129/1‑141 (MQ=255) tAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATATTGAATGGtata > 1:1413225/1‑141 (MQ=255) cACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATATTGAATGGTATAATTc < 2:77136/141‑1 (MQ=255) aCCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATATTGAATGGTATAATTcc < 2:1588731/141‑1 (MQ=255) | ATGCAATTGATGGATGCCCTACAGATTCTATTAAAATTGCAGACGAATCATTTGATGGGGACGCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGAAATAACGATACCTTTAATAATATTGAATGGTATAATTCC > CP000730/1555225‑1555505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |