| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,211,670 | 0 | C | A | 6.6% | 468.4 / 14.3 | 140 | intergenic (‑396/+150) | USA300HOU_2086/yidC | hypothetical protein/hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (79/51); new base A (6/3); total (85/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.55e-01 | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CATATACTGCTACACTGATGAATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTACTGCTGTTTCTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATTATCTTCAACTTTTAGGGTGCACATTATTTGGAC > CP000730/2211531‑2211810 | cacTGATGAATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAa‑tcatc > 1:368197/1‑141 (MQ=255) gatgaATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTAc < 1:798945/141‑1 (MQ=255) gatgaATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAAGATGA‑TTTCAAATGTGAAAGTCATCCTAc < 1:196976/141‑1 (MQ=37) atgaATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTAct < 2:1345105/141‑1 (MQ=255) 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acaTTTGAAA‑TCATCTTACTGCTGTTTCTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATTATCTTCAACTTTTAGGGTGCACATTATTTGGa > 2:499533/1‑141 (MQ=255) | CATATACTGCTACACTGATGAATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTACTGCTGTTTCTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATTATCTTCAACTTTTAGGGTGCACATTATTTGGAC > CP000730/2211531‑2211810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |