| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,211,673 | 0 | T | G | 6.2% | 466.4 / 20.0 | 144 | intergenic (‑399/+147) | USA300HOU_2086/yidC | hypothetical protein/hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (81/53); new base G (6/3); total (87/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
ATACTGCTACACTGATGAATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTACTGCTGTTTCTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATTATCTTCAACTTTTAGGGTGCACATTATTTGGACTT > CP000730/2211534‑2211812 | tGCTACACTGATGAATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGaaa < 1:714810/141‑1 (MQ=255) acacTGATGAATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAa‑tcat > 1:860191/1‑141 (MQ=255) cacTGATGAATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAa‑tcatc > 1:368197/1‑141 (MQ=255) atgaATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTAct < 2:1345105/141‑1 (MQ=255) 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2:1443319/1‑141 (MQ=255) taagatgatttCAAATGTGAAAGTCATCCTACTGCTGTTTCTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAATTTATCTTCAACTTTTAGGGTg > 1:1565532/9‑141 (MQ=37) aGGATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTACTGCTGTTTCTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATTATCTTCAACTTTTAGGGTGc < 2:845606/141‑1 (MQ=255) ggATGACTTTCACATATGAAA‑TCCTCAAACTGCTATTGCAACCTAACACATATTGGATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATTATCTTCAACTTTTAGGGTGca < 1:151300/141‑1 (MQ=255) gATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTACTGCTGTTTCTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATTATCTTCAACTTTTAGGGTGcac < 2:976376/141‑1 (MQ=255) gatgatttCAAATGTGAAAGTCATCCTACTGCTGTTTTTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATGATCTTCAACTTTTAGGGTGcac > 1:340743/6‑141 (MQ=37) 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1:1033790/1‑141 (MQ=255) | ATACTGCTACACTGATGAATCATTGTGTCAAGATGACATTGCGATGAAGAATGACAACTCTGTTATTAACCACTTTTTACATACTGAAAACTCGTTAATATTATTTCAAATAAAAACAGCAGTAGGATGACTTTCACATTTGAAA‑TCATCTTACTGCTGTTTCTATTTATCACATATTGTATAATGTGACACTAAGTTTCGCTATTGAAGCGAAAAATAATGTGCGCCCTATAAAGTTAAAATTATCTTCAACTTTTAGGGTGCACATTATTTGGACTT > CP000730/2211534‑2211812 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |