| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP000730 | 2,243,499 | 0 | T | A | 5.4% | 537.3 / 12.8 | 159 | intergenic (+77/+32) | USA300HOU_2114/pyrG | hypothetical protein/CTP synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (76/74); new base A (4/5); total (80/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
AATTATGTATACTATGACATTTATACACAAATGATTGAAATGACAAGAGACTTAGAATTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATACCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTA‑TTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGCGGACGATTTGGTCTAGATAAGAATTCTGGGTGGAATTGACAAGCAATAAAG > CP000730/2243360‑2243639 | aaTTATGTATACTATGACATTTATACACAAATGATTGAAATGACAAGAGACTTAGAATTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATACCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTa < 1:561703/141‑1 (MQ=255) aTGTATACTATGACATTTATACACAAATGATTGAAATGACAAGAGACTTAGAATTATAAAAGTCACTATTGTAATTTCATACCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCATTGTTAAACat < 2:1304714/141‑2 (MQ=255) tGTATACTATGACATTTATACACAAATGATTGAAATGACAAGAGACTTAGAATTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATACCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCATTGTTAAACatt < 2:919357/141‑3 (MQ=255) tGTATACTATGACATTTATACACAAATGATTGAAATGACAAGAGACTTAGAATTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATACCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAAt > 1:1360425/1‑141 (MQ=255) 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AATTATGTATACTATGACATTTATACACAAATGATTGAAATGACAAGAGACTTAGAATTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATACCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTA‑TTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGCGGACGATTTGGTCTAGATAAGAATTCTGGGTGGAATTGACAAGCAATAAAG > CP000730/2243360‑2243639 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |